More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0365 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0365  protease Do  100 
 
 
459 aa  919  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0347  protease Do  98.69 
 
 
459 aa  908  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.342826  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1797  protease Do  59.11 
 
 
452 aa  530  1e-149  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1007  protease Do  55.75 
 
 
453 aa  466  1e-130  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  2.15082e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0031  protease Do  51.19 
 
 
453 aa  435  1e-120  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00831551  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0715  protease Do  39.25 
 
 
500 aa  295  1e-78  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00445387  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  39.83 
 
 
473 aa  293  4e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  38.43 
 
 
476 aa  288  1e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  38.15 
 
 
482 aa  286  6e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  38.71 
 
 
457 aa  285  1e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  37.72 
 
 
464 aa  282  9e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.6609e-07  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1900  peptidase S1C, Do  39.73 
 
 
489 aa  280  5e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1102  protease Do  37.58 
 
 
469 aa  280  5e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.432426  normal  0.334771 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  38.89 
 
 
458 aa  279  6e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0736  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.97 
 
 
386 aa  279  8e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  1.82436e-09  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  38.76 
 
 
481 aa  279  9e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1628  peptidase S1C, Do  37.55 
 
 
478 aa  278  1e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2024  peptidase S1C, Do  34.5 
 
 
473 aa  278  1e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.115837  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1208  protease Do  38.57 
 
 
475 aa  277  2e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  38.52 
 
 
478 aa  277  3e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5561  peptidase S1C, Do  38.78 
 
 
488 aa  277  4e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  35.98 
 
 
474 aa  276  4e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  38.64 
 
 
472 aa  276  5e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3616  protease Do  39.54 
 
 
467 aa  275  1e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184725  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  37.64 
 
 
471 aa  275  2e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  35.56 
 
 
474 aa  275  2e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  38.66 
 
 
466 aa  274  2e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  8.36052e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  37.73 
 
 
476 aa  274  2e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13730  HtrA serine protease  35 
 
 
473 aa  274  2e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0853  serine protease  38.38 
 
 
495 aa  273  5e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1012  serine protease  38.38 
 
 
495 aa  273  5e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0848  serine protease  38.38 
 
 
495 aa  273  5e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.580249  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0310  serine protease  38.38 
 
 
495 aa  273  5e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.636573  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0053  serine protease  38.38 
 
 
483 aa  273  6e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2439  serine protease  38.38 
 
 
483 aa  273  6e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0675  serine protease  38.82 
 
 
495 aa  273  6e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0605  serine protease  38.38 
 
 
483 aa  273  6e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0197  HtrA2 peptidase  48.22 
 
 
369 aa  273  7e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0040  protease Do  37.66 
 
 
484 aa  272  8e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0701  serine protease  37.85 
 
 
503 aa  271  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  38.43 
 
 
464 aa  271  1e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0999  protease Do  37.94 
 
 
461 aa  272  1e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0682  protease Do  38.9 
 
 
494 aa  271  2e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.160737  normal  0.370456 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3265  protease Do  37.55 
 
 
504 aa  271  2e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1471  protease Do  35.43 
 
 
474 aa  270  3e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  37.5 
 
 
502 aa  270  4e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  37.09 
 
 
480 aa  270  5e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  38.94 
 
 
462 aa  268  1e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2536  protease Do  38.38 
 
 
494 aa  267  2e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.483569  normal  0.898326 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2663  protease Do  38.24 
 
 
494 aa  267  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3955  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  35.17 
 
 
481 aa  268  2e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1467  serine protease, MucD  34.59 
 
 
473 aa  267  3e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.627151  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1749  peptidase S1C, Do  35.4 
 
 
473 aa  267  3e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2091  peptidase S1C, Do  35.24 
 
 
464 aa  266  4e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1378  HtrA2 peptidase  46.95 
 
 
379 aa  267  4e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  4.2799e-08 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1773  protease Do  38.38 
 
 
489 aa  267  4e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  2.25032e-08  hitchhiker  0.000850393 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5947  peptidase S1C, Do  38.16 
 
 
494 aa  266  5e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  38.13 
 
 
476 aa  266  5e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  7.81376e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1726  serine protease, MucD  34.2 
 
 
485 aa  266  5e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2956  protease Do  40.13 
 
 
472 aa  266  6e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  4.60419e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  39.17 
 
 
476 aa  266  6e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0833  protease DO  39.62 
 
 
497 aa  266  7e-70  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0653734  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1365  peptidase S1C, Do  33.67 
 
 
482 aa  265  9e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0859447  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2645  protease Do  38.38 
 
 
493 aa  265  9e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2616  protease Do  38.38 
 
 
493 aa  265  9e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2898  peptidase  34.63 
 
 
485 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  36.46 
 
 
483 aa  265  1e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2470  serine protease, MucD  34.85 
 
 
502 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2811  serine protease, MucD  34.85 
 
 
502 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0539  serine protease, MucD  34.63 
 
 
461 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.794345  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1793  serine protease, MucD  34.85 
 
 
502 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2845  Do family protease  34.63 
 
 
502 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2783  Do family protease  34.63 
 
 
502 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96749  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4221  serine protease, MucD  35.51 
 
 
479 aa  265  1e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.560498  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  36.25 
 
 
483 aa  265  1e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  33.95 
 
 
479 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  38.34 
 
 
476 aa  264  2e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0610  serine protease  36.14 
 
 
513 aa  265  2e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2006  peptidase S1C, Do  38.16 
 
 
493 aa  265  2e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0611  serine protease  36.14 
 
 
513 aa  265  2e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0837  protease Do  34.06 
 
 
502 aa  264  3e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2386  protease Do  37.2 
 
 
491 aa  263  4e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0986  HtrA2 peptidase  46.63 
 
 
382 aa  263  4e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00462206 
 
 
-
 
NC_002620  TC0210  serine protease  40.44 
 
 
497 aa  263  5e-69  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.187881  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2161  protease Do  36.97 
 
 
524 aa  263  6e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  36.83 
 
 
475 aa  263  6e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  37.58 
 
 
483 aa  262  9e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1599  serine protease, MucD, putative  36.24 
 
 
504 aa  261  1e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.210077  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  35.37 
 
 
487 aa  261  2e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1382  protease Do  33.75 
 
 
514 aa  260  3e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.490263  normal  0.542535 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  32.85 
 
 
492 aa  260  3e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  32.85 
 
 
477 aa  260  4e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1855  protease Do  37.5 
 
 
504 aa  260  4e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.19147  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3198  protease Do  38.16 
 
 
474 aa  260  4e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  33.26 
 
 
477 aa  260  4e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0471  protease Do  37.53 
 
 
500 aa  260  4e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0438945 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0984  protease Do  39.49 
 
 
485 aa  259  5e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0747  protease Do  36.5 
 
 
511 aa  259  9e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  3.07319e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0763  protease Do  36.68 
 
 
501 aa  258  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4242  peptidase S1C, Do  34.6 
 
 
500 aa  258  1e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>