More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2671 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  50.36 
 
 		 991 aa  751    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  53.03 
 
 		 1060 aa  808    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  100 
 
 		 828 aa  1684    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  28.86 
 
 		 1009 aa  307  6e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  31.05 
 
 		 809 aa  299  1e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  28.13 
 
 		 957 aa  287  5e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  41.2 
 
 		 782 aa  243  1e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  27.86 
 
 		 949 aa  240  9e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1591  TPR repeat-containing protein  37.61 
 
 		 412 aa  232  2e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  39.93 
 
 		 1313 aa  223  9e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  38.18 
 
 		 1266 aa  221  3e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2809  tetratricopeptide TPR_2  39.26 
 
 		 985 aa  217  5.9999999999999996e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00683217  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0462  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.92 
 
 		 2741 aa  203  9.999999999999999e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.32 
 
 		 2741 aa  199  2.0000000000000003e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.14 
 
 		 1162 aa  197  8.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0788  TPR repeat-containing protein  41.8 
 
 		 1101 aa  195  2e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000957174  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  25.91 
 
 		 1162 aa  194  8e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1290  TPR repeat-containing protein  39.1 
 
 		 343 aa  189  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3729  TPR-related region  37.5 
 
 		 340 aa  188  5e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0045227  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  33.65 
 
 		 2145 aa  171  4e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  25.77 
 
 		 1215 aa  171  5e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0791  TPR repeat-containing protein  39.32 
 
 		 1063 aa  167  8e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0118647  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  34.21 
 
 		 1550 aa  162  3e-38  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3130  TPR repeat-containing protein  31.1 
 
 		 408 aa  161  6e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000180384 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  34.3 
 
 		 1404 aa  161  6e-38  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  25.56 
 
 		 1328 aa  160  8e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1768  TPR repeat-containing protein  24.03 
 
 		 923 aa  155  4e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.706396 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  30.58 
 
 		 725 aa  153  1e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2461  TPR repeat-containing protein  32.06 
 
 		 905 aa  152  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3648  TPR repeat-containing protein  31.81 
 
 		 905 aa  152  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1066  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  29.93 
 
 		 609 aa  150  1.0000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.94417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2488  Tetratricopeptide domain protein  31.88 
 
 		 950 aa  146  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3620  Tetratricopeptide domain protein  32.15 
 
 		 950 aa  146  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  27.24 
 
 		 1238 aa  145  4e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4137  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 		 868 aa  145  4e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000228127  decreased coverage  0.0057951 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.58 
 
 		 1186 aa  144  7e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0229  tetratricopeptide TPR_3  32.51 
 
 		 689 aa  144  7e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0283  TPR repeat-containing protein  24.64 
 
 		 854 aa  144  9.999999999999999e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0790  TPR repeat-containing protein  22.22 
 
 		 916 aa  144  9.999999999999999e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.601667 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2979  TPR repeat-containing protein  24.2 
 
 		 1054 aa  142  3e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.864707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  33.73 
 
 		 1025 aa  140  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0160  TPR repeat-containing protein  32.33 
 
 		 438 aa  138  5e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00134878  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1685  Tetratricopeptide domain protein  29.13 
 
 		 891 aa  136  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.131427 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  31.09 
 
 		 825 aa  134  6.999999999999999e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0458  NB-ARC domain protein  27.84 
 
 		 941 aa  133  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0475  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.71 
 
 		 1279 aa  132  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.894605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0054  TPR repeat-containing protein  34.08 
 
 		 885 aa  131  5.0000000000000004e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.494605 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  30.35 
 
 		 732 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4462  hypothetical protein  32.1 
 
 		 853 aa  128  3e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.60042  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  29.49 
 
 		 1020 aa  128  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  34.52 
 
 		 1212 aa  127  1e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  31.01 
 
 		 1526 aa  125  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2565  TPR repeat-containing protein  29.29 
 
 		 851 aa  124  5e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 1048 aa  124  5e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4095  TPR repeat-containing protein  23.24 
 
 		 729 aa  124  7e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000736734 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0857  hypothetical protein  30.48 
 
 		 532 aa  124  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0698719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1376  TPR repeat-containing protein  28.52 
 
 		 1261 aa  122  3.9999999999999996e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0670144  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3488  tetratricopeptide region  30.29 
 
 		 840 aa  121  6e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0614  HI0933 family protein  30.35 
 
 		 1228 aa  121  7e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.688496 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0363  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.08 
 
 		 1772 aa  118  3.9999999999999997e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.387099 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2968  kinesin light chain  31.21 
 
 		 493 aa  117  8.999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.220917  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3265  hypothetical protein  31.07 
 
 		 845 aa  117  8.999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.463161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3057  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.2 
 
 		 904 aa  117  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.249484 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0380  tetratricopeptide region  30.32 
 
 		 960 aa  116  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2936  transcriptional regulator, SARP family  28.43 
 
 		 1054 aa  117  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281225  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0502  Tetratricopeptide domain protein  26.04 
 
 		 717 aa  116  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3695  Tetratricopeptide TPR_4  26.15 
 
 		 1914 aa  116  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.174493 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4871  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.55 
 
 		 636 aa  115  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2808  TPR repeat-containing protein  28.7 
 
 		 883 aa  114  5e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0914392  normal  0.245716 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  28.57 
 
 		 1021 aa  114  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1756  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.32 
 
 		 854 aa  114  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760103 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5804  TPR repeat-containing protein  28.49 
 
 		 796 aa  114  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  30.21 
 
 		 454 aa  114  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5642  Tetratricopeptide TPR_4  27.35 
 
 		 725 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00884597 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3705  TPR repeat-containing protein  28.81 
 
 		 1450 aa  113  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0896934  hitchhiker  0.00000122857 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2400  TPR repeat-containing protein  29.89 
 
 		 649 aa  113  2.0000000000000002e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.179753  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4183  tetratricopeptide TPR_4  30.66 
 
 		 944 aa  111  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166941 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  27.94 
 
 		 981 aa  111  7.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0030  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.4 
 
 		 295 aa  110  1e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  28.07 
 
 		 919 aa  110  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0939  TPR repeat-containing protein  29.52 
 
 		 714 aa  110  1e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0976  transcriptional regulator, XRE family  30.65 
 
 		 775 aa  109  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  25.18 
 
 		 1025 aa  110  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1975  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  27.6 
 
 		 3299 aa  110  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0007  TPR repeat-containing protein  25.82 
 
 		 822 aa  108  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.286469  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5481  hypothetical protein  29.32 
 
 		 698 aa  108  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0491751 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.38 
 
 		 968 aa  106  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.317983  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1546  Protein of unknown function DUF835  28.85 
 
 		 1147 aa  107  1e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.933731  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1065  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  29.94 
 
 		 1650 aa  107  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195318 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  29.67 
 
 		 1288 aa  105  3e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  30.55 
 
 		 1131 aa  105  3e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0148  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  31.03 
 
 		 560 aa  105  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.189493 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3830  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  27.47 
 
 		 3537 aa  105  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0438  signal transduction histidine kinase-like protein  29.49 
 
 		 755 aa  105  3e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.128515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54602  predicted protein  30.57 
 
 		 740 aa  105  4e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  34.95 
 
 		 1040 aa  104  8e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0840  TPR repeat-containing protein  29.39 
 
 		 1371 aa  103  1e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1770  Tetratricopeptide TPR_4  25.93 
 
 		 741 aa  103  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.430666  normal  0.588831 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  38.36 
 
 		 2413 aa  103  2e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1271  hypothetical protein  29.43 
 
 		 884 aa  103  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>