115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06203 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06203  hypothetical protein  100 
 
 		 669 aa  1381    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4418  ATP-dependent OLD family endonuclease  40.92 
 
 		 639 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3175  SMC domain protein  38.48 
 
 		 634 aa  431  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0609812  unclonable  0.0000000000000447606 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4276  Fis family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 645 aa  417  9.999999999999999e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.237058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2559  hypothetical protein  37.43 
 
 		 645 aa  414  1e-114  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.251758 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3680  hypothetical protein  37.11 
 
 		 667 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228767  hitchhiker  0.00106717 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3525  ATP-dependent exoDNAse beta subunit  36.51 
 
 		 657 aa  390  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.297188  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1604  hypothetical protein  34.17 
 
 		 685 aa  363  5.0000000000000005e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0196  ATPase  35.99 
 
 		 666 aa  361  3e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2954  putative exonuclease  35.78 
 
 		 659 aa  358  1.9999999999999998e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3193  plasmid-related protein  33.79 
 
 		 674 aa  353  4e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0945381 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0046  hypothetical protein  32.99 
 
 		 661 aa  346  6e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.489022  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3363  hypothetical protein  24.6 
 
 		 607 aa  101  5e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.194578  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2561  ATP-dependent endonuclease  25.2 
 
 		 613 aa  99.8  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0763392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5488  putative nucleoside triphosphate hydrolase domain-containing protein  22.59 
 
 		 598 aa  92.4  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  24.31 
 
 		 623 aa  92  3e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1844  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.15 
 
 		 640 aa  84.3  0.000000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0038  hypothetical protein  23.35 
 
 		 594 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.19507  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0753  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.51 
 
 		 594 aa  78.2  0.0000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.362493  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1644  hypothetical protein  30.68 
 
 		 596 aa  75.5  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.595797  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  22.61 
 
 		 666 aa  73.2  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3408  hypothetical protein  23.61 
 
 		 594 aa  72  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.043782  normal  0.188523 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6911  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.14 
 
 		 669 aa  70.9  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0857845  hitchhiker  0.000559752 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1439  hypothetical protein  26.01 
 
 		 744 aa  70.5  0.00000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0880018  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5469  hypothetical protein  26.97 
 
 		 763 aa  69.3  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.913319  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4970  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.7 
 
 		 677 aa  68.6  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00358529 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2791  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.7 
 
 		 677 aa  68.6  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0639956 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4449  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  24.7 
 
 		 564 aa  68.2  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0294  ATP-dependent endonuclease, OLD family  21.99 
 
 		 773 aa  67.8  0.0000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0724498 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0676  hypothetical protein  23.48 
 
 		 712 aa  67  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54535 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4219  ATP-dependent endonuclease, OLD family  25.71 
 
 		 780 aa  65.5  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3655  ATP-dependent OLD family endonuclease  23 
 
 		 793 aa  64.7  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523201  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2666  hypothetical protein  21.54 
 
 		 553 aa  63.5  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0001  hypothetical protein  25.65 
 
 		 707 aa  62.8  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.426286  unclonable  0.0000000168459 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0505  ATP-dependent endonuclease, OLD family protein  28.93 
 
 		 663 aa  63.2  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0949649  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0801  SMC domain protein  23.89 
 
 		 564 aa  63.2  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.779455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4153  SMC domain-containing protein  21.47 
 
 		 574 aa  62.4  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0910063 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3144  SMC (structural maintenance of chromosomes) family protein  30.49 
 
 		 682 aa  62  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.872592  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6476  ATP-dependent endonuclease, OLD family  25.43 
 
 		 762 aa  62  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1800  ATP-dependent endonuclease  28.16 
 
 		 782 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.163523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3887  hypothetical protein  21.55 
 
 		 546 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.333396  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2727  ATP-dependent OLD family endonuclease  20.63 
 
 		 607 aa  58.9  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60070  hypothetical protein  23.3 
 
 		 807 aa  58.2  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000312719  hitchhiker  0.0000000420342 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3013  hypothetical protein  22.71 
 
 		 520 aa  57.8  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.364148  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2417  hypothetical protein  22.68 
 
 		 748 aa  57.8  0.0000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.295746  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3277  hypothetical protein  22.46 
 
 		 728 aa  55.5  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0296184  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000190  ATP-dependent endonuclease  22.46 
 
 		 544 aa  55.1  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0284428  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1874  hypothetical protein  22.49 
 
 		 703 aa  55.1  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.75491  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2720  hypothetical protein  23.43 
 
 		 784 aa  54.7  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3543  SMC protein-like  25 
 
 		 695 aa  54.7  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2572  hypothetical protein  25.17 
 
 		 650 aa  53.9  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00339016  normal  0.0605496 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003289  pathogenesis related protein  21.76 
 
 		 714 aa  53.5  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.31747  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3272  OLD family-like ATP-dependent endonuclease  35.29 
 
 		 758 aa  53.1  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1596  ATP-dependent OLD family endonuclease  21.85 
 
 		 652 aa  53.1  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1846  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.11 
 
 		 589 aa  51.6  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000147928 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1883  SMC protein-like protein  24.32 
 
 		 688 aa  51.6  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1302  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.73 
 
 		 634 aa  51.2  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1915  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  26.95 
 
 		 529 aa  51.6  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4907  hypothetical protein  24.34 
 
 		 769 aa  51.2  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.50635  normal  0.10457 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2274  AAA ATPase  26.25 
 
 		 602 aa  51.2  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.363979 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1087  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.67 
 
 		 616 aa  51.2  0.00006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.14427  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2354  hypothetical protein  24.87 
 
 		 565 aa  50.8  0.00009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0477  hypothetical protein  22.81 
 
 		 543 aa  50.1  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000481423  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3807  hypothetical protein  22.83 
 
 		 691 aa  50.1  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0465768  normal  0.185185 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0597  hypothetical protein  24.52 
 
 		 773 aa  50.4  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3955  AAA ATPase  28.17 
 
 		 642 aa  49.7  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.262295  hitchhiker  0.00100841 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05915  hypothetical protein  24.19 
 
 		 544 aa  49.7  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4162  ATP-dependent endonuclease family protein  29.53 
 
 		 600 aa  49.7  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.138387  normal  0.169092 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3445  hypothetical protein  25.15 
 
 		 628 aa  48.9  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.919866  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1111  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.2 
 
 		 603 aa  48.5  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4711  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  46.15 
 
 		 648 aa  48.5  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1621  hypothetical protein  25.75 
 
 		 596 aa  48.1  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0225  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.81 
 
 		 578 aa  48.1  0.0005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000140656 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0004  ATP binding protein  46.94 
 
 		 454 aa  47.8  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0201  hypothetical protein  44 
 
 		 442 aa  47.8  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0853474 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2516  chromosome segregation protein SMC  39.34 
 
 		 1138 aa  47.4  0.0008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0576231  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2848  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.83 
 
 		 674 aa  47.4  0.0008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.351188  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3600  ATPase-like protein  33.33 
 
 		 416 aa  47.4  0.0009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2898  chromosome segregation protein  44.19 
 
 		 891 aa  47  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  32.32 
 
 		 1170 aa  46.6  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  32.32 
 
 		 1170 aa  46.6  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1381  chromosome segregation protein SMC  40.35 
 
 		 1184 aa  45.8  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.530369  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1774  chromosome segregation protein SMC  39.34 
 
 		 1164 aa  46.2  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.21183  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2459  hypothetical protein  21.97 
 
 		 606 aa  46.2  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.707067  normal  0.551867 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2379  chromosome segregation protein SMC  39.34 
 
 		 1141 aa  46.2  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.882333  unclonable  0.00000367062 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2759  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.76 
 
 		 608 aa  46.2  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1966  hypothetical protein  32.88 
 
 		 424 aa  46.2  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0032  SMC domain protein  44.9 
 
 		 440 aa  46.2  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.841332  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5288  SMC domain protein  26.18 
 
 		 610 aa  45.8  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.950541  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1709  SMC domain protein  25.3 
 
 		 584 aa  45.8  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000133048  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0661  SMC domain protein  40.82 
 
 		 1172 aa  45.4  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0206  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.32 
 
 		 689 aa  45.8  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6942  chromosome segregation protein SMC  41.38 
 
 		 1144 aa  45.4  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0702595 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03536  hypothetical protein  32.97 
 
 		 398 aa  45.8  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2736  chromosome segregation protein SMC  38.89 
 
 		 1188 aa  45.4  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0093  conserved hypothetical protein  24.68 
 
 		 495 aa  45.4  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.123292  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2624  hypothetical protein  23.78 
 
 		 505 aa  45.4  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  41.38 
 
 		 1174 aa  45.4  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  38.78 
 
 		 1181 aa  44.7  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2199  condensin subunit Smc  39.22 
 
 		 1148 aa  44.7  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.53129 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>