More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0045 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0045  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
451 aa  898  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.717523  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.23 
 
 
689 aa  218  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0208  TPR repeat-containing protein  35.95 
 
 
923 aa  209  1e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.877042 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3075  TPR repeat-containing protein  34.87 
 
 
780 aa  201  3e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  34.86 
 
 
1038 aa  198  2e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  31.5 
 
 
523 aa  195  2e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6369  TPR repeat-containing protein  31.92 
 
 
607 aa  193  5e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  33.48 
 
 
1827 aa  192  1e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  32.47 
 
 
601 aa  190  5e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6627  TPR repeat-containing protein  35.88 
 
 
611 aa  189  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0378674 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  34.04 
 
 
3145 aa  188  2e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0564  TPR repeat-containing protein  33.63 
 
 
505 aa  186  6e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  33.18 
 
 
592 aa  185  1e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3808  TPR repeat-containing protein  33.63 
 
 
578 aa  182  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.556982 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  33.64 
 
 
1450 aa  181  3e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0047  TPR repeat-containing protein  34.04 
 
 
788 aa  180  4e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.210348  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1060  TPR repeat-containing protein  35.08 
 
 
558 aa  179  6e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.325724  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  33.26 
 
 
740 aa  179  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  32.88 
 
 
767 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  34 
 
 
688 aa  176  5e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  31.19 
 
 
626 aa  176  6e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3833  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.09 
 
 
760 aa  176  6e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00358812 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  30.88 
 
 
648 aa  176  7e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  32.14 
 
 
620 aa  174  2e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  32.62 
 
 
620 aa  175  2e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  33.82 
 
 
574 aa  173  6e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3016  TPR/sulfotransferase domain-containing protein  31.92 
 
 
577 aa  172  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  30.07 
 
 
550 aa  172  2e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  28.9 
 
 
955 aa  170  4e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1067  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
747 aa  170  6e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.905012 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  29.88 
 
 
602 aa  169  6e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6027  TPR repeat-containing protein  30.47 
 
 
571 aa  169  9e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0697264  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2201  TPR repeat-containing protein  34.53 
 
 
556 aa  169  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805282  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6628  TPR repeat-containing protein  32.04 
 
 
588 aa  169  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587879 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0066  TPR repeat-containing protein  31.71 
 
 
545 aa  168  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.152932  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2985  sulfotransferase  30.72 
 
 
1077 aa  168  2e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.55 
 
 
1034 aa  167  3e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2727  TPR repeat-containing protein  30.25 
 
 
573 aa  167  4e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3825  TPR repeat-containing protein  31.13 
 
 
559 aa  166  6e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0599  TPR repeat-containing protein  31.55 
 
 
593 aa  166  7e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  31.28 
 
 
542 aa  166  8e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  32.1 
 
 
608 aa  166  8e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  30.54 
 
 
703 aa  166  9e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  30.23 
 
 
935 aa  166  1e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1756  glycosyl transferase family 2  32.85 
 
 
1073 aa  165  1e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.784743  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2700  TPR repeat-containing protein  30.39 
 
 
496 aa  166  1e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00571929  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1547  TPR domain-containing protein  32.34 
 
 
473 aa  165  1e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.661842  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0339  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.37 
 
 
545 aa  166  1e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2537  TPR repeat-containing protein  33.49 
 
 
412 aa  164  2e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.795786  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  31.67 
 
 
614 aa  164  2e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2088  tetratricopeptide TPR_2  30.39 
 
 
600 aa  165  2e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311183  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  31.39 
 
 
626 aa  164  2e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  31.39 
 
 
614 aa  164  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  31.39 
 
 
614 aa  164  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  31.39 
 
 
614 aa  164  3e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2617  TPR repeat-containing protein  32.29 
 
 
545 aa  164  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4648  TPR repeat-containing protein  31.18 
 
 
520 aa  164  4e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.91098 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  30.42 
 
 
614 aa  163  5e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1170  TPR repeat-containing protein  32.72 
 
 
472 aa  163  6e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126874  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3353  Exostosin family protein  33.09 
 
 
872 aa  163  7e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0479946  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  30.02 
 
 
1005 aa  162  8e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  30.68 
 
 
626 aa  162  8e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1219  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.56 
 
 
604 aa  162  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2752  TPR repeat-containing protein  32.05 
 
 
545 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2412  TPR repeat-containing protein  30.21 
 
 
529 aa  162  1e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4231  TPR repeat-containing protein  34.59 
 
 
536 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.308845 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4384  hypothetical protein  31.33 
 
 
546 aa  162  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3354  TPR repeat-containing protein  30.86 
 
 
1212 aa  160  3e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0141  TPR repeat-containing protein  29.86 
 
 
438 aa  161  3e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00386004  normal  0.115434 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0550  TPR repeat-containing protein  29.83 
 
 
595 aa  160  5e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.492764  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5809  TPR repeat-containing protein  31.99 
 
 
546 aa  160  5e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.520553 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  30.89 
 
 
714 aa  160  6e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  32 
 
 
615 aa  160  6e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2618  hypothetical protein  29.65 
 
 
630 aa  159  7e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3866  TPR repeat protein  29.01 
 
 
1677 aa  159  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2681  TPR domain protein  29.77 
 
 
653 aa  158  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2307  TPR repeat-containing protein  29.77 
 
 
653 aa  158  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  30.07 
 
 
714 aa  157  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1712  TPR repeat-containing protein  30.69 
 
 
595 aa  157  5e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.884408 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1568  TPR repeat-containing protein  30.28 
 
 
487 aa  157  5e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  29.57 
 
 
662 aa  156  9e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1661  TPR repeat-containing protein  31.98 
 
 
502 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0601508  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1181  tetratricopeptide TPR_2  31.98 
 
 
502 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.591026  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  31.21 
 
 
639 aa  155  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1212  hypothetical protein  32.49 
 
 
385 aa  154  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1398  TPR repeat-containing protein  29.82 
 
 
484 aa  154  2e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1635  TPR repeat-containing protein  31.42 
 
 
502 aa  154  3e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628977  normal  0.0608615 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1949  TPR repeat-containing protein  33.43 
 
 
598 aa  154  3e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.411479  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2044  TPR domain-containing protein  33.43 
 
 
598 aa  154  3e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0462  TPR domain-containing protein  33.43 
 
 
711 aa  154  3e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.317996  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  30.9 
 
 
646 aa  154  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0955  TPR domain-containing protein  34.09 
 
 
705 aa  154  4e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.497218  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1516  TPR domain-containing protein  32.52 
 
 
360 aa  153  6e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  29.32 
 
 
1764 aa  153  6e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3326  TPR repeat-containing protein  32.23 
 
 
607 aa  153  6e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.644925 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0308  TPR repeat-containing protein  33.64 
 
 
636 aa  153  6e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0115  TPR repeat-containing protein  30.65 
 
 
579 aa  152  9e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.165397  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1361  hypothetical protein  30.73 
 
 
499 aa  152  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.995153  normal  0.533699 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2766  Tetratricopeptide TPR_4  30.17 
 
 
492 aa  152  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392213  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  30.59 
 
 
649 aa  151  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>