More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1247 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG1247  phage integrase family site specific recombinase  100 
 
 
399 aa  839    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.357571  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1607  phage integrase family protein  36.17 
 
 
402 aa  256  6e-67  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  26.87 
 
 
374 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  26.87 
 
 
374 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0795  integrase family protein  26.78 
 
 
362 aa  108  2e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.475603  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  26.06 
 
 
391 aa  106  6e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  27.46 
 
 
373 aa  102  8e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0217  phage integrase family site specific recombinase  28.17 
 
 
384 aa  101  2e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2145  integrase  27.34 
 
 
393 aa  98.2  2e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.234907  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2275  integrase  27.08 
 
 
393 aa  98.6  2e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  25.55 
 
 
400 aa  97.1  5e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  25.77 
 
 
370 aa  96.7  6e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1190  integrase family protein  23.99 
 
 
463 aa  96.7  6e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  26.89 
 
 
390 aa  96.3  8e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0864  phage integrase family protein  29.12 
 
 
349 aa  95.9  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0352184  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0848  phage integrase family protein  29.12 
 
 
349 aa  95.9  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  26.69 
 
 
369 aa  94  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  24.55 
 
 
383 aa  93.6  6e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  27.25 
 
 
369 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  27.1 
 
 
370 aa  92.4  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  27.25 
 
 
369 aa  92  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  25.47 
 
 
383 aa  89.7  8e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  26.2 
 
 
376 aa  88.2  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  26.2 
 
 
376 aa  88.2  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  24.58 
 
 
378 aa  87.4  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  22.66 
 
 
377 aa  87.4  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  25.27 
 
 
391 aa  86.7  6e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2783  phage integrase family protein  24.56 
 
 
367 aa  86.7  6e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00148084  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  25.88 
 
 
325 aa  85.9  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  24.59 
 
 
435 aa  84.7  0.000000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  25.75 
 
 
376 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  22.3 
 
 
391 aa  84  0.000000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26510  site-specific recombinase XerD  24.62 
 
 
443 aa  83.6  0.000000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.938683  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  26.44 
 
 
376 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  27.99 
 
 
290 aa  80.5  0.00000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0524  integrase family protein  26.73 
 
 
407 aa  80.5  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.236803  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19160  site-specific recombinase XerD  24.76 
 
 
356 aa  79.7  0.00000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.768051  normal  0.148917 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  21.9 
 
 
357 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3952  integrase family protein  31.03 
 
 
310 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  25 
 
 
392 aa  77.8  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1407  integrase family protein  23.89 
 
 
374 aa  77.4  0.0000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0609363  normal  0.0878514 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1885  prophage LambdaSa2, site-specific recombinase phage integrase family protein  23.68 
 
 
356 aa  75.9  0.000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1487  phage integrase  32 
 
 
376 aa  75.5  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16076  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1956  Integrase  31.31 
 
 
312 aa  74.7  0.000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03170  site-specific recombinase XerD  27.2 
 
 
307 aa  75.1  0.000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000220198 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06819  integrase  24.69 
 
 
341 aa  75.5  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  24.93 
 
 
379 aa  74.3  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0424  phage integrase  25.47 
 
 
374 aa  74.7  0.000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.743387  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1096  integrase  27.98 
 
 
374 aa  74.3  0.000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.077251  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0829  integrase  25.34 
 
 
388 aa  74.7  0.000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.141939  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0018  phage integrase family protein  24.63 
 
 
388 aa  73.9  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0555  phage integrase  31.16 
 
 
308 aa  74.3  0.000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0470289  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  25.49 
 
 
363 aa  72.4  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0311  phage integrase family protein  25.47 
 
 
401 aa  72.4  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0304  phage integrase family protein  25.47 
 
 
401 aa  72.4  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1039  phage integrase family protein  27.15 
 
 
401 aa  71.6  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.1908  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  25.37 
 
 
393 aa  71.6  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1020  phage integrase family protein  27.15 
 
 
401 aa  71.6  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.085573  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  24 
 
 
377 aa  71.2  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0959  Phage integrase  25.84 
 
 
392 aa  70.9  0.00000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
 
NC_008705  Mkms_1440  phage integrase family protein  25.71 
 
 
393 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  28.94 
 
 
282 aa  70.9  0.00000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1185  tyrosine recombinase XerD  26.38 
 
 
310 aa  70.9  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.497096  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1986  phage integrase family site specific recombinase  24.34 
 
 
375 aa  70.5  0.00000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1422  phage integrase  25.71 
 
 
442 aa  70.1  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0567  integrase family protein  24.91 
 
 
391 aa  69.7  0.00000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.563798  hitchhiker  0.00485057 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2723  integrase family protein  29.35 
 
 
313 aa  69.7  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0607  integrase  23.1 
 
 
374 aa  69.3  0.0000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  23.43 
 
 
385 aa  68.6  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1351  integrase family protein  23.87 
 
 
416 aa  68.6  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  25.21 
 
 
381 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1100  phage integrase family protein  25.71 
 
 
383 aa  68.2  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  24.93 
 
 
381 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  23.77 
 
 
477 aa  67.4  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0301  integrase  27.07 
 
 
398 aa  67.4  0.0000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3145  integrase family protein  26.13 
 
 
438 aa  67.4  0.0000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00138908  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  30.48 
 
 
368 aa  67.4  0.0000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3747  phage integrase family protein  23.32 
 
 
471 aa  66.6  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.51033  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0173  tyrosine recombinase XerD  26.14 
 
 
309 aa  66.6  0.0000000008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.861385  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  24.44 
 
 
392 aa  66.2  0.0000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  23.73 
 
 
414 aa  66.2  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0939  integrase family protein  25.51 
 
 
357 aa  65.5  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0828563 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  21.24 
 
 
381 aa  65.5  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14150  site-specific recombinase XerD  23.16 
 
 
451 aa  65.1  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  23.98 
 
 
409 aa  65.1  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2786  phage integrase family protein  22.92 
 
 
471 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  23.93 
 
 
378 aa  64.3  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  27.03 
 
 
305 aa  64.7  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  24.56 
 
 
387 aa  64.7  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1383  integrase family protein  24.91 
 
 
307 aa  64.3  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2665  integrase family protein  27.17 
 
 
407 aa  63.9  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000119591  normal  0.757223 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  24.54 
 
 
284 aa  63.5  0.000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0736  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.54 
 
 
294 aa  63.2  0.000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3474  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.09 
 
 
296 aa  62.8  0.000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.486058 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0396  tyrosine recombinase XerD  26.98 
 
 
309 aa  62.4  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0478  integrase family protein  27.23 
 
 
312 aa  62.4  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  20.72 
 
 
379 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  20.72 
 
 
379 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1679  integrase  24.79 
 
 
372 aa  62.4  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1633  Phage integrase  23.67 
 
 
368 aa  62  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.576304  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>