More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2883 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2883  RluA family pseudouridine synthase  100 
 
 		 309 aa  622  1e-177  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.464437  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1420  pseudouridine synthase, RluA family  81.23 
 
 		 310 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.276517 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2911  pseudouridine synthase, RluA family  78.96 
 
 		 309 aa  484  1e-136  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000259384  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1123  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  77.99 
 
 		 309 aa  467  9.999999999999999e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.095131  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0912  pseudouridine synthase, RluA family  78.36 
 
 		 308 aa  462  1e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5735  pseudouridine synthase, RluA family  69.9 
 
 		 312 aa  452  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27270  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  70.59 
 
 		 308 aa  441  1e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.42777  normal  0.302751 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5746  pseudouridine synthase, RluA family  68.4 
 
 		 310 aa  437  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3188  pseudouridine synthase, RluA family  72.61 
 
 		 307 aa  428  1e-119  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.337422 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2627  pseudouridine synthase, RluA family  66.23 
 
 		 308 aa  419  1e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.981062  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3195  pseudouridine synthase, RluA family  67.54 
 
 		 308 aa  416  9.999999999999999e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000221583  hitchhiker  0.000231767 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3427  RluA family pseudouridine synthase  70.2 
 
 		 314 aa  416  9.999999999999999e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0544491 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5086  RluA family pseudouridine synthase  70.43 
 
 		 313 aa  407  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00722052  hitchhiker  0.000548014 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2401  pseudouridine synthase, RluA family  69.64 
 
 		 309 aa  406  1.0000000000000001e-112  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.556381 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3201  RluA family pseudouridine synthase  69.21 
 
 		 314 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.887852 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4000  pseudouridine synthase RluA family  64.14 
 
 		 312 aa  397  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.782666 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22700  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  65.36 
 
 		 311 aa  401  9.999999999999999e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.17143 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3248  pseudouridine synthase, RluA family  68.4 
 
 		 315 aa  394  1e-108  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.421856  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3112  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  65.78 
 
 		 304 aa  391  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.233987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3092  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  65.78 
 
 		 304 aa  391  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.598347  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1032  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  67.43 
 
 		 314 aa  391  1e-108  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.55205  normal  0.0222288 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3052  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  65.13 
 
 		 312 aa  392  1e-108  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159413  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3152  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  65.78 
 
 		 304 aa  391  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.311943 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16460  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  60.86 
 
 		 309 aa  389  1e-107  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.448971  normal  0.0163428 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3639  RluA family pseudouridine synthase  65.78 
 
 		 309 aa  391  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.323041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1426  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  67.89 
 
 		 313 aa  390  1e-107  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.128873  normal  0.0393122 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1084  pseudouridine synthase, RluA family  61.64 
 
 		 313 aa  388  1e-107  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2774  RluA family pseudouridine synthase  64.69 
 
 		 309 aa  381  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.538883  normal  0.492186 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2995  pseudouridine synthase, RluA family  63.93 
 
 		 308 aa  380  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.34011  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1294  pseudouridine synthase, RluA family  68.87 
 
 		 310 aa  376  1e-103  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.377146  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1580  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  61.59 
 
 		 308 aa  375  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0928054  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1605  pseudouridine synthase, RluA family  67.65 
 
 		 311 aa  371  1e-102  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11573  pseudouridylate synthase  62.83 
 
 		 308 aa  370  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10900  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  57.43 
 
 		 308 aa  346  3e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.295076  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1581  pseudouridine synthase, RluA family  60.59 
 
 		 308 aa  345  6e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0661846 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13500  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  57.28 
 
 		 320 aa  323  2e-87  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1115  pseudouridine synthase, RluA family  43.85 
 
 		 321 aa  255  6e-67  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.494763 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2289  pseudouridine synthase, RluA family  44.41 
 
 		 310 aa  221  9.999999999999999e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.677026 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2235  RluA family pseudouridine synthase  44.95 
 
 		 313 aa  218  1e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.894524  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2034  pseudouridine synthase, RluA family  42.58 
 
 		 319 aa  218  2e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1186  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  40.2 
 
 		 300 aa  215  5.9999999999999996e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000204845  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3159  pseudouridine synthase, RluA family  42.15 
 
 		 329 aa  213  1.9999999999999998e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1604  pseudouridine synthase, RluA family  44.14 
 
 		 331 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.357256  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1335  RluA family pseudouridine synthase  41.16 
 
 		 327 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000257398  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09330  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  37.22 
 
 		 308 aa  212  4.9999999999999996e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00125155  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1014  pseudouridylate synthase, 23S RNA-specific  39.19 
 
 		 304 aa  212  7e-54  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000716198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3127  pseudouridine synthase, RluA family  43.33 
 
 		 327 aa  210  2e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0254  RluA family pseudouridine synthase  43.05 
 
 		 316 aa  211  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128568  normal  0.0139126 
 
 
-
 
NC_002936  DET1375  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  39.39 
 
 		 300 aa  210  3e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000447138  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0810  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  42.67 
 
 		 318 aa  210  3e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.043607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0815  pseudouridine synthase, RluA family  43.28 
 
 		 315 aa  207  2e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.689288  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1082  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  37.98 
 
 		 301 aa  206  3e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.463864  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1079  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  40.42 
 
 		 304 aa  206  3e-52  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1156  ribosomal large subunit pseudouridine synthase, RluD subfamily  39.39 
 
 		 302 aa  206  5e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0116106  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4642  pseudouridine synthase, RluA family  41.02 
 
 		 313 aa  205  7e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000189125  normal  0.973939 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1856  RluA family pseudouridine synthase  41.93 
 
 		 327 aa  205  9e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0141  23S RNA-specific pseudouridylate synthase  51.53 
 
 		 258 aa  204  1e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.230336  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0881  RluA family pseudouridine synthase  41.46 
 
 		 320 aa  204  1e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000267472  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1237  RluA family pseudouridine synthase  40.88 
 
 		 334 aa  202  5e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.289539  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3086  pseudouridine synthase, RluA family  42.41 
 
 		 341 aa  202  7e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.226558 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1813  pseudouridine synthase, RluA family  36.6 
 
 		 303 aa  202  8e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4022  pseudouridine synthase, RluA family  41.28 
 
 		 334 aa  202  8e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000767359  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1918  pseudouridylate synthase  41.25 
 
 		 331 aa  202  8e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.313476  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0949  RluA family pseudouridine synthase  41.83 
 
 		 309 aa  201  9.999999999999999e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4547  RluA family pseudouridine synthase  40 
 
 		 352 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2253  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  44.9 
 
 		 391 aa  200  3e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00391915  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0664  23S rRNA pseudouridine synthase D  41.19 
 
 		 324 aa  200  3e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.0008107  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0282  RluA family pseudouridine synthase  41.03 
 
 		 315 aa  200  3e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.418859  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1651  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  40.88 
 
 		 347 aa  199  6e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1598  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  40.88 
 
 		 334 aa  199  6e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.8835  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3343  pseudouridine synthase, RluA family  41.14 
 
 		 341 aa  199  7e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0105982 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0458  RluA family pseudouridine synthase  38.91 
 
 		 311 aa  198  7.999999999999999e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004394  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  42.44 
 
 		 325 aa  198  9e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.530574  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3499  lysozyme  42.09 
 
 		 323 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.847735  normal  0.0395097 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0497  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  41.72 
 
 		 325 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.553412  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2104  RluA family pseudouridine synthase  36.88 
 
 		 306 aa  198  1.0000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0967  RluA family pseudouridine synthase  43.49 
 
 		 436 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0554  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  39.5 
 
 		 296 aa  198  1.0000000000000001e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0069072  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3657  RluA family pseudouridine synthase  41.86 
 
 		 344 aa  198  1.0000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0134519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0878  RluA family pseudouridine synthase  42.02 
 
 		 325 aa  198  1.0000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.175115  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1481  RluA family pseudouridine synthase  43.99 
 
 		 400 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00249005  normal  0.0889319 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0473  RluA family pseudouridine synthase  38.57 
 
 		 311 aa  197  3e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1731  RluA family pseudouridine synthase  42.86 
 
 		 405 aa  196  3e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.895388  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4836  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  40.97 
 
 		 320 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1704  RluA family pseudouridine synthase  43.53 
 
 		 407 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.225391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01005  23S rRNA pseudouridine synthase D  42.63 
 
 		 325 aa  196  5.000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1818  pseudouridine synthase  36.21 
 
 		 306 aa  196  6e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.05074  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1985  RluA family pseudouridine synthase  40.36 
 
 		 377 aa  195  7e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.122684  normal  0.0341634 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5094  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  42.54 
 
 		 402 aa  195  7e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.760184 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1286  pseudouridylate synthase  37.59 
 
 		 305 aa  195  7e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00677773  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0984  pseudouridine synthase, RluA family  43.09 
 
 		 320 aa  195  8.000000000000001e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0148654  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1324  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  44.27 
 
 		 395 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0224168  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2333  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  44.27 
 
 		 395 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.93917  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1821  RluA family pseudouridine synthase  35.93 
 
 		 305 aa  194  1e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2205  RluA family pseudouridine synthase  44.27 
 
 		 395 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1515  pseudouridine synthase, RluA family  36.91 
 
 		 306 aa  195  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0647442 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0663  RluA family pseudouridine synthase  40 
 
 		 352 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.241862  normal  0.120069 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1813  RluA family pseudouridine synthase  44.27 
 
 		 389 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.587957  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2168  RluA family pseudouridine synthase  44.27 
 
 		 389 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1084  RluA family pseudouridine synthase  44.27 
 
 		 389 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.346306  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>