119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1750 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_1750  putative prophage repressor  100 
 
 		 230 aa  473  1e-132  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.141014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1607  putative prophage repressor  42.72 
 
 		 221 aa  165  5.9999999999999996e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.385994  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1249  repressor protein C2  38.01 
 
 		 218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000393675  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1929  peptidase S24/S26 domain-containing protein  36.99 
 
 		 215 aa  133  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0221761  hitchhiker  0.0000000154774 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2812  peptidase  38.68 
 
 		 216 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.354301 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0382  P22 repressor protein c2  38.97 
 
 		 216 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.103014  hitchhiker  0.000000000000607321 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2927  XRE family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 204 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.035933  normal  0.395861 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1308  XRE family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 229 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10021  Repressor protein C2  37.61 
 
 		 216 aa  119  6e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0289  P22 repressor protein c2  37.61 
 
 		 216 aa  119  6e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2471  putative prophage repressor  32.84 
 
 		 216 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.894795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3869  peptidase  36.32 
 
 		 218 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4132  repressor protein c2, putative  36.36 
 
 		 217 aa  108  5e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1853  putative prophage repressor  33.97 
 
 		 221 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0159907  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3399  XRE family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 221 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000795549 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3033  transcriptional repressor pyocin R2_PP  38.76 
 
 		 243 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.593643  normal  0.0855736 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01954  hypothetical protein  32.23 
 
 		 221 aa  105  6e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0293  prophage repressor  31.36 
 
 		 237 aa  105  6e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.830345 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3421  repressor protein c2  37.36 
 
 		 243 aa  105  8e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000122682  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3443  XRE family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 228 aa  105  8e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00400113  unclonable  9.66468e-17 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1500  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  33.63 
 
 		 220 aa  102  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043506  normal  0.0115826 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1970  XRE family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 229 aa  99.8  3e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.118852  normal  0.0462481 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2924  repressor protein  30.91 
 
 		 231 aa  99.4  4e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  4.38721e-16 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2750  phage repressor protein  29.31 
 
 		 240 aa  97.8  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1456  phage repressor protein  29.31 
 
 		 240 aa  97.8  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.817013  normal  0.84573 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2829  XRE family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 240 aa  97.8  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0617  peptidase S24, S26A and S26B  38.46 
 
 		 225 aa  96.3  4e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1733  XRE family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 222 aa  95.1  7e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000886349 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0571  repressor protein c2  32.64 
 
 		 215 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.72773  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4603  peptidase  32.38 
 
 		 229 aa  94  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2248  repressor protein C2  34.88 
 
 		 236 aa  90.5  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000124176  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3102  XRE family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 240 aa  90.5  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0669048  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1210  XRE family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 209 aa  83.2  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1083  peptidase, S24 family  38.4 
 
 		 133 aa  82.4  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.501278  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2501  peptidase S24 and S26 domain protein  32.28 
 
 		 224 aa  81.6  0.000000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.241026  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1339  putative prophage repressor  33.96 
 
 		 219 aa  80.9  0.00000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00520189 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3550  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  28.57 
 
 		 235 aa  80.5  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000497465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0322  helix-turn-helix/peptidase S24-like domain-containing protein  28.22 
 
 		 213 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.274392  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4010  repressor protein cI  29.02 
 
 		 234 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.895282  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1815  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  28.86 
 
 		 207 aa  68.6  0.00000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.50082  hitchhiker  0.00327746 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2713  transcriptional regulator, XRE family  27.86 
 
 		 222 aa  67.8  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3660  putative prophage repressor  28.5 
 
 		 232 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000108036  normal  0.0641656 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1840  putative phage repressor  50 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100687  hitchhiker  0.0000604594 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3896  Cro/CI family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353592 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1773  putative prophage repressor  28.96 
 
 		 224 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000495428  hitchhiker  0.00108243 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07960  transcriptional regulator PrtR  47.14 
 
 		 256 aa  58.5  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101148  hitchhiker  0.000834984 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3964  putative phage repressor  45.59 
 
 		 259 aa  58.5  0.00000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.072898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2924  putative phage repressor  41.1 
 
 		 264 aa  57.8  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0755  transcriptional regulator PrtR  47.14 
 
 		 256 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.011984  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2167  putative phage repressor  40 
 
 		 244 aa  57.4  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.117586  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0617  hypothetical protein  44.62 
 
 		 71 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.455371  hitchhiker  0.00000289495 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4068  Cro/CI family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 234 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0144241  unclonable  0.00000065299 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0165  hypothetical protein  28.05 
 
 		 227 aa  54.7  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0147  hypothetical protein  28.07 
 
 		 234 aa  54.7  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2775  putative phage repressor  39.73 
 
 		 264 aa  54.7  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1772  putative prophage repressor  26.85 
 
 		 217 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000601077  decreased coverage  0.000377038 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3015  putative prophage repressor  32.11 
 
 		 227 aa  53.9  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52530  transcriptional regulator  38.36 
 
 		 237 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000132202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4606  transcriptional regulator  38.36 
 
 		 237 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0808  putative repressor protein  39.18 
 
 		 251 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768996  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1875  putative phage repressor  42.03 
 
 		 244 aa  54.3  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1808  XRE family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 235 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.630846  normal  0.212121 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2211  putative repressor protein encoded within prophage CP-933O  25.82 
 
 		 212 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000372098  hitchhiker  7.21375e-19 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1976  transcriptional regulator, XRE family  53.57 
 
 		 227 aa  52  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4243  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 229 aa  50.4  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1686  putative phage repressor  27.23 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2366  peptidase  41.43 
 
 		 222 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000799679  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1912  putative prophage repressor  30.84 
 
 		 196 aa  50.8  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03030  SOS response transcriptional repressor, RecA-mediated autopeptidase  31.46 
 
 		 228 aa  50.1  0.00003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000274718  hitchhiker  1.62281e-36 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2539  peptidase S24/S26 domain-containing protein  40 
 
 		 149 aa  49.7  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.692907 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0440  DNA-binding protein  48.21 
 
 		 91 aa  49.3  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000374773  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3983  putative phage repressor  29.52 
 
 		 240 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000900431  normal  0.128218 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3262  putative phage repressor  37.5 
 
 		 241 aa  49.3  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0989  S24 family peptidase  30.4 
 
 		 239 aa  48.9  0.00007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000125637 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0633  putative phage repressor  36.67 
 
 		 209 aa  48.1  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.681909  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3324  Cro/CI family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 212 aa  47.4  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2567  XRE family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 106 aa  46.2  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.59456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  47.46 
 
 		 256 aa  45.8  0.0006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0647  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 209 aa  45.8  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.9067299999999995e-25 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1673  putative phage repressor  28.37 
 
 		 233 aa  45.4  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.219867  normal  0.134588 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1648  putative phage repressor  35 
 
 		 230 aa  45.4  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00656681  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1423  transcriptional regulator, XRE family  40.62 
 
 		 195 aa  45.4  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2330  putative phage repressor  39.06 
 
 		 302 aa  45.1  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.965048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1874  LexA repressor  34.71 
 
 		 228 aa  45.1  0.0009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.879574  normal  0.093957 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3666  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 217 aa  45.1  0.0009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100264  decreased coverage  0.0000000000010366 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2375  hypothetical protein  28.31 
 
 		 220 aa  44.3  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0251  transcriptional repressor LexA, putative  26.47 
 
 		 217 aa  43.5  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00843575  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0274  transcriptional repressor LexA, putative  26.47 
 
 		 217 aa  43.5  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0884  transcriptional repressor LexA, putative  26.47 
 
 		 217 aa  43.5  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0403534  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0641  XRE family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 211 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.199173  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0130  putative prophage repressor  33.78 
 
 		 216 aa  44.3  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0278  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 128 aa  43.5  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000672654  normal  0.646275 
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0038  Helix-turn-helix domain protein  34.38 
 
 		 120 aa  44.3  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000109438  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2294  XRE family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 211 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.328361 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1170  helix-turn-helix domain-containing protein  50 
 
 		 196 aa  44.3  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1965  putative phage repressor  30.86 
 
 		 263 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.526038  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1733  XRE family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 133 aa  43.1  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0580  repressor protein C2  21.48 
 
 		 238 aa  43.5  0.003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6073  XRE family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 313 aa  43.5  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.62035 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1577  peptidase S24-like domain-containing protein  20.74 
 
 		 216 aa  43.5  0.003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000555461  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>