46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2375 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp2375  hypothetical protein  100 
 
 		 220 aa  452  1.0000000000000001e-126  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0165  hypothetical protein  36 
 
 		 227 aa  126  3e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0147  hypothetical protein  34.51 
 
 		 234 aa  124  1e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1077  hypothetical protein  57.32 
 
 		 84 aa  100  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1039  hypothetical protein  52.5 
 
 		 84 aa  88.2  8e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1210  XRE family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 209 aa  67.8  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1929  peptidase S24/S26 domain-containing protein  28.25 
 
 		 215 aa  53.9  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0221761  hitchhiker  0.0000000154774 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2927  XRE family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 204 aa  53.1  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.035933  normal  0.395861 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1530  XRE family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 137 aa  50.8  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3831  prophage LambdaBa02, repressor protein  32.98 
 
 		 122 aa  50.1  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0071415  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4126  prophage LambdaBa02, repressor protein  32.98 
 
 		 122 aa  50.1  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.158818  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3686  transcriptional regulator, XRE family  48.48 
 
 		 133 aa  50.1  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1649  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 181 aa  49.7  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.176921  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20950  putative prophage repressor  27.21 
 
 		 200 aa  48.9  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000578065  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0455  XRE family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 214 aa  49.3  0.00005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000298649 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1500  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  25.55 
 
 		 220 aa  48.9  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043506  normal  0.0115826 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4028  prophage LambdaBa02, repressor protein  31.91 
 
 		 122 aa  48.1  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.210086  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1599  MerR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 181 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1831  DNA-binding protein  40.28 
 
 		 181 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3546  DNA-binding protein  40.28 
 
 		 181 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1629  MerR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 181 aa  47.8  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000044317  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1668  XRE family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 137 aa  48.1  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00903838  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1906  DNA-binding protein  40.28 
 
 		 181 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0011859  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1854  DNA-binding protein  40.28 
 
 		 181 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.653009  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1795  DNA-binding protein  40.28 
 
 		 181 aa  47  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2990  prophage LambdaSo, Cro/CI family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 272 aa  47.4  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1781  DNA-binding protein  38.89 
 
 		 181 aa  46.2  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1650  DNA-binding protein  38.89 
 
 		 181 aa  46.2  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000412674  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0666  transcriptional regulator, XRE family  45 
 
 		 150 aa  45.8  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1965  putative phage repressor  38.57 
 
 		 263 aa  45.8  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.526038  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1750  putative prophage repressor  28.31 
 
 		 230 aa  44.3  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.141014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1815  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  28.83 
 
 		 207 aa  44.7  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.50082  hitchhiker  0.00327746 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0219  putative phage repressor  23.33 
 
 		 235 aa  43.9  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.449525  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2810  putative repressor protein  29.47 
 
 		 219 aa  43.5  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0925721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1365  putative phage repressor  25.29 
 
 		 227 aa  43.5  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3051  XRE family transcriptional regulator  36 
 
 		 242 aa  43.1  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0338218  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0508  DNA-binding protein  23.92 
 
 		 194 aa  43.1  0.003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0116829  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6747  XRE family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 115 aa  42.7  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2140  XRE family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 196 aa  43.1  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0511  DNA-binding protein  32.99 
 
 		 210 aa  43.1  0.004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239636 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4635  putative phage repressor  24.32 
 
 		 214 aa  42.4  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.671239 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1027  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 		 321 aa  42.4  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3326  DNA-binding protein  38.57 
 
 		 374 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2086  helix-turn-helix domain protein  35.48 
 
 		 327 aa  42  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0272363  normal  0.126806 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3324  Cro/CI family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 212 aa  42  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2812  peptidase  25.12 
 
 		 216 aa  41.6  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.354301 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>