More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6450 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6450  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 188 aa  373  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000363867  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5011  putative transcriptional regulator, TetR family  55.49 
 
 		 203 aa  189  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4153  TetR family transcriptional regulator  54.97 
 
 		 201 aa  186  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0444312  normal  0.572162 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  55.56 
 
 		 195 aa  176  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6635  TetR family transcriptional regulator  52.25 
 
 		 214 aa  168  4e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0435  TetR family transcriptional regulator  46.99 
 
 		 184 aa  157  6e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0423  transcriptional regulator, TetR family  48.09 
 
 		 184 aa  147  8e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.567311  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0523  TetR family transcriptional regulator  39.89 
 
 		 184 aa  140  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2145  regulatory protein TetR  48.42 
 
 		 202 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4348  TetR family transcriptional regulator  48.59 
 
 		 174 aa  135  4e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1469  regulatory protein TetR  50.79 
 
 		 209 aa  134  6.0000000000000005e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.520835 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7965  transcriptional regulator, TetR family  45.5 
 
 		 192 aa  134  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3964  regulatory protein, TetR  47.46 
 
 		 174 aa  133  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3643  TetR family transcriptional regulator  48.63 
 
 		 193 aa  129  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6201  transcriptional regulator, TetR family  44.15 
 
 		 189 aa  129  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0829103  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 196 aa  125  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3313  transcriptional regulator, TetR family  43.48 
 
 		 209 aa  121  6e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  36.11 
 
 		 182 aa  121  7e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4464  transcriptional regulator, TetR family  42.7 
 
 		 188 aa  119  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129958  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2753  transcriptional regulator, TetR family  41.94 
 
 		 197 aa  118  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3327  transcriptional regulator, TetR family  45.95 
 
 		 185 aa  114  6.9999999999999995e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.11213  normal  0.13372 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2829  regulatory protein TetR  47.54 
 
 		 203 aa  113  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4437  TetR family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 192 aa  113  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4064  regulatory protein TetR  44.19 
 
 		 190 aa  113  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.3318 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2460  transcriptional regulator TetR family  40.78 
 
 		 231 aa  113  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  40.32 
 
 		 197 aa  109  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.806773 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  43.09 
 
 		 299 aa  108  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0329  transcriptional regulator, TetR family  42.39 
 
 		 196 aa  108  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.330162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5119  transcriptional regulator, TetR family  41.01 
 
 		 189 aa  108  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.891225  normal  0.419875 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0570  transcriptional regulator, TetR family  35.87 
 
 		 188 aa  108  7.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0528  TetR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 192 aa  105  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0257  transcriptional regulator, TetR family  36.98 
 
 		 188 aa  104  7e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0512  TetR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 201 aa  104  7e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  37.16 
 
 		 199 aa  104  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5801  regulatory protein TetR  37.7 
 
 		 190 aa  104  8e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.813515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  38.22 
 
 		 194 aa  103  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0327  TetR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 211 aa  101  6e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.159849 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2095  transcriptional regulator, TetR family  38.59 
 
 		 194 aa  101  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546455  normal  0.514839 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6690  TetR family transcriptional regulator  38.12 
 
 		 250 aa  100  9e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1452  transcriptional regulator, TetR family  39.56 
 
 		 199 aa  100  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  39.89 
 
 		 199 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5172  transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 		 188 aa  99.4  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5863  transcriptional regulator, TetR family  41.9 
 
 		 186 aa  99  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.602897  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1139  TetR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 193 aa  98.6  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2714  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 183 aa  98.6  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000526113  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2557  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 186 aa  98.6  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0403  transcriptional regulator, TetR family  38.25 
 
 		 213 aa  97.8  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472446  normal  0.522596 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2583  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 184 aa  97.1  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6198  transcriptional regulator, TetR family  38.59 
 
 		 193 aa  97.4  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  normal  0.545762 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2527  transcriptional regulator, TetR family  37.78 
 
 		 207 aa  96.3  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4514  TetR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 202 aa  96.3  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.603185  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2182  transcriptional regulator, TetR family  37.95 
 
 		 207 aa  95.1  6e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4743  transcriptional regulator, TetR family  34.2 
 
 		 213 aa  94.4  9e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.832036  normal  0.727268 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6680  transcriptional regulator, TetR family  37.64 
 
 		 176 aa  94  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0143  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 266 aa  93.2  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170765  normal  0.0134311 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2868  TetR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 184 aa  92.4  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0239599 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2770  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 195 aa  92  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1648  transcriptional regulator, TetR family  35.2 
 
 		 199 aa  91.7  6e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.298566  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3217  TetR family transcriptional regulator  40.76 
 
 		 207 aa  91.7  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5586  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 191 aa  91.7  7e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6123  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 232 aa  90.9  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.417481  normal  0.0113351 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  34.04 
 
 		 205 aa  90.9  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.682663 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2446  transcriptional regulator, TetR family  38.41 
 
 		 229 aa  90.9  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.8444  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0142  TetR family transcriptional regulator  36.87 
 
 		 184 aa  90.5  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3849  transcriptional regulator, TetR family  37.1 
 
 		 211 aa  89.7  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.782429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0763  TetR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 186 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.711774 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5811  transcriptional regulator, TetR family  39.68 
 
 		 222 aa  90.1  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8965  putative transcriptional regulator, TetR family  34.44 
 
 		 173 aa  89.4  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1988  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 181 aa  89.4  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0948482  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4255  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 223 aa  89.4  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.228182 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0387  regulatory protein TetR  35.87 
 
 		 211 aa  88.6  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.618226  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4423  regulatory protein TetR  40.13 
 
 		 223 aa  88.6  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.310024  normal  0.345836 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3163  putative transcriptional regulator, TetR family  34.41 
 
 		 223 aa  88.6  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0982  regulatory protein TetR  39.01 
 
 		 188 aa  88.2  6e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2757  transcriptional regulator, TetR family  34.76 
 
 		 179 aa  88.2  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1059  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 217 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1050  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 193 aa  86.7  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0597  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 194 aa  86.3  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  37.25 
 
 		 259 aa  86.7  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27620  transcriptional regulator  41.98 
 
 		 208 aa  85.9  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.475426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5157  transcriptional regulator, TetR family  38.66 
 
 		 193 aa  85.1  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4823  transcriptional regulator, TetR family  33.88 
 
 		 219 aa  85.1  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2944  regulatory protein, TetR  39.33 
 
 		 195 aa  85.1  6e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0291175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3286  transcriptional regulator, TetR family  35.75 
 
 		 192 aa  84.7  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4064  transcriptional regulator, TetR family  35.16 
 
 		 196 aa  84.7  8e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.528803  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1060  TetR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 227 aa  84  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0606  TetR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 194 aa  83.2  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4122  TetR family transcriptional regulator  35.36 
 
 		 204 aa  83.6  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.937449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0619  TetR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 194 aa  83.2  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.594999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1543  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 236 aa  83.2  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.470889 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19730  transcriptional regulator, tetR family  37.08 
 
 		 182 aa  82.8  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.453369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4614  transcriptional regulator, TetR family  32.8 
 
 		 222 aa  82  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2004  transcriptional regulator, TetR family  36.93 
 
 		 193 aa  82  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.028996  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2574  transcriptional regulator, TetR family  36.61 
 
 		 204 aa  81.6  0.000000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4328  transcriptional regulator, TetR family  35.56 
 
 		 196 aa  80.9  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2496  TetR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 198 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2209  putative transcriptional regulator, TetR family  37.11 
 
 		 202 aa  79.3  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.594451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3165  TetR family transcriptional regulator  39.89 
 
 		 195 aa  79.3  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.871472  hitchhiker  0.000418088 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0401  transcriptional regulator, TetR family  27.32 
 
 		 245 aa  78.6  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0464223  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2205  transcriptional regulator, TetR family  34.69 
 
 		 196 aa  78.6  0.00000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>