More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0592 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_0592  TolB-like protein  100 
 
 		 438 aa  897    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  35.13 
 
 		 427 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000381605  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3540  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  33.48 
 
 		 429 aa  205  1e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000000050948  normal  1 
 
 
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  33.26 
 
 		 432 aa  199  7.999999999999999e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3470  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  37.03 
 
 		 430 aa  192  8e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0247936  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3513  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  38.51 
 
 		 407 aa  192  1e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000266488  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1910  TolB protein, putative  31.77 
 
 		 440 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2975  TolB protein  31.29 
 
 		 443 aa  187  4e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.508751  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3582  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  38.19 
 
 		 407 aa  186  5e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1711  WD40 domain protein beta Propeller  30.71 
 
 		 444 aa  182  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000750977  decreased coverage  0.0000915698 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3323  WD40 domain-containing protein  32.61 
 
 		 435 aa  181  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000401957  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2210  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  34.27 
 
 		 438 aa  180  4e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000769838  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1279  WD40 domain-containing protein  30.02 
 
 		 428 aa  179  5.999999999999999e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0755  TolB domain-containing protein  31.83 
 
 		 457 aa  175  9.999999999999999e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0133  WD40 domain protein beta Propeller  34.32 
 
 		 445 aa  174  3.9999999999999995e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2339  TolB-like protein  33.69 
 
 		 415 aa  167  4e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000041462  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2161  WD40 domain protein beta Propeller  28.86 
 
 		 440 aa  164  3e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000041437  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0467  TolB domain-containing protein  30.61 
 
 		 450 aa  164  3e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.84052  normal  0.495381 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0747  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  29.66 
 
 		 444 aa  161  2e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000257607  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0859  WD40 domain-containing protein  29.97 
 
 		 442 aa  157  3e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.318178  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1723  translocation protein TolB  30.84 
 
 		 443 aa  156  8e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0502645 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0275  translocation protein TolB  30.36 
 
 		 436 aa  155  1e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839364  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4536  translocation protein TolB  32.67 
 
 		 432 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51720  translocation protein TolB  32.67 
 
 		 432 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109745  hitchhiker  0.0000339249 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3394  translocation protein TolB  30.14 
 
 		 441 aa  152  8e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0076717 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2122  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  30.89 
 
 		 446 aa  152  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256883  normal  0.227077 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0067  tol-pal system beta propeller repeat protein TolB  29.02 
 
 		 422 aa  151  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.518188  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2365  translocation protein TolB  30.46 
 
 		 441 aa  151  2e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0068  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  29.02 
 
 		 422 aa  151  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2714  translocation protein TolB  31.72 
 
 		 441 aa  150  3e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0459045  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2092  translocation protein TolB  29.57 
 
 		 425 aa  149  7e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.626129  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1981  translocation protein TolB  30.66 
 
 		 440 aa  149  8e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0614  TolB protein, putative  27.9 
 
 		 449 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00377452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0703  TolB domain-containing protein  30.03 
 
 		 437 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.408363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0303  translocation protein TolB  29.71 
 
 		 403 aa  149  1.0000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.307961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3406  translocation protein TolB  33.78 
 
 		 438 aa  147  3e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569267 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2206  translocation protein TolB  29.25 
 
 		 427 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281817 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1011  translocation protein TolB  31.28 
 
 		 421 aa  147  5e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2627  translocation protein TolB  29.17 
 
 		 436 aa  146  7.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0669  translocation protein TolB  29.81 
 
 		 444 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.303969  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0694  TolB domain protein  31.74 
 
 		 434 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659148  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2322  translocation protein TolB  29.81 
 
 		 444 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0205331  normal  0.53419 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2229  translocation protein TolB  31.01 
 
 		 435 aa  145  2e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0659  TolB-like protein  31.5 
 
 		 434 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.481566  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1277  translocation protein TolB  30 
 
 		 432 aa  144  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.154906  normal  0.476044 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0562  translocation protein TolB  29.74 
 
 		 444 aa  144  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0750  WD40 domain protein beta Propeller  27.72 
 
 		 441 aa  144  4e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000257042  normal  0.0548288 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0686  translocation protein TolB  30.02 
 
 		 461 aa  144  4e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.223253  normal  0.228867 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1094  translocation protein TolB  29.09 
 
 		 443 aa  143  5e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4427  translocation protein TolB  29.75 
 
 		 441 aa  143  5e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.500534 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0693  TolB domain protein  31.26 
 
 		 434 aa  142  8e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180783  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1984  translocation protein TolB  29.2 
 
 		 426 aa  142  9e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.517365  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4053  translocation protein TolB  29.23 
 
 		 437 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3387  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  27.92 
 
 		 442 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.413738  normal  0.777637 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1111  translocation protein TolB  30.62 
 
 		 446 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00131159  normal  0.386204 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1017  translocation protein TolB  29.93 
 
 		 461 aa  140  6e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.609487  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0145  translocation protein TolB  29.31 
 
 		 434 aa  139  7e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0566  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  28.09 
 
 		 428 aa  139  7e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.22163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2731  translocation protein TolB  27.77 
 
 		 442 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00144802  decreased coverage  0.0000043993 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2748  translocation protein TolB  26.62 
 
 		 442 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3972  tolB protein  29.65 
 
 		 433 aa  139  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0956227  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1415  translocation protein TolB  29.65 
 
 		 433 aa  139  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00100672  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36640  translocation protein TolB  29.65 
 
 		 430 aa  139  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.239695  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1746  translocation protein TolB  27.29 
 
 		 442 aa  139  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000149314  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3621  translocation protein TolB  29.87 
 
 		 435 aa  138  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.578468  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2564  translocation protein TolB  26.08 
 
 		 440 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000866572  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1857  translocation protein TolB  28.48 
 
 		 442 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00113428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2675  translocation protein TolB  28.67 
 
 		 446 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4402  translocation protein TolB  29.32 
 
 		 414 aa  137  4e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.145947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0782  translocation protein TolB  28.05 
 
 		 425 aa  137  4e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0181245  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1462  translocation protein TolB  27.52 
 
 		 442 aa  137  4e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000134108  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2416  TolB domain-containing protein  29.48 
 
 		 453 aa  137  4e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2538  translocation protein TolB  27.07 
 
 		 442 aa  137  5e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000186682  hitchhiker  0.0000162747 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1785  translocation protein TolB  27.07 
 
 		 442 aa  137  5e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000978843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1742  translocation protein TolB  27.07 
 
 		 442 aa  137  5e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000714613  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1346  translocation protein TolB  28.71 
 
 		 421 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2050  translocation protein TolB  28.16 
 
 		 429 aa  136  9e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3119  translocation protein TolB  30.91 
 
 		 439 aa  135  9.999999999999999e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1607  translocation protein TolB  26.4 
 
 		 442 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000108344  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2692  translocation protein TolB  29.01 
 
 		 408 aa  134  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1812  translocation protein TolB  28.92 
 
 		 449 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.431319  normal  0.360787 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4436  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  27.91 
 
 		 442 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.314306  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1218  translocation protein TolB  28.89 
 
 		 443 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27228  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4147  translocation protein TolB  28.92 
 
 		 449 aa  133  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2194  translocation protein TolB  27.89 
 
 		 432 aa  133  5e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.246481  normal  0.294233 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4751  translocation protein TolB  28.24 
 
 		 450 aa  133  6e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2368  translocation protein TolB  26.17 
 
 		 442 aa  133  6e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000751795  normal  0.188875 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2440  translocation protein TolB  26.17 
 
 		 442 aa  133  6e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000137237  normal  0.263362 
 
 
-
 
NC_004310  BR1697  translocation protein TolB  28.67 
 
 		 443 aa  133  6.999999999999999e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3920  translocation protein TolB  29.12 
 
 		 430 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0501302 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0759  translocation protein TolB  29.35 
 
 		 430 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397862  normal  0.413932 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2531  translocation protein TolB  26.17 
 
 		 442 aa  133  6.999999999999999e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000171266  normal  0.044306 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1222  translocation protein TolB  27.46 
 
 		 433 aa  132  9e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1229  translocation protein TolB  28.51 
 
 		 424 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.910184  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1311  translocation protein TolB  28.67 
 
 		 444 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4196  translocation protein TolB  28.57 
 
 		 423 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1394  translocation protein TolB  26.35 
 
 		 442 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000203609  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3993  translocation protein TolB  28.57 
 
 		 423 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.213865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2455  translocation protein TolB  29.98 
 
 		 430 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328002  normal  0.860267 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1639  translocation protein TolB  28.67 
 
 		 443 aa  132  2.0000000000000002e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>