More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTOA0045 on replicon NC_004633
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004632  PSPTO_B0052  type IV pilus biogenesis protein  99.75 
 
 		 393 aa  798    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0045  type IV pilus biogenesis protein  100 
 
 		 393 aa  801    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0101  plasmid transfer ATPase TraJ  47.75 
 
 		 382 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2730  defect in organelle trafficking protein DotB (ATPase)  36.39 
 
 		 377 aa  171  1e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2603  defect in organelle trafficking protein DotB (ATPase)  36.39 
 
 		 377 aa  172  1e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0350  ATP-binding protein  34.03 
 
 		 372 aa  166  5.9999999999999996e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1833  Dot/Icm secretion system ATPase DotB  33.73 
 
 		 372 aa  165  2.0000000000000002e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0245  twitching motility protein  29.94 
 
 		 359 aa  137  4e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.292052  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0067  twitching motility protein  31.15 
 
 		 356 aa  137  4e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.78052e-25 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2020  twitching motility protein PilT  32.13 
 
 		 350 aa  137  5e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.403517  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0210  twitching motility protein  29.47 
 
 		 399 aa  136  6.0000000000000005e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0964904  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5603  type II secretion system protein E  30.18 
 
 		 393 aa  136  8e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.489222  normal  0.0238979 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1737  twitching motility protein PilT  32.13 
 
 		 350 aa  135  9e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00977471  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0505  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  30.03 
 
 		 347 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3449  twitching motility protein  34.35 
 
 		 338 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0548659  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0084  twitching motility protein  31.46 
 
 		 357 aa  134  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3084  twitching motility protein  33.56 
 
 		 360 aa  133  5e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0672592 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08231  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  31.23 
 
 		 347 aa  133  5e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.338679  hitchhiker  0.0000605149 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2068  twitching motility protein  30.45 
 
 		 387 aa  133  6e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0618461  normal  0.330404 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1891  twitching motility protein  30.45 
 
 		 387 aa  133  6e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1661  twitching mobility protein  31.6 
 
 		 402 aa  132  6.999999999999999e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.423515  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3679  type II secretion system protein E  29.45 
 
 		 380 aa  132  1.0000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.165494 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1917  twitching motility protein  32.03 
 
 		 360 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.979204 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1131  twitching motility protein  30.3 
 
 		 360 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.809253  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0110  type IV secretion system protein DotB  29.21 
 
 		 387 aa  131  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0132297  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3606  twitching motility protein  33.77 
 
 		 338 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1725  pilus retraction protein PilT  31.44 
 
 		 395 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.544613  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1883  twitching motility protein  32.1 
 
 		 351 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000175789  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0436  twitching motility protein PilT  31.72 
 
 		 356 aa  129  6e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2195  twitching motility protein  32.08 
 
 		 390 aa  129  7.000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0922  twitching mobility protein  30.67 
 
 		 363 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.987668  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1038  twitching motility protein  32.99 
 
 		 372 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4279  type II secretion system protein E  31.06 
 
 		 403 aa  128  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2561  twitching motility protein  31.1 
 
 		 352 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03090  Pilus retraction protein  31.49 
 
 		 344 aa  128  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.166876  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1750  twitching motility protein  28.57 
 
 		 345 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5029  twitching motility protein  30.41 
 
 		 428 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.580739 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_793  twitching mobility protein  31 
 
 		 360 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3221  twitching motility protein  31.49 
 
 		 356 aa  127  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0831  twitching motility protein  30.35 
 
 		 374 aa  127  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.859854  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0833  twitching motility protein  30.35 
 
 		 374 aa  127  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.213742  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0459  twitching motility protein  31.58 
 
 		 364 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0174567  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1995  twitching motility protein  26.82 
 
 		 401 aa  126  6e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.206221 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3400  pilus retraction protein PilT  31.72 
 
 		 356 aa  126  7e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5655  type II secretion system protein E  30.77 
 
 		 366 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0094034 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1188  twitching motility protein  29.19 
 
 		 358 aa  126  8.000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.231991  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5872  type II secretion system protein E  30.77 
 
 		 366 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2483  twitching motility protein  27.95 
 
 		 387 aa  125  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0708894  normal  0.285122 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1802  twitching motility protein  33.68 
 
 		 369 aa  125  1e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.579397 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1805  hypothetical protein  28.91 
 
 		 392 aa  125  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00695665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2045  twitching motility protein  32.82 
 
 		 395 aa  125  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.398089  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1106  twitching motility protein  30.38 
 
 		 351 aa  125  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.321082  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2102  twitching motility protein  30.42 
 
 		 348 aa  124  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.927915 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2906  pilus retraction protein PilT  30.07 
 
 		 389 aa  125  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.146208 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0420  twitching motility protein  30.6 
 
 		 347 aa  125  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0889  twitching motility protein  31.56 
 
 		 351 aa  125  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0264  twitching motility protein  35.93 
 
 		 403 aa  125  2e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.723918 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0412  twitching motility protein  30.6 
 
 		 347 aa  125  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2916  type II secretion system protein (twitching motility protein)  29.18 
 
 		 402 aa  124  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.465688  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1167  twitching motility protein  32.07 
 
 		 375 aa  124  3e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.69165  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06901  twitching motility protein  30.16 
 
 		 357 aa  124  4e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.595138  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1724  twitching motility protein  29.44 
 
 		 360 aa  123  5e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0637  twitching motility protein  29.28 
 
 		 412 aa  123  5e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1362  Sodium:galactoside symporter  29.56 
 
 		 397 aa  123  5e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0806  twitching motility protein  30.33 
 
 		 360 aa  123  7e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0166  twitching motility protein  28.67 
 
 		 364 aa  123  7e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.197236 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1995  hypothetical protein  28.76 
 
 		 344 aa  122  8e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1543  twitching motility protein  32.33 
 
 		 423 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0758  twitching motility protein  30.41 
 
 		 366 aa  122  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0178166 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3033  twitching motility protein  31.32 
 
 		 391 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0402494  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1990  hypothetical protein  28.57 
 
 		 344 aa  122  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2223  twitching motility protein  31.19 
 
 		 366 aa  122  9.999999999999999e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.659766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4149  twitching motility protein  29.55 
 
 		 344 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.84862 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0536  twitching motility protein  30 
 
 		 358 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4813  twitching motility protein  30.5 
 
 		 347 aa  121  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2026  twitching motility protein  29.56 
 
 		 409 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.166451 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03577  hypothetical protein  30.52 
 
 		 346 aa  122  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002458  twitching motility protein PilT  30.52 
 
 		 346 aa  121  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2666  twitching motility protein  32.4 
 
 		 368 aa  120  3e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1584  twitching motility protein  31.23 
 
 		 373 aa  120  3e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1448  twitching motility protein  30.82 
 
 		 358 aa  121  3e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.991053  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3878  twitching motility protein  29.38 
 
 		 347 aa  120  3e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0576559  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2686  twitching motility protein  28.9 
 
 		 345 aa  120  3e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1841  twitching motility protein  29.68 
 
 		 349 aa  120  3e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.616267  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0146  twitching motility protein PilT  28.66 
 
 		 386 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1361  pilus retraction protein PilT  29.37 
 
 		 390 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.678263  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03297  twitching motility protein PilT  28.71 
 
 		 349 aa  120  3.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.987753  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3356  twitching motility protein  32.19 
 
 		 326 aa  120  3.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00189861 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0335  twitching motility protein PilT  30.87 
 
 		 398 aa  120  3.9999999999999996e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0814  twitching motility protein  30.26 
 
 		 361 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1505  twitching motility protein  31.19 
 
 		 349 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.831858  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1811  twitching motility protein  29.59 
 
 		 380 aa  120  4.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.148684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1305  twitching mobility protein  30.69 
 
 		 402 aa  120  6e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0637  twitching motility protein  29.97 
 
 		 347 aa  120  6e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2917  twitching motility protein  33.46 
 
 		 388 aa  120  6e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.183371  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0495  twitching motility protein PilT  29.22 
 
 		 344 aa  120  6e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05180  twitching motility protein PilT  29.22 
 
 		 344 aa  120  6e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0410  twitching motility protein  34.53 
 
 		 378 aa  119  7e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2412  twitching motility protein  33.78 
 
 		 372 aa  119  7.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0874  twitching motility protein  30.41 
 
 		 360 aa  119  7.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>