More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0626 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_0626  tetratricopeptide TPR_2  100 
 
 
2059 aa  4244    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00762464 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2266  tetratricopeptide TPR_2  52.56 
 
 
1213 aa  766    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  23.8 
 
 
1694 aa  314  1e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  23.53 
 
 
4079 aa  246  3.9999999999999997e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  19.65 
 
 
2240 aa  219  5.9999999999999996e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  21.27 
 
 
1979 aa  215  5.999999999999999e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  23.09 
 
 
927 aa  206  3e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  18.2 
 
 
1676 aa  192  5e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  21.6 
 
 
1056 aa  185  9.000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  18.97 
 
 
1069 aa  163  4e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  24.3 
 
 
878 aa  152  5e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  21.75 
 
 
1737 aa  146  4e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.2 
 
 
810 aa  142  7e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1936  TPR repeat-containing protein  21.04 
 
 
1911 aa  140  3.0000000000000003e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.261102  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  19.51 
 
 
732 aa  127  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  22.28 
 
 
795 aa  126  5e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  22.22 
 
 
3172 aa  125  9e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  24.58 
 
 
573 aa  124  1.9999999999999998e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  20.06 
 
 
1276 aa  120  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  22.88 
 
 
576 aa  119  5e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  22.59 
 
 
887 aa  117  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  21.12 
 
 
602 aa  117  3e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  21.98 
 
 
1013 aa  113  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  21.66 
 
 
1154 aa  113  4.0000000000000004e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  21.95 
 
 
1486 aa  112  5e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4437  glycosyl transferase family protein  27.11 
 
 
1061 aa  111  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  23.03 
 
 
3301 aa  109  6e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  17.97 
 
 
1138 aa  108  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  18.98 
 
 
1067 aa  107  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  21.04 
 
 
562 aa  107  4e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  23.49 
 
 
448 aa  106  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0678  extracellular ligand-binding receptor  18.76 
 
 
1073 aa  104  2e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  20.53 
 
 
543 aa  103  2e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.84 
 
 
632 aa  103  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  18.96 
 
 
2262 aa  102  9e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  23.95 
 
 
3035 aa  101  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  21.61 
 
 
2262 aa  100  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3239  tetratricopeptide TPR_2  25.91 
 
 
955 aa  99.8  5e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.502177  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  22.54 
 
 
909 aa  96.7  4e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  20.93 
 
 
750 aa  96.3  6e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  21.46 
 
 
617 aa  95.5  1e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  26.37 
 
 
816 aa  94.7  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  15.42 
 
 
1056 aa  94.7  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  25.44 
 
 
676 aa  94  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.53 
 
 
784 aa  91.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  23.15 
 
 
486 aa  91.7  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  16.46 
 
 
1056 aa  90.5  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2859  sulfotransferase  25.29 
 
 
832 aa  90.5  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.398491 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1603  TPR repeat-containing protein  22.17 
 
 
804 aa  89.4  7e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  22.22 
 
 
3560 aa  88.2  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  15.99 
 
 
1022 aa  88.6  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  21.69 
 
 
707 aa  87.8  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1334  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.69 
 
 
512 aa  87.8  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.278248  normal  0.0416734 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  22.99 
 
 
366 aa  87.8  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0022  tetratricopeptide TPR_2  29.9 
 
 
442 aa  87.4  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  21.78 
 
 
955 aa  87  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  17.81 
 
 
818 aa  85.9  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  21.61 
 
 
462 aa  85.9  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  23.2 
 
 
745 aa  85.9  0.000000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  26.64 
 
 
681 aa  85.1  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  22.17 
 
 
767 aa  85.5  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3049  TPR repeat-containing protein  23.14 
 
 
591 aa  85.1  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000157665  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  22.18 
 
 
564 aa  85.1  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1399  TPR repeat-containing protein  23.39 
 
 
450 aa  84.7  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  24.77 
 
 
824 aa  84.7  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  20 
 
 
566 aa  84.7  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2370  TPR repeat-containing protein  23.72 
 
 
425 aa  83.6  0.00000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00134041  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  22.82 
 
 
847 aa  83.6  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  27.3 
 
 
637 aa  83.6  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  20.73 
 
 
711 aa  83.2  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0995  tetratricopeptide TPR_2  20.69 
 
 
614 aa  82.4  0.00000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129848  normal  0.103443 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  21.23 
 
 
828 aa  82  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  22.11 
 
 
725 aa  82  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  22.26 
 
 
397 aa  81.6  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  24.74 
 
 
648 aa  82  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  29.58 
 
 
681 aa  81.6  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0675  TPR repeat-containing protein  26.48 
 
 
344 aa  81.6  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  19.67 
 
 
605 aa  81.3  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  21.46 
 
 
828 aa  81.3  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  21.81 
 
 
740 aa  81.6  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  16.75 
 
 
988 aa  81.6  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3235  tetratricopeptide TPR_2  42.57 
 
 
734 aa  80.5  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  23.38 
 
 
730 aa  79.7  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  20 
 
 
436 aa  79  0.0000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  23.41 
 
 
865 aa  79  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  24.68 
 
 
732 aa  77.8  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  21.11 
 
 
4489 aa  78.2  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  22.37 
 
 
3145 aa  77.8  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0156  TPR repeat-containing protein  20.75 
 
 
955 aa  77  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  27.02 
 
 
739 aa  77  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0691  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  18.49 
 
 
883 aa  76.6  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.953113 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  26.87 
 
 
685 aa  76.6  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3197  O-GlcNAc transferase, p110 subunit  21.86 
 
 
395 aa  76.6  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.187148  normal  0.017581 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  24.66 
 
 
764 aa  76.3  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0133  TPR repeat-containing protein  23.58 
 
 
393 aa  76.3  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.310931  normal  0.0473724 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1712  TPR repeat-containing protein  20.94 
 
 
817 aa  76.3  0.000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.347733  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  26.29 
 
 
875 aa  76.3  0.000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2400  TPR repeat-containing protein  25.13 
 
 
520 aa  75.9  0.000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.38799 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  19.03 
 
 
1297 aa  75.9  0.000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  29.82 
 
 
560 aa  75.9  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>