More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2775 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2519  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  88.64 
 
 
492 aa  874    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.806579  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2775  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  100 
 
 
493 aa  985    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.85719 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6888  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  47.99 
 
 
506 aa  455  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1534  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  47.25 
 
 
501 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.231252  normal  0.283254 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1178  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  45.04 
 
 
505 aa  410  1e-113  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.811879  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5823  MscS mechanosensitive ion channel  58.28 
 
 
345 aa  373  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.63499  normal  0.440829 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2790  MscS mechanosensitive ion channel  56.88 
 
 
335 aa  363  5.0000000000000005e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.756482  normal  0.557915 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2440  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  39.22 
 
 
509 aa  310  5e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00769093 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3626  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  33.61 
 
 
489 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6131  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  32.98 
 
 
489 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2387  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  34.27 
 
 
490 aa  251  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178532  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1867  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  31.59 
 
 
480 aa  250  5e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0456814  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6691  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  32.24 
 
 
485 aa  225  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1460  MscS mechanosensitive ion channel  32.85 
 
 
493 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6368  MscS mechanosensitive ion channel  32.85 
 
 
493 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7035  MscS mechanosensitive ion channel  32.78 
 
 
493 aa  223  6e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.666416  normal  0.218312 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1968  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  30.11 
 
 
475 aa  217  4e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.805203  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5166  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  30.82 
 
 
475 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0740457  normal  0.0860349 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5256  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  30.82 
 
 
475 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.584441  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5308  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  30.82 
 
 
508 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.119708 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0258  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  34.7 
 
 
492 aa  209  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.986681 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2122  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  30.12 
 
 
489 aa  164  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.510942  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2712  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  26.21 
 
 
507 aa  136  7.000000000000001e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0470198  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1546  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  23.42 
 
 
479 aa  121  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.514924  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2303  MscS Mechanosensitive ion channel  26.7 
 
 
512 aa  117  5e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.697138  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12461  transmembrane protein  29.01 
 
 
481 aa  110  8.000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4255  mechanosensitive (MS) ion channel protein  29.79 
 
 
311 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4144  MscS mechanosensitive ion channel  29.79 
 
 
311 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.789982 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4274  hypothetical protein  28.51 
 
 
368 aa  105  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4726  MscS mechanosensitive ion channel  30.43 
 
 
325 aa  104  5e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.440183  normal  0.105448 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3145  MscS Mechanosensitive ion channel  31.9 
 
 
304 aa  103  6e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.243267  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0533  MscS Mechanosensitive ion channel  24.51 
 
 
472 aa  97.8  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0664  cyclic nucleotide-binding  26.35 
 
 
449 aa  97.1  6e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0101822  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1250  MscS mechanosensitive ion channel  28.5 
 
 
361 aa  95.9  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000414305  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5091  MscS Mechanosensitive ion channel  23.24 
 
 
637 aa  94.4  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148956  normal  0.0183068 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1124  MscS Mechanosensitive ion channel  29.05 
 
 
345 aa  91.3  4e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.745547  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2842  MscS mechanosensitive ion channel  31.67 
 
 
369 aa  88.6  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1770  MscS mechanosensitive ion channel  28.12 
 
 
406 aa  87  6e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0617  MscS mechanosensitive ion channel  27.23 
 
 
338 aa  85.1  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210835  normal  0.752053 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2229  MscS Mechanosensitive ion channel  29.03 
 
 
400 aa  85.1  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.224666  normal  0.568068 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2479  MscS Mechanosensitive ion channel  27.59 
 
 
383 aa  85.1  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.827266 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1146  MscS mechanosensitive ion channel  27.62 
 
 
366 aa  84.3  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.779955  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03115  MscS Mechanosensitive ion channel  25.36 
 
 
378 aa  84.3  0.000000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2696  MscS Mechanosensitive ion channel  27.31 
 
 
369 aa  84  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.415509  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3071  hypothetical protein  29.38 
 
 
366 aa  83.6  0.000000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.962312  normal  0.378174 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2065  MscS mechanosensitive ion channel  25.99 
 
 
359 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0226  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  36.6 
 
 
473 aa  83.2  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.512445  normal  0.203081 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2730  potassium efflux system KEFA  26.37 
 
 
825 aa  79.3  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.668875  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5283  MscS Mechanosensitive ion channel  23.35 
 
 
376 aa  78.6  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4556  MscS Mechanosensitive ion channel  23.97 
 
 
883 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0198839  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1210  MscS mechanosensitive ion channel  24.48 
 
 
344 aa  79.3  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.224237  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2568  MscS mechanosensitive ion channel  24.17 
 
 
358 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1633  hypothetical protein  25 
 
 
364 aa  78.2  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246622  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1895  MscS Mechanosensitive ion channel  25.39 
 
 
348 aa  76.6  0.0000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000167428  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2326  MscS mechanosensitive ion channel  28.28 
 
 
1127 aa  76.3  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3804  MscS Mechanosensitive ion channel  20.51 
 
 
495 aa  75.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1438  MscS mechanosensitive ion channel  28.63 
 
 
840 aa  75.9  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.139296  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5378  MscS Mechanosensitive ion channel  26.09 
 
 
909 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.287309  normal  0.723398 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2332  MscS Mechanosensitive ion channel  25.94 
 
 
362 aa  74.3  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1942  MscS mechanosensitive ion channel  24.53 
 
 
360 aa  74.3  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3059  MscS mechanosensitive ion channel  24.15 
 
 
879 aa  74.3  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0365719  normal  0.0542576 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0765  MscS Mechanosensitive ion channel  23.16 
 
 
484 aa  74.3  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0360  MscS mechanosensitive ion channel  28.42 
 
 
393 aa  74.3  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0736  MscS Mechanosensitive ion channel  23.16 
 
 
484 aa  74.3  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1852  mechanosensitive ion channel family protein  26.5 
 
 
804 aa  73.6  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0601787  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0767  small-conductance mechanosensitive ion channel  34.59 
 
 
401 aa  73.9  0.000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.967765  normal  0.366005 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0935  MscS Mechanosensitive ion channel  25.98 
 
 
484 aa  73.6  0.000000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5300  MscS Mechanosensitive ion channel  25.6 
 
 
909 aa  73.2  0.000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.154619  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4833  MscS mechanosensitive ion channel  25.6 
 
 
947 aa  73.2  0.000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.882104  normal  0.702316 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2162  periplasmic binding protein; mechanosensitive ion channel component  23.89 
 
 
794 aa  73.6  0.000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.387859 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1153  MscS Mechanosensitive ion channel  30.52 
 
 
352 aa  73.6  0.000000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3549  MscS mechanosensitive ion channel  25.65 
 
 
803 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.566467  normal  0.27975 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2451  small-conductance mechanosensitive channel  25.23 
 
 
380 aa  72.8  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0773  MscS mechanosensitive ion channel  33.83 
 
 
401 aa  73.2  0.00000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2316  mechanosensitive ion channel family protein  27.85 
 
 
773 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2837  MscS Mechanosensitive ion channel  29.02 
 
 
366 aa  72  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.426677  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0786  MscS Mechanosensitive ion channel  26.76 
 
 
840 aa  72  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0857  MscS mechanosensitive ion channel  26.76 
 
 
840 aa  72.4  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0452  MscS Mechanosensitive ion channel  23.9 
 
 
853 aa  71.6  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.372575 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4476  MscS mechanosensitive ion channel  25.43 
 
 
799 aa  71.2  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.878237 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0707  MscS mechanosensitive ion channel  25.43 
 
 
855 aa  70.9  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.441898  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3375  MscS mechanosensitive ion channel  28.92 
 
 
302 aa  70.9  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.190462  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23390  MscS Mechanosensitive ion channel  26.91 
 
 
299 aa  70.9  0.00000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350298  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1888  MscS Mechanosensitive ion channel  26.67 
 
 
362 aa  70.9  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3222  MscS mechanosensitive ion channel  25 
 
 
866 aa  70.9  0.00000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3246  MscS mechanosensitive ion channel  29.95 
 
 
381 aa  70.9  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00298811  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2357  hypothetical protein  30.06 
 
 
348 aa  70.5  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.116724  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0951  MscS Mechanosensitive ion channel  25.81 
 
 
341 aa  70.1  0.00000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2608  mechanosensitive ion channel family protein  25.12 
 
 
825 aa  69.7  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.349131  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4744  hypothetical protein  27.94 
 
 
1108 aa  69.3  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_009049  Rsph17029_0822  MscS mechanosensitive ion channel  26.11 
 
 
847 aa  69.7  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0649099  normal 
 
 
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NC_007493  RSP_2148  small conductance mechanosensitive Ion channel  26.11 
 
 
847 aa  69.3  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.667496  n/a   
 
 
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NC_011149  SeAg_B4625  hypothetical protein  27.94 
 
 
1108 aa  69.3  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.288253  n/a   
 
 
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NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  26.47 
 
 
806 aa  69.7  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
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NC_011901  Tgr7_1533  MscS Mechanosensitive ion channel  24.7 
 
 
276 aa  69.7  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011080  SNSL254_A4708  hypothetical protein  27.94 
 
 
1108 aa  69.3  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.749013  normal 
 
 
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NC_013385  Adeg_1464  MscS Mechanosensitive ion channel  25.64 
 
 
338 aa  69.7  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011083  SeHA_C4765  hypothetical protein  27.94 
 
 
1108 aa  69.3  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.514219  normal  0.17769 
 
 
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NC_008687  Pden_3862  MscS mechanosensitive ion channel  25.89 
 
 
830 aa  69.7  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.725538  normal  0.276406 
 
 
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NC_011094  SeSA_A4616  hypothetical protein  27.94 
 
 
1108 aa  69.3  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.115019  normal 
 
 
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