121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3547 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3547  CdaR family transcriptional regulator  100 
 
 		 532 aa  1063    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1083  putative transcriptional regulator, PucR family  34.46 
 
 		 512 aa  225  1e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0076  transcriptional regulator, CdaR  32.47 
 
 		 611 aa  213  5.999999999999999e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.105438  normal  0.388356 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4027  hypothetical protein  29.18 
 
 		 554 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4102  hypothetical protein  29.18 
 
 		 554 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.471493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4257  hypothetical protein  29.18 
 
 		 554 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0586368 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11210  hypothetical protein  26.49 
 
 		 538 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4508  putative transcriptional regulator, PucR family  28.54 
 
 		 498 aa  124  5e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4527  hypothetical protein  26.83 
 
 		 525 aa  120  7e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.354978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1305  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  27.02 
 
 		 540 aa  114  4.0000000000000004e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5712  putative transcriptional regulator, PucR family  25.33 
 
 		 537 aa  112  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.857659  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2598  transcriptional regulator CdaR  24.18 
 
 		 511 aa  106  9e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2432  transcriptional regulator, CdaR  27.73 
 
 		 514 aa  102  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0322686 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2798  putative DNA-binding protein  25.94 
 
 		 530 aa  101  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.322592  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5234  putative DNA-binding protein  26.4 
 
 		 515 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.198671  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5322  putative DNA-binding protein  26.4 
 
 		 515 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.266784 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5614  putative DNA-binding protein  26.4 
 
 		 515 aa  98.6  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.3289 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4258  putative transcriptional regulator, PucR family  25.05 
 
 		 547 aa  92  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.484226  normal  0.267228 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5594  PucR family transcriptional regulator  20.24 
 
 		 410 aa  89.7  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3595  putative transcriptional regulator, PucR family  25.96 
 
 		 529 aa  87.8  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.15656  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23280  hypothetical protein  24.14 
 
 		 512 aa  87  7e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.122242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4779  putative DNA-binding protein  25 
 
 		 510 aa  84.3  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821414 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1946  putative DNA-binding protein  25.62 
 
 		 514 aa  80.1  0.00000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3379  putative transcriptional regulator, PucR family  21.02 
 
 		 412 aa  73.9  0.000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.670117  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4405  transcriptional regulator, CdaR  28.98 
 
 		 402 aa  69.7  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3511  putative transcriptional regulator, PucR family  22.08 
 
 		 411 aa  69.7  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3098  transcriptional regulator, CdaR  26.82 
 
 		 361 aa  68.6  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102834  normal  0.987358 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4880  putative transcriptional regulator, PucR family  23.96 
 
 		 522 aa  66.6  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.750606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1496  putative transcriptional regulator, PucR family  31.43 
 
 		 502 aa  66.6  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5270  putative transcriptional regulator, PucR family  26.82 
 
 		 522 aa  65.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.16716  normal  0.125763 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0645  transcriptional regulator, CdaR  24.81 
 
 		 383 aa  63.5  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.867737 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3335  PucR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 517 aa  62  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1512  transcriptional regulator CdaR  35.92 
 
 		 375 aa  59.7  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.428477  normal  0.947433 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3926  putative transcriptional regulator, PucR family  30.17 
 
 		 399 aa  59.3  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00603602 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1897  transcriptional regulator, CdaR  20.56 
 
 		 381 aa  58.2  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1045  transcriptional regulator, CdaR  21.69 
 
 		 350 aa  57  0.0000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00204704  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1802  transcriptional regulator, CdaR  22.87 
 
 		 364 aa  57  0.0000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000701672  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2908  transcriptional regulator, CdaR  41.54 
 
 		 359 aa  56.6  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 537 aa  55.1  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10300  regulator of polyketide synthase expression  46.15 
 
 		 413 aa  55.1  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.10355 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3106  transcriptional regulator, PucR family  52.08 
 
 		 618 aa  54.3  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.411475  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3619  PucR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 408 aa  54.7  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000689812 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3120  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  33.33 
 
 		 418 aa  54.3  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.550646  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1489  transcriptional regulator, PucR family  35.64 
 
 		 504 aa  53.5  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0802599 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3377  hypothetical protein  31.33 
 
 		 473 aa  53.5  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.541372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1019  transcriptional regulator, CdaR  22.06 
 
 		 371 aa  53.5  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1328  putative transcriptional regulator, PucR family  42.59 
 
 		 393 aa  52.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1861  CdaR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 361 aa  52.8  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0198483  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4896  transcriptional regulator, CdaR  34.09 
 
 		 616 aa  51.6  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1898  fis-type helix-turn-helix domain-containing protein  46.81 
 
 		 287 aa  51.6  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0263443  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1633  hypothetical protein  46.81 
 
 		 287 aa  51.6  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.256067  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06864  transcriptional regulator  39.58 
 
 		 376 aa  51.2  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2535  transcriptional regulator, PucR family  31.18 
 
 		 505 aa  51.2  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1795  helix-turn-helix, Fis-type  33.71 
 
 		 519 aa  50.8  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2351  CdaR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 390 aa  50.8  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000556727  normal  0.18392 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2723  putative transcriptional regulator, PucR family  30.94 
 
 		 429 aa  50.8  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1808  putative transcriptional regulator, PucR family  44.07 
 
 		 397 aa  50.8  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.583872  normal  0.0100346 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 552 aa  50.1  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  28.4 
 
 		 558 aa  50.1  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6808  putative transcriptional regulator, PucR family  29.86 
 
 		 421 aa  50.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3363  hypothetical protein  32.26 
 
 		 428 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.20255  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3425  hypothetical protein  32.26 
 
 		 428 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.435185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3753  hypothetical protein  31.45 
 
 		 428 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.144369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3374  hypothetical protein  32.26 
 
 		 428 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.238884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2100  fis-type helix-turn-helix domain protein  43.48 
 
 		 287 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.147633  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0948  transcriptional regulator, CdaR  41.67 
 
 		 436 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.640596  normal  0.171254 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6672  putative transcriptional regulator, PucR family  41.54 
 
 		 520 aa  49.3  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255343  normal  0.214426 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000884  sugar diacid utilization regulator SdaR  39.58 
 
 		 380 aa  48.5  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2969  transcriptional regulator, CdaR  40.91 
 
 		 538 aa  48.5  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00320725  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1388  transcriptional regulator, CdaR  39.34 
 
 		 493 aa  48.5  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1801  transcriptional regulator, PucR family  20.62 
 
 		 562 aa  48.1  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3509  putative transcriptional regulator, PucR family  42 
 
 		 392 aa  47.8  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  30.51 
 
 		 514 aa  47.4  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4926  transcriptional regulator, CdaR  32.99 
 
 		 395 aa  47.4  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.378586  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12271  hypothetical protein  29.33 
 
 		 414 aa  47  0.0008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000339947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0637  purine catabolism PurC domain-containing protein  40 
 
 		 486 aa  46.2  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1487  hypothetical protein  40 
 
 		 438 aa  46.2  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3770  transcriptional regulator, CdaR  32.47 
 
 		 404 aa  46.6  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2134  putative transcriptional regulator, PucR family  40.74 
 
 		 394 aa  46.2  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1518  transcriptional regulator, CdaR  36.73 
 
 		 385 aa  45.8  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1266  PucR family transcriptional regulator  40 
 
 		 479 aa  45.8  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.330502 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3610  transcriptional regulator, CdaR  35.94 
 
 		 362 aa  45.8  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2687  transcriptional regulator, CdaR  32.81 
 
 		 387 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2728  transcriptional regulator, CdaR  32.81 
 
 		 393 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2639  transcriptional regulator, CdaR  32.81 
 
 		 387 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2860  transcriptional regulator CdaR  32.81 
 
 		 387 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1641  transcriptional regulator, CdaR  25.77 
 
 		 416 aa  46.2  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.357949 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  29.21 
 
 		 501 aa  46.2  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4288  transcriptional regulator, CdaR  33.77 
 
 		 387 aa  46.2  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.743775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2412  hypothetical protein  36.92 
 
 		 386 aa  45.1  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3342  putative transcriptional regulator, PucR family  32.14 
 
 		 425 aa  45.1  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.455149  normal  0.209688 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2703  transcriptional regulator, CdaR  34.69 
 
 		 383 aa  45.4  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.601624  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2780  hypothetical protein  27.61 
 
 		 428 aa  44.7  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.311956  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0531  transcriptional regulator, PucR family  38 
 
 		 512 aa  44.7  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2948  putative transcriptional regulator, PucR family  32.54 
 
 		 420 aa  44.3  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0167209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2528  PucR family transcriptional regulator  22.14 
 
 		 405 aa  44.3  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0819646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0113  transcriptional regulator, CdaR  28.12 
 
 		 375 aa  44.7  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0319  transcriptional regulator, CdaR  26.74 
 
 		 518 aa  44.7  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1626  transcriptional regulator, CdaR  31.17 
 
 		 413 aa  44.3  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1642  putative transcriptional regulator, PucR family  29.84 
 
 		 393 aa  44.3  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.275459  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>