More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1164 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 184 aa  359  1e-98  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000872016  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  52.25 
 
 		 193 aa  186  2e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  46.7 
 
 		 190 aa  165  2.9999999999999998e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  47.25 
 
 		 190 aa  164  8e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1934  TetR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 202 aa  73.2  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0322407  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3117  TetR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 248 aa  69.7  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 242 aa  68.9  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3265  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 206 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.111309  normal  0.286417 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 243 aa  68.2  0.00000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 214 aa  67.8  0.00000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 196 aa  67.4  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 324 aa  67  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3049  transcriptional regulator, TetR family  25.33 
 
 		 214 aa  65.9  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1778  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 199 aa  65.9  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0789135  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0081  transcriptional regulator, TetR family  33.67 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2630  TetR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0444  TetR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 220 aa  64.3  0.0000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1709  transcriptional regulator, TetR family  34.51 
 
 		 203 aa  63.9  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.922562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 208 aa  63.5  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  25.74 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4683  transcriptional regulator, TetR family  25.58 
 
 		 385 aa  63.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  25.5 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  34.04 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  25.79 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14700  transcriptional regulator, TetR family  41.1 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.73009e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  26.88 
 
 		 259 aa  62.4  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1720  TetR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 200 aa  62  0.000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 210 aa  62  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1872  TetR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 204 aa  61.6  0.000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.598992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  34.09 
 
 		 220 aa  61.6  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 220 aa  61.6  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0510  TetR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 222 aa  61.2  0.000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.673095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  28.19 
 
 		 299 aa  60.5  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2285  TetR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 233 aa  60.5  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.522027  normal  0.380806 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0177  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0382  TetR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 242 aa  60.8  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.894324  normal  0.190078 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1044  TetR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 180 aa  60.5  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0206033 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  41.43 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0199  TetR family regulatory protein  25.16 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1452  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  41.43 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3085  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2041  TetR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3248  TetR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0882  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2917  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.761743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2914  transcriptional regulator, TetR family  26.99 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3330  TetR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648103  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0186  TetR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.625871  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1819  TetR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.191224 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1276  transcriptional regulator, TetR family  36.14 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3179  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.30038  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3300  TetR family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.161696 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2270  TetR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0152904  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2583  TetR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 184 aa  58.9  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  46.48 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13324  TetR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.119785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0330  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 233 aa  58.9  0.00000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2425  TetR family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.520855  normal  0.599881 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2354  TetR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0622512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2312  TetR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000394535  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2530  TetR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.828016  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2545  transcriptional regulator, TetR family  32.64 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.91976e-46 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3711  TetR family transcriptional regulator  61.36 
 
 		 420 aa  58.5  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0336995  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0092  transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00302716  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2028  transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.937171  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5011  putative transcriptional regulator, TetR family  25.27 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0636  TetR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 250 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0304513 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1864  transcriptional regulator, TetR family  30.52 
 
 		 218 aa  58.2  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3581  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 200 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.919672  normal  0.194712 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1139  TetR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 193 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0440  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 207 aa  57.8  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9138  putative transcriptional regulator, TetR family  35.79 
 
 		 217 aa  57.8  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2034  TetR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 216 aa  57.8  0.00000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.480509  normal  0.0875613 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1649  TetR family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 233 aa  57.8  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.617035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5646  TetR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 233 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.176197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3068  TetR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.493248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1936  transcriptional regulator, TetR family  38.95 
 
 		 193 aa  57  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3562  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.137861 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0944  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  37.97 
 
 		 217 aa  57  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1460  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3141  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 204 aa  57  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 238 aa  57  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1689  transcriptional regulator, TetR family  32.64 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0605741  hitchhiker  0.00000000000000310562 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0483  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  28.91 
 
 		 220 aa  57  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4773  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 212 aa  57  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164473  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1558  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 204 aa  57  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.231141  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11567  transcriptional regulator  25.3 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  29.47 
 
 		 216 aa  57  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8267  putative transcriptional regulator, TetR family  41.43 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4802  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.96494  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4064  regulatory protein TetR  21.71 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.3318 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>