More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_0350 on replicon NC_009727
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010117  COXBURSA331_A1833  Dot/Icm secretion system ATPase DotB  99.73 
 
 
372 aa  752    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0350  ATP-binding protein  100 
 
 
372 aa  754    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2603  defect in organelle trafficking protein DotB (ATPase)  65.65 
 
 
377 aa  504  9.999999999999999e-143  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2730  defect in organelle trafficking protein DotB (ATPase)  65.65 
 
 
377 aa  504  1e-141  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3679  type II secretion system protein E  37.29 
 
 
380 aa  259  8e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.165494 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4279  type II secretion system protein E  35.75 
 
 
403 aa  241  1e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5603  type II secretion system protein E  38.08 
 
 
393 aa  230  3e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.489222  normal  0.0238979 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0110  type IV secretion system protein DotB  36.96 
 
 
387 aa  223  4e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0132297  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0544  twitching mobility protein PilT, type II/IV secretion system protein  32.94 
 
 
345 aa  172  6.999999999999999e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0101  plasmid transfer ATPase TraJ  34.46 
 
 
382 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0505  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  34.57 
 
 
347 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1038  twitching motility protein  35.92 
 
 
372 aa  166  6.9999999999999995e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1841  twitching motility protein  33.81 
 
 
349 aa  162  7e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.616267  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0257  twitching motility protein  33.13 
 
 
350 aa  160  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0067  twitching motility protein  34.82 
 
 
356 aa  160  4e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.78052e-25 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1750  twitching motility protein  32.67 
 
 
345 aa  157  2e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2476  twitching motility protein  34.21 
 
 
345 aa  157  2e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0014  twitching motility protein PilT  32.06 
 
 
345 aa  157  3e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03577  hypothetical protein  31.38 
 
 
346 aa  157  3e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3717  twitching motility protein  33.14 
 
 
347 aa  157  3e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1195  pilus retraction ATPase PilT  33.63 
 
 
345 aa  157  3e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.035221  normal  0.726938 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1194  pilus retraction ATPase PilT  33.63 
 
 
345 aa  157  4e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0809497  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1265  pilus retraction ATPase PilT  33.63 
 
 
345 aa  157  4e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00395146  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3878  twitching motility protein  34.59 
 
 
347 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0576559  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3024  twitching motility protein  33.63 
 
 
345 aa  156  6e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00035663  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1138  twitching motility protein  33.92 
 
 
345 aa  156  7e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3351  twitching motility protein PilT  33.33 
 
 
345 aa  155  9e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3039  twitching motility protein  33.63 
 
 
345 aa  155  9e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00110048  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1131  twitching motility protein  34.59 
 
 
360 aa  155  9e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.809253  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1339  twitching motility protein  33.63 
 
 
345 aa  155  9e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0176269  hitchhiker  0.0000000675214 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3182  twitching motility protein  33.63 
 
 
345 aa  155  9e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000300358  normal  0.0171368 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0084  twitching motility protein  34.82 
 
 
357 aa  155  9e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2686  twitching motility protein  33.33 
 
 
345 aa  155  1e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002458  twitching motility protein PilT  30.79 
 
 
346 aa  155  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0052  type IV pilus biogenesis protein  34.03 
 
 
393 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0045  type IV pilus biogenesis protein  34.03 
 
 
393 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03297  twitching motility protein PilT  33.14 
 
 
349 aa  154  2e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.987753  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3356  twitching motility protein  45.73 
 
 
326 aa  154  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00189861 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0536  twitching motility protein  33.65 
 
 
358 aa  154  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1917  twitching motility protein  35.53 
 
 
360 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.979204 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2681  twitching motility protein  32.75 
 
 
349 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.172502  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3606  twitching motility protein  31.69 
 
 
338 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0278  twitching motility protein  33.96 
 
 
347 aa  153  5e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3449  twitching motility protein  32.84 
 
 
338 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0548659  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3092  twitching motility family protein  37.15 
 
 
341 aa  152  8e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000184946 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3221  twitching motility protein  34.28 
 
 
356 aa  152  8.999999999999999e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02780  predicted transporter  37.5 
 
 
326 aa  151  1e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.374196  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0396  twitching motility protein  33.65 
 
 
347 aa  152  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.203182 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3294  twitching motility family protein  37.5 
 
 
326 aa  151  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02743  hypothetical protein  37.5 
 
 
326 aa  151  1e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.390847  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2020  twitching motility protein PilT  33.14 
 
 
350 aa  152  1e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.403517  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2859  twitching motility protein  32.75 
 
 
345 aa  152  1e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00311104  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1694  twitching motility protein  34.42 
 
 
389 aa  151  1e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.12412  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03090  Pilus retraction protein  33.14 
 
 
344 aa  151  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.166876  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0745  twitching motility protein  37.5 
 
 
326 aa  151  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.55991  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1233  twitching motility protein PilT  34.77 
 
 
344 aa  151  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000670856  normal  0.482312 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3110  twitching motility family protein  37.5 
 
 
326 aa  151  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3004  pilus retraction protein PilT  35.94 
 
 
345 aa  150  2e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2107  twitching motility protein  34.91 
 
 
347 aa  151  2e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0764  twitching motility protein  37.5 
 
 
326 aa  151  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.160619  hitchhiker  0.0000267931 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1737  twitching motility protein PilT  32.85 
 
 
350 aa  151  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00977471  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5093  twitching motility protein  34.98 
 
 
336 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0637  twitching motility protein  33.96 
 
 
347 aa  150  3e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4253  twitching motility family protein  37.5 
 
 
341 aa  150  3e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.626068  normal  0.518101 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0459  twitching motility protein  35.74 
 
 
364 aa  150  4e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0174567  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0420  twitching motility protein  33.65 
 
 
347 aa  150  4e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0412  twitching motility protein  33.65 
 
 
347 aa  150  4e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1068  twitching motility protein  33.33 
 
 
347 aa  150  4e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.365161 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0460  twitching motility protein  33.43 
 
 
356 aa  149  6e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.16697  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3883  pilus retraction protein PilT  35.2 
 
 
347 aa  149  6e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3382  twitching motility family protein  37.1 
 
 
326 aa  149  6e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1333  twitching motility protein  32.77 
 
 
345 aa  149  6e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0112575 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1128  twitching motility protein  33.33 
 
 
345 aa  149  7e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0169735  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3338  twitching mobility protein  36.9 
 
 
326 aa  149  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.394919 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3346  twitching mobility protein  36.9 
 
 
326 aa  149  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.732924  normal  0.263184 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3442  twitching motility protein PilT  36.9 
 
 
326 aa  149  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.091783 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3703  twitching motility protein  35.42 
 
 
347 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1305  twitching mobility protein  33.33 
 
 
402 aa  149  1.0000000000000001e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1362  Sodium:galactoside symporter  32.37 
 
 
397 aa  148  1.0000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0436  twitching motility protein PilT  33.33 
 
 
356 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3662  twitching motility protein PilT  31.78 
 
 
347 aa  147  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.69581  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0210  twitching motility protein  32.62 
 
 
399 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0964904  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2419  pilus retraction ATPase PilT  37.27 
 
 
347 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2413  twitching motility protein  31.79 
 
 
351 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4966  twitching motility protein  34.67 
 
 
332 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3273  twitching mobility protein  36.9 
 
 
326 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0500481 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2506  twitching motility protein  33.23 
 
 
347 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.876718 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2918  twitching motility protein  33.23 
 
 
347 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3262  twitching mobility protein  36.9 
 
 
326 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2682  twitching motility protein  33.54 
 
 
347 aa  147  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.310327 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0267  pilus retraction protein PilT  34.07 
 
 
350 aa  147  3e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2918  twitching motility protein PilT  33.04 
 
 
344 aa  147  3e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.683879  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2517  twitching motility protein  30.26 
 
 
404 aa  147  4.0000000000000006e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0242978 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1688  twitching motility protein  33.65 
 
 
347 aa  147  4.0000000000000006e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.802614 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2414  twitching motility protein  31.96 
 
 
344 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1553  twitching motility protein  34.3 
 
 
339 aa  147  4.0000000000000006e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0974985 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1802  twitching motility protein  34.29 
 
 
369 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.579397 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5318  pilus retraction protein PilT  33.14 
 
 
344 aa  146  5e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0097  twitching motility protein  31.01 
 
 
357 aa  146  6e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.767539  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3039  type II secretion system protein (twitching motility protein) (PilT)  32.26 
 
 
344 aa  146  7.0000000000000006e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.37999  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>