More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2475 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2475  MATE efflux family protein  100 
 
 		 463 aa  937    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.211957  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2425  MATE efflux family protein  49.67 
 
 		 461 aa  473  1e-132  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.264518  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0743  MATE efflux family protein  28.27 
 
 		 484 aa  192  1e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000192336  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1138  MATE efflux family protein  28.79 
 
 		 450 aa  164  3e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000318212  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0330  MATE efflux family protein  29.42 
 
 		 479 aa  159  9e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0279  MATE efflux family protein  26.56 
 
 		 445 aa  157  3e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2828  MATE efflux family protein  28.18 
 
 		 463 aa  154  4e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2514  MATE efflux family protein  27.97 
 
 		 463 aa  153  5e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0621  MATE efflux family protein  28.51 
 
 		 460 aa  152  2e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.27098  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2766  MATE efflux family protein  26.13 
 
 		 453 aa  150  6e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0984562  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0994  MATE efflux family protein  27.79 
 
 		 449 aa  148  2.0000000000000003e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0897  MATE efflux family protein  25.76 
 
 		 453 aa  147  5e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000262958  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0537  hypothetical protein  26.78 
 
 		 460 aa  136  6.0000000000000005e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0830  MATE efflux family protein  25.17 
 
 		 445 aa  136  7.000000000000001e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000918772  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0857  MATE efflux family protein  25.97 
 
 		 458 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1116  MATE efflux family protein  27.31 
 
 		 456 aa  131  3e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0848  MATE efflux family protein  25.75 
 
 		 458 aa  131  3e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.720761  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0522  MATE efflux family protein  23.78 
 
 		 461 aa  119  9e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0597  hypothetical protein  25.06 
 
 		 444 aa  115  1.0000000000000001e-24  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1981  MATE efflux family protein  23.63 
 
 		 455 aa  111  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000219259  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0596  hypothetical protein  24.02 
 
 		 449 aa  110  6e-23  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.207285  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05715  Na+-driven multidrug efflux pump  24.01 
 
 		 461 aa  107  4e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2022  multidrug efflux pump  23.34 
 
 		 459 aa  103  5e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.54695  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000109  adhesin  22.1 
 
 		 461 aa  97.4  5e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.466925  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  27.41 
 
 		 462 aa  93.6  6e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1343  MATE efflux family protein  27.39 
 
 		 464 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000317655  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  24.34 
 
 		 475 aa  92.4  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1094  MATE efflux family protein  27.46 
 
 		 464 aa  92  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000923462  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1266  MATE efflux family protein  27.07 
 
 		 464 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  24.58 
 
 		 469 aa  90.9  4e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1106  MATE efflux family protein  27.07 
 
 		 464 aa  90.5  6e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000560081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1088  efflux protein  27.07 
 
 		 464 aa  90.5  6e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000024435  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1082  efflux protein  27.07 
 
 		 464 aa  90.5  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000125629  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1196  MATE efflux family protein  27.07 
 
 		 464 aa  90.5  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000655029  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1239  MATE efflux family protein  26.75 
 
 		 464 aa  90.1  7e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.238085  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0427  MATE efflux family protein  24.56 
 
 		 446 aa  90.1  7e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.744275  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0687  DNA damage inducible protein - mate transporter family  23.28 
 
 		 540 aa  90.1  8e-17  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4103  Na+ driven multidrug efflux pump  26.75 
 
 		 463 aa  89.7  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0660054  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1305  MATE efflux family protein  27.07 
 
 		 464 aa  89  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.40401  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0347  MATE efflux family protein  25.45 
 
 		 454 aa  87.8  4e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000816576  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01896  predicted multidrug efflux system  24.88 
 
 		 547 aa  87.4  5e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0202846  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01885  hypothetical protein  24.88 
 
 		 547 aa  87.4  5e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0187925  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2267  hypothetical protein  24.88 
 
 		 546 aa  87  6e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000010697  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1669  MATE efflux family protein  23.69 
 
 		 495 aa  86.7  7e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135228  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1139  hypothetical protein  23.69 
 
 		 484 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000023845  hitchhiker  0.0000334983 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  25.59 
 
 		 438 aa  86.3  0.000000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1252  MATE efflux family protein  23.79 
 
 		 445 aa  86.3  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000131388  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2829  hypothetical protein  23.48 
 
 		 484 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000399298  normal  0.437543 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1659  hypothetical protein  23.69 
 
 		 495 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000439345  normal  0.0451104 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2108  hypothetical protein  24.63 
 
 		 546 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.24671e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  24.05 
 
 		 483 aa  84.7  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3712  MATE efflux family protein  25.6 
 
 		 454 aa  84.3  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.139203  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  26.03 
 
 		 468 aa  84.3  0.000000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1237  hypothetical protein  22.22 
 
 		 458 aa  83.2  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0290804  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0901  MATE efflux family protein  25.79 
 
 		 463 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000627796  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  27.61 
 
 		 445 aa  81.3  0.00000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  23.81 
 
 		 468 aa  80.9  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  26.53 
 
 		 458 aa  80.9  0.00000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09173  MATE efflux family protein  27.95 
 
 		 457 aa  79.7  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0743  MATE efflux family protein  28.18 
 
 		 454 aa  78.6  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193663  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  26.84 
 
 		 469 aa  77.8  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003772  Na+ driven multidrug efflux pump  20.48 
 
 		 458 aa  78.2  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3106  hypothetical protein  25.74 
 
 		 484 aa  77.8  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.20256 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  24.35 
 
 		 453 aa  77.8  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  26.09 
 
 		 477 aa  77.8  0.0000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1419  MATE efflux family protein  25.16 
 
 		 469 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.703884  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  27.04 
 
 		 525 aa  77.4  0.0000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2574  hypothetical protein  23.44 
 
 		 480 aa  77.4  0.0000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  24.49 
 
 		 463 aa  77.4  0.0000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.403976 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  27.1 
 
 		 481 aa  77  0.0000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3760  MATE efflux family protein  21.31 
 
 		 464 aa  76.6  0.0000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1641  MATE efflux family protein  26.53 
 
 		 469 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.725642  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0381  MATE efflux family protein  24.94 
 
 		 451 aa  75.9  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00954667  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0651  MATE efflux family protein  25.65 
 
 		 446 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000388571  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0691  MATE efflux family protein  24.01 
 
 		 450 aa  75.1  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0688  DNA damage inducible protein - mate transporter family  21 
 
 		 521 aa  74.7  0.000000000003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0875  mate efflux family protein  25.9 
 
 		 446 aa  75.1  0.000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02650  hypothetical protein  20.22 
 
 		 458 aa  74.3  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000940  Na+ driven multidrug efflux pump  24.59 
 
 		 446 aa  74.3  0.000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000926882  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1767  MATE efflux family protein  22.32 
 
 		 462 aa  74.3  0.000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1295  multidrug efflux protein  24.56 
 
 		 453 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0578421  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  25.95 
 
 		 469 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  25.95 
 
 		 469 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1402  multidrug efflux protein  24.56 
 
 		 453 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1823  putative MATE efflux protein  25.95 
 
 		 469 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3557  putative MATE efflux protein  26.09 
 
 		 469 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  24.73 
 
 		 460 aa  73.6  0.000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1472  multidrug efflux protein  24.27 
 
 		 453 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1501  multidrug efflux protein  23.98 
 
 		 454 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1846  integral membrane protein, putative  25.88 
 
 		 469 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563684  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1641  Na+ driven multidrug antiporter, N-terminus  28.84 
 
 		 238 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.908649  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1267  multidrug efflux protein  23.98 
 
 		 453 aa  72  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1899  putative MATE efflux protein  25.88 
 
 		 469 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00227155  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0299  MATE efflux family protein  24.02 
 
 		 456 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000180901  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06935  Na+-driven multidrug efflux pump  24.59 
 
 		 446 aa  71.2  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1890  MATE efflux family protein  24.12 
 
 		 442 aa  70.9  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1787  putative MATE efflux protein  28.84 
 
 		 469 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  23.99 
 
 		 448 aa  70.5  0.00000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0293  MATE efflux family protein  28.74 
 
 		 467 aa  70.5  0.00000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1654  MATE efflux family protein  26.09 
 
 		 473 aa  70.5  0.00000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>