More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4331 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4331  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 371 aa  753    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.248399  normal  0.118283 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3167  response regulator receiver protein  32.99 
 
 		 406 aa  173  3.9999999999999995e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6150  transcriptional regulator, AraC family  32.12 
 
 		 381 aa  144  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3165  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  28.73 
 
 		 389 aa  130  3e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0638  transcriptional regulator, AraC family  30.14 
 
 		 377 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3101  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  27.73 
 
 		 389 aa  127  3e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.866891  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2599  transcriptional regulator, AraC family  30.25 
 
 		 373 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1306  transcriptional regulator, AraC family  26.61 
 
 		 390 aa  124  2e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3025  AraC family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 390 aa  122  8e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000202158 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3057  AraC family transcriptional regulator  36.2 
 
 		 389 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0161665  normal  0.0111828 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0802  AraC family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 381 aa  110  3e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1285  helix-turn-helix domain-containing protein  27.22 
 
 		 379 aa  110  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.112275  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2999  response regulator receiver/GGDEF/EAL domain-containing protein  28.92 
 
 		 404 aa  105  9e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000288968 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0633  transcriptional regulator, AraC family  43.51 
 
 		 362 aa  105  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.311928  normal  0.134681 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2928  AraC family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 390 aa  101  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0841  AraC family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 392 aa  101  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.271665 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2274  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 392 aa  100  4e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.567279 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2495  AraC family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 379 aa  98.6  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.939158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3858  AraC family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 393 aa  95.5  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1147  response regulator receiver protein  25.45 
 
 		 397 aa  95.5  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2491  response regulator receiver protein  25.9 
 
 		 379 aa  92.8  8e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00299433  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1555  AraC family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 385 aa  92.4  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.294968  normal  0.931428 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1391  AraC family transcriptional regulator  25.08 
 
 		 379 aa  92  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2491  AraC family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 385 aa  92.4  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3809  transcriptional regulator, AraC family  31.6 
 
 		 376 aa  92  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2407  transcriptional regulator, AraC family  24.66 
 
 		 399 aa  87.4  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.411749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3234  helix-turn-helix domain-containing protein  46.88 
 
 		 106 aa  87  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1287  AraC family transcriptional regulator  39.82 
 
 		 368 aa  86.3  8e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.537021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0664  AraC family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 422 aa  85.5  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3808  AraC family transcriptional regulator  26 
 
 		 377 aa  84.7  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2203  transcriptional regulator, AraC family  31.01 
 
 		 285 aa  85.1  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0328064 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2366  AraC family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 370 aa  84.3  0.000000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0538  helix-turn-helix domain-containing protein  36.19 
 
 		 353 aa  81.3  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.214837  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2982  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  33.8 
 
 		 398 aa  80.9  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.383323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2612  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 349 aa  80.9  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1109  hypothetical protein  32.77 
 
 		 352 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0404  AraC family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 399 aa  80.1  0.00000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3153  AraC family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 364 aa  76.3  0.0000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3410  transcriptional regulator, AraC family  34.75 
 
 		 359 aa  75.5  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.493578  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0537  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 349 aa  75.9  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.379134  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1550  AraC family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 383 aa  75.1  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000434853  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0879  transcriptional regulator, AraC family  37.6 
 
 		 363 aa  74.7  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1276  transcriptional regulator AraC family  41.67 
 
 		 380 aa  72  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0312  AraC/XylS family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 347 aa  72.8  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2170  helix-turn-helix, AraC type  25.97 
 
 		 328 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2042  AraC family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 301 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2262  transcriptional regulator, AraC family  34.23 
 
 		 335 aa  67.8  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0906  helix-turn-helix domain-containing protein  32.28 
 
 		 274 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.472278 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0920  AraC family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 274 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100818  normal  0.609356 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4113  transcriptional regulator, AraC family  29.36 
 
 		 375 aa  66.6  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.197438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0018  AraC family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 358 aa  66.2  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.710124 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3712  AraC family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 337 aa  66.2  0.0000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.660721  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0876  AraC family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 274 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00939857  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2708  transcriptional activator MltR  32.8 
 
 		 301 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.215541  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2674  AraC family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 271 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.100791 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2584  transcriptional regulator, AraC family  34.31 
 
 		 357 aa  64.3  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.160731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  33.77 
 
 		 513 aa  64.7  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2054  two component transcriptional regulator, AraC family  29.46 
 
 		 1201 aa  63.9  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2641  AraC family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 301 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3156  two component transcriptional regulator, AraC family  33.98 
 
 		 515 aa  63.5  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.949308  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0951  AraC family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 571 aa  63.5  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00021324  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19800  AraC family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 247 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4302  AraC family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 269 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1634  AraC family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 380 aa  63.2  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.33217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1703  putative transcriptional regulator  34.75 
 
 		 294 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0448635  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2441  helix-turn-helix, AraC type  32 
 
 		 307 aa  62  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0002572  decreased coverage  0.000290212 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1280  two component transcriptional regulator, AraC family  31.96 
 
 		 492 aa  62  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3336  AraC family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 367 aa  61.6  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0426  helix-turn-helix domain-containing protein  31.62 
 
 		 349 aa  61.2  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0607795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2515  AraC family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 373 aa  60.8  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0142  transcriptional regulator, AraC family  36.47 
 
 		 760 aa  60.1  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4147  transcriptional regulator, AraC family  24.5 
 
 		 438 aa  60.1  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0286987  normal  0.311664 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2917  transcriptional regulator, AraC family  32.08 
 
 		 118 aa  59.7  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.932782  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0106  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  33.01 
 
 		 394 aa  59.7  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0092  helix-turn-helix domain-containing protein  31.73 
 
 		 745 aa  59.3  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0089  helix-turn-helix domain-containing protein  31.73 
 
 		 745 aa  59.3  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4467  AraC family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 301 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1205  AraC family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 440 aa  57.8  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.909691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0135  AraC family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 391 aa  57.4  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0106255  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0692  transcriptional regulator, AraC family  30.43 
 
 		 287 aa  57  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2926  transcriptional regulator MtlR  32.04 
 
 		 287 aa  57  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795893  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0771  two component AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 355 aa  57  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000862622  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0410  two component transcriptional regulator, AraC family  28.57 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34440  transcriptional regulator MtlR  32.04 
 
 		 301 aa  57  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000688741  normal  0.560291 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3028  response regulator receiver protein  29.41 
 
 		 558 aa  56.6  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.360206  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0600  two component transcriptional regulator, AraC family  30.77 
 
 		 546 aa  56.2  0.0000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2642  transcriptional regulator, AraC family  32.95 
 
 		 304 aa  56.2  0.0000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5388  transcriptional regulator, AraC family  30.77 
 
 		 298 aa  55.8  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.769805 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5587  transcriptional regulator, AraC family  24.86 
 
 		 291 aa  55.5  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.425806  normal  0.825086 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2152  AraC family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 275 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.488211  normal  0.369795 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2113  two component transcriptional regulator, AraC family  28 
 
 		 538 aa  55.5  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.141697  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3583  transcriptional regulator AraC family  38.61 
 
 		 293 aa  54.7  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1291  response regulator receiver protein  27.82 
 
 		 585 aa  55.1  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.655637  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0732  AraC family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 331 aa  54.7  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.576299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0464  AraC family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 259 aa  54.3  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5246  transcriptional regulator, AraC family  31.25 
 
 		 331 aa  54.3  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.893549 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0983  helix-turn-helix domain-containing protein  32.53 
 
 		 295 aa  53.9  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1804  AraC family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 316 aa  53.9  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0697858 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1038  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  34.02 
 
 		 394 aa  53.9  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.895405  normal  0.923131 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2823  transcriptional regulator, AraC family  35.11 
 
 		 285 aa  53.5  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>