223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6490 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6490  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 243 aa  477  1e-134  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0105405  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0380  transcriptional regulator, TetR family  45.27 
 
 		 216 aa  174  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.50033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2394  transcriptional regulator, TetR family  36.86 
 
 		 235 aa  128  7.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0168964  decreased coverage  0.00129293 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4146  transcriptional regulator, TetR family  36.41 
 
 		 246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2319  putative transcriptional regulator, TetR family  36.28 
 
 		 236 aa  116  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2982  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 232 aa  116  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.435152  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1166  TetR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 278 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0604682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4636  transcriptional regulator, TetR family  37.23 
 
 		 227 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.100753  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0524  transcriptional regulator, TetR family  34.31 
 
 		 230 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.576052  hitchhiker  0.0000164085 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37020  transcriptional regulator, TetR family  36.21 
 
 		 276 aa  110  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.016957 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6613  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0550  TetR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 283 aa  109  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3766  transcriptional regulator, TetR family  36.25 
 
 		 237 aa  107  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3810  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 247 aa  105  4e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11846  transcriptional regulator  34.82 
 
 		 234 aa  105  5e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.360584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0043  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 244 aa  105  8e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.343495  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2316  transcriptional regulator, TetR family  32.05 
 
 		 234 aa  103  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5469  putative transcriptional regulator, TetR family  36.73 
 
 		 241 aa  101  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0200431 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8207  putative transcriptional regulator, TetR family  33.76 
 
 		 240 aa  100  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2082  transcriptional regulator, TetR family  35.95 
 
 		 225 aa  100  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3004  regulatory protein TetR  31.49 
 
 		 230 aa  100  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.587932  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3626  transcriptional regulator, TetR family  31.9 
 
 		 261 aa  99.4  4e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2986  regulatory protein, TetR  34.68 
 
 		 241 aa  99.4  5e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2596  transcriptional regulator, TetR family  37.44 
 
 		 221 aa  99  7e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.269859  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1265  transcriptional regulator, TetR family  30.47 
 
 		 249 aa  97.1  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0071426 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0872  regulatory protein, TetR  34.96 
 
 		 230 aa  97.1  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.209107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3452  transcriptional regulator, TetR family  38 
 
 		 227 aa  96.3  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000897017  hitchhiker  0.00397123 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3414  TetR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 226 aa  96.3  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0624049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2858  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 217 aa  95.5  7e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2902  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 217 aa  95.5  7e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0060  TetR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 247 aa  94  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0017  TetR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 235 aa  94.4  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.731504 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11960  transcriptional regulator, tetR family  37.39 
 
 		 251 aa  92.4  6e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.184104  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1822  putative transcriptional regulator, TetR family  46.09 
 
 		 224 aa  92  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3609  transcriptional regulator, TetR family  34.11 
 
 		 228 aa  91.7  9e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0758  transcriptional regulator, TetR family  29.96 
 
 		 229 aa  91.7  9e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.685577  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05790  transcriptional regulator  38.35 
 
 		 215 aa  91.3  1e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.415819 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3200  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 232 aa  90.5  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0655  TetR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 254 aa  90.5  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0701  TetR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 261 aa  90.1  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.684816  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3167  TetR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 236 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0319866  normal  0.111754 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1142  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 260 aa  87.4  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2888  TetR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 217 aa  85.9  6e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10720  transcriptional regulator  30.58 
 
 		 242 aa  83.6  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.676593 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5775  hypothetical protein  30.94 
 
 		 227 aa  76.6  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35360  transcriptional regulator  28.45 
 
 		 250 aa  74.7  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4061  TetR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 195 aa  72.4  0.000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22990  transcriptional regulator  39.62 
 
 		 223 aa  71.2  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0933864  normal  0.028216 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7073  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 248 aa  71.2  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.672487  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5555  putative transcriptional regulator, TetR family  27.19 
 
 		 260 aa  71.6  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.620464  normal  0.438645 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1731  hypothetical protein  28.63 
 
 		 227 aa  71.2  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.45511  normal  0.806677 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16600  transcriptional regulator, tetR family  25.63 
 
 		 239 aa  69.3  0.00000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1913  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 259 aa  67.4  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2330  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 225 aa  67  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.389066  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2845  transcriptional regulator, TetR family  25.82 
 
 		 260 aa  63.9  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26800  transcriptional regulator  45.16 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.463482  normal  0.288316 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0068  transcriptional regulator, TetR family  43.28 
 
 		 185 aa  54.7  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.139926 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0095  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 244 aa  54.3  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.222409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5129  transcriptional regulator, TetR family  26.75 
 
 		 255 aa  53.9  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.287917  normal  0.539505 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0466  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 189 aa  52.4  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0620  TetR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 193 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0633  TetR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 193 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0611  TetR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 193 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1538  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 394 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.112139  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1561  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 394 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1353  regulatory protein TetR  39.06 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.273808  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1509  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 394 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 257 aa  50.4  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4179  transcriptional regulator, TetR family  40.3 
 
 		 396 aa  50.1  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27950  transcriptional regulator  35.21 
 
 		 207 aa  49.7  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00827834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3149  TetR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 205 aa  49.3  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3929  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 210 aa  49.7  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.459326  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0764  TetR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 203 aa  49.3  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0005262  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2604  transcriptional regulator, TetR family  31.96 
 
 		 195 aa  49.3  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2460  transcriptional regulator, TetR family  37.23 
 
 		 214 aa  48.1  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.953634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2950  TetR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 217 aa  48.1  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000171699 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3815  regulatory protein, TetR  40 
 
 		 252 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00651597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8152  putative transcriptional regulator, TetR family  36.07 
 
 		 174 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.687421 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1405  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.408275 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3721  transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 		 260 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249433  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0191  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 243 aa  48.5  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00113557  decreased coverage  0.000257741 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4571  transcriptional regulator, TetR family  34.25 
 
 		 231 aa  47  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0891  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 211 aa  47.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4079  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 244 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.780842  normal  0.246764 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3221  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 232 aa  47.4  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  26.56 
 
 		 196 aa  47.4  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  42.03 
 
 		 203 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4094  TetR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 204 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0325183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  34.58 
 
 		 205 aa  47.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2636  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 198 aa  46.6  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3094  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 237 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5273  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 237 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.461714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3448  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 240 aa  47  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1597  putative transcriptional regulator, TetR family  29.2 
 
 		 174 aa  47  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2481  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 231 aa  47  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0773  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 224 aa  46.2  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0502  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 224 aa  46.2  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0377  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 224 aa  46.6  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0573  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 232 aa  46.6  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0810713  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0685  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 232 aa  46.6  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>