More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3743 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3743  integrase family protein  100 
 
 		 445 aa  907    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3794  integrase family protein  100 
 
 		 445 aa  907    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0397442 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5534  integrase family protein  42.08 
 
 		 426 aa  285  9e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8572  DNA binding domain protein, excisionase family  34.43 
 
 		 507 aa  238  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0167813  normal  0.0589685 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0172  integrase family protein  34.4 
 
 		 437 aa  227  3e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.398776  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0644  integrase family protein  31.42 
 
 		 406 aa  191  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4016  phage integrase family protein  31.81 
 
 		 487 aa  186  5e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  30.44 
 
 		 379 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  28.54 
 
 		 377 aa  153  5e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  26.16 
 
 		 400 aa  129  9.000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  26.08 
 
 		 392 aa  127  3e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  25.19 
 
 		 386 aa  121  3e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  25.34 
 
 		 325 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1190  integrase family protein  27.5 
 
 		 463 aa  120  6e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  24.94 
 
 		 368 aa  120  7e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3417  hypothetical protein  84.38 
 
 		 87 aa  108  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.548763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  30.48 
 
 		 414 aa  102  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  41.09 
 
 		 305 aa  101  3e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0597  integrase family protein  28.13 
 
 		 447 aa  99  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14150  site-specific recombinase XerD  24.36 
 
 		 451 aa  95.5  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  36.14 
 
 		 370 aa  94.7  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  22.75 
 
 		 373 aa  94.7  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  39.04 
 
 		 390 aa  94.7  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  25.07 
 
 		 385 aa  94.7  3e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  31.07 
 
 		 363 aa  94.4  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  34.88 
 
 		 369 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  40.85 
 
 		 477 aa  92.8  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2126  integrase family protein  24.86 
 
 		 395 aa  91.3  3e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.706316 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  37.91 
 
 		 431 aa  90.5  6e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  37.93 
 
 		 392 aa  90.1  6e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  36.6 
 
 		 391 aa  90.1  7e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  34.11 
 
 		 369 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4726  integrase family protein  34.88 
 
 		 404 aa  89  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  34.88 
 
 		 369 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  37.23 
 
 		 370 aa  87  7e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  35.22 
 
 		 374 aa  86.7  8e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  35.22 
 
 		 374 aa  86.7  8e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  24.7 
 
 		 378 aa  85.5  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  37.24 
 
 		 383 aa  83.6  0.000000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2334  integrase family protein  23.52 
 
 		 444 aa  82.8  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.74243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0993  phage integrase family protein  38.46 
 
 		 121 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  38.3 
 
 		 378 aa  82.4  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4274  phage integrase  23.95 
 
 		 407 aa  80.1  0.00000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.173259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5323  integrase family protein  36 
 
 		 422 aa  79.7  0.00000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  22.28 
 
 		 416 aa  79.7  0.00000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  35.33 
 
 		 379 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  35.33 
 
 		 379 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  35 
 
 		 381 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5395  integrase family protein  36 
 
 		 402 aa  79  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  36.57 
 
 		 297 aa  78.6  0.0000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3548  phage integrase family protein  35 
 
 		 209 aa  77  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.339654  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  34.17 
 
 		 381 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  31.08 
 
 		 387 aa  75.5  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  37.04 
 
 		 381 aa  75.5  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1624  phage/XerD family site-specific recombinase  33.09 
 
 		 341 aa  74.7  0.000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.389199 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2786  phage integrase family protein  38.21 
 
 		 471 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0407  phage integrase  27.96 
 
 		 503 aa  74.3  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.995866 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  34.11 
 
 		 371 aa  72.4  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.89 
 
 		 298 aa  72.8  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3747  phage integrase family protein  37.4 
 
 		 471 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.51033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7037  hypothetical protein  23.95 
 
 		 387 aa  71.6  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.87328 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1144  phage integrase  34.87 
 
 		 422 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  32.24 
 
 		 383 aa  72.4  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  35.61 
 
 		 377 aa  71.2  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  31.21 
 
 		 435 aa  70.9  0.00000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0688  integrase family protein  34.31 
 
 		 336 aa  70.9  0.00000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2616  integron integrase  33.15 
 
 		 468 aa  70.9  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0772  phage integrase  46.67 
 
 		 304 aa  70.5  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2157  hypothetical protein  34.78 
 
 		 120 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00218836  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2095  phage integrase  34.78 
 
 		 120 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000441723  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2312  hypothetical protein  34.78 
 
 		 120 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.430324  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4524  Phage integrase  34.48 
 
 		 310 aa  69.7  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2337  hypothetical protein  34.78 
 
 		 120 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5470  tyrosine recombinase XerD  30.81 
 
 		 316 aa  67.8  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.602612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07060  site-specific recombinase XerD  37.61 
 
 		 315 aa  68.2  0.0000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.273434 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  38.41 
 
 		 391 aa  67.8  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0435  integrase family protein  38.61 
 
 		 299 aa  67.8  0.0000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1003  tyrosine recombinase XerD subunit  30.54 
 
 		 302 aa  67.8  0.0000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.56 
 
 		 299 aa  67  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003284  integrase  33.33 
 
 		 401 aa  67  0.0000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.11 
 
 		 299 aa  67  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.56 
 
 		 299 aa  67  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2378  tyrosine recombinase XerD  38.24 
 
 		 296 aa  67  0.0000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.11 
 
 		 299 aa  67  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.56 
 
 		 299 aa  67  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2567  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.61 
 
 		 313 aa  66.6  0.0000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.615759 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  31.61 
 
 		 320 aa  66.6  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0512  phage integrase  32.35 
 
 		 506 aa  66.2  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000591844  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  36.45 
 
 		 388 aa  65.9  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2489  tyrosine recombinase XerD  38.17 
 
 		 318 aa  66.2  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189208  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  33.57 
 
 		 391 aa  65.5  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.45 
 
 		 299 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.48 
 
 		 299 aa  65.9  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0611  integrase family protein  31.61 
 
 		 337 aa  65.1  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  31.76 
 
 		 300 aa  65.5  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  32.41 
 
 		 295 aa  65.5  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.89 
 
 		 299 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.89 
 
 		 301 aa  65.5  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0388  hypothetical protein  49.33 
 
 		 161 aa  65.1  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0582  integrase family protein  31.29 
 
 		 330 aa  65.1  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.132855 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>