More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_5603 on replicon NC_011758
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011758  Mchl_5603  type II secretion system protein E  100 
 
 		 393 aa  795    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.489222  normal  0.0238979 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0350  ATP-binding protein  38.08 
 
 		 372 aa  230  4e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1833  Dot/Icm secretion system ATPase DotB  37.81 
 
 		 372 aa  228  1e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2730  defect in organelle trafficking protein DotB (ATPase)  36.39 
 
 		 377 aa  228  2e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2603  defect in organelle trafficking protein DotB (ATPase)  36.39 
 
 		 377 aa  228  2e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0110  type IV secretion system protein DotB  31.32 
 
 		 387 aa  210  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0132297  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3679  type II secretion system protein E  35.11 
 
 		 380 aa  174  2.9999999999999996e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.165494 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4279  type II secretion system protein E  31.58 
 
 		 403 aa  172  1e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3084  twitching motility protein  32.8 
 
 		 360 aa  149  1.0000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0672592 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0494  type II secretion system protein (twitching motility protein)  30.18 
 
 		 375 aa  145  1e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0124637  normal  0.766223 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5093  twitching motility protein  32.49 
 
 		 336 aa  143  6e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0544  twitching mobility protein PilT, type II/IV secretion system protein  29.3 
 
 		 345 aa  143  6e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1038  twitching motility protein  32.69 
 
 		 372 aa  142  7e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0245  twitching motility protein  32.35 
 
 		 359 aa  142  9.999999999999999e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.292052  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4966  twitching motility protein  32.49 
 
 		 332 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5143  twitching motility protein  33.05 
 
 		 332 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.847516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0166  twitching motility protein  29.82 
 
 		 364 aa  139  7e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.197236 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1131  twitching motility protein  31.14 
 
 		 360 aa  139  7e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.809253  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2682  twitching motility protein  29.92 
 
 		 347 aa  137  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.310327 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1744  twitching motility protein  30.11 
 
 		 362 aa  138  2e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2686  twitching motility protein  30.79 
 
 		 345 aa  138  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3351  twitching motility protein PilT  30.79 
 
 		 345 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1537  twitching motility protein PilT  33.21 
 
 		 344 aa  137  4e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3192  twitching motility protein  37.84 
 
 		 367 aa  137  4e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0324177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3039  type II secretion system protein (twitching motility protein) (PilT)  30.46 
 
 		 344 aa  136  5e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.37999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0316  twitching motility protein  32.71 
 
 		 345 aa  136  7.000000000000001e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.436596  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0478  pilus retraction protein PilT  33.95 
 
 		 344 aa  136  8e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3883  pilus retraction protein PilT  30.45 
 
 		 347 aa  135  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2918  twitching motility protein  30.52 
 
 		 347 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1128  twitching motility protein  29.55 
 
 		 345 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0169735  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2681  twitching motility protein  33.09 
 
 		 349 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.172502  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1194  pilus retraction ATPase PilT  30.49 
 
 		 345 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0809497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1265  pilus retraction ATPase PilT  30.49 
 
 		 345 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00395146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1195  pilus retraction ATPase PilT  30.49 
 
 		 345 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.035221  normal  0.726938 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2506  twitching motility protein  30.52 
 
 		 347 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.876718 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5318  pilus retraction protein PilT  36.82 
 
 		 344 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3039  twitching motility protein  35.54 
 
 		 345 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00110048  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2102  twitching motility protein  29.95 
 
 		 348 aa  134  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.927915 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1339  twitching motility protein  35.54 
 
 		 345 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0176269  hitchhiker  0.0000000675214 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2476  twitching motility protein  35.54 
 
 		 345 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3024  twitching motility protein  33.6 
 
 		 345 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00035663  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0342  twitching motility protein  34.87 
 
 		 345 aa  135  1.9999999999999998e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3182  twitching motility protein  35.54 
 
 		 345 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000300358  normal  0.0171368 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5045  twitching motility protein  33.95 
 
 		 344 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.597487  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0256  twitching motility protein  34.29 
 
 		 359 aa  133  5e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0412  twitching motility protein  29.88 
 
 		 347 aa  133  6e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0420  twitching motility protein  29.88 
 
 		 347 aa  133  6e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2918  twitching motility protein PilT  29.17 
 
 		 344 aa  133  6e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.683879  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0689  twitching motility protein  30.33 
 
 		 391 aa  133  6.999999999999999e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0257  twitching motility protein  28.07 
 
 		 350 aa  132  7.999999999999999e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1233  twitching motility protein PilT  33.46 
 
 		 344 aa  132  9e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000670856  normal  0.482312 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1917  twitching motility protein  29.33 
 
 		 360 aa  132  9e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.979204 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0278  twitching motility protein  35.66 
 
 		 347 aa  132  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2148  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  30.4 
 
 		 374 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3640  twitching motility protein PilT  36.78 
 
 		 344 aa  132  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03090  Pilus retraction protein  35.12 
 
 		 344 aa  131  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.166876  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1333  twitching motility protein  33.08 
 
 		 345 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0112575 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0543  twitching motility protein  33.11 
 
 		 362 aa  131  2.0000000000000002e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.22582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1691  twitching motility protein  30.75 
 
 		 378 aa  131  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0637  twitching motility protein  30.09 
 
 		 347 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0495  twitching motility protein PilT  34.87 
 
 		 344 aa  130  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1138  twitching motility protein  29.57 
 
 		 345 aa  131  3e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0396  twitching motility protein  29.94 
 
 		 347 aa  131  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.203182 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3356  twitching motility protein  36.67 
 
 		 326 aa  130  3e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00189861 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4814  twitching motility protein  35.71 
 
 		 378 aa  131  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2859  twitching motility protein  29.27 
 
 		 345 aa  130  3e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00311104  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05180  twitching motility protein PilT  34.87 
 
 		 344 aa  130  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0537  twitching motility protein  33.83 
 
 		 344 aa  130  3e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3760  Pili biogenesis ATPase  29.21 
 
 		 347 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.112866  normal  0.149271 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0014  twitching motility protein PilT  28.57 
 
 		 345 aa  130  4.0000000000000003e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0101  plasmid transfer ATPase TraJ  30.65 
 
 		 382 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1995  hypothetical protein  34.85 
 
 		 344 aa  130  5.0000000000000004e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6344  twitching motility protein  29.48 
 
 		 361 aa  130  5.0000000000000004e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3053  twitching motility protein  35.14 
 
 		 360 aa  130  5.0000000000000004e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1631  twitching motility protein  36.18 
 
 		 347 aa  130  6e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0179805 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0418  twitching motility protein  31.95 
 
 		 378 aa  129  6e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4696  twitching motility protein  30.85 
 
 		 374 aa  129  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.787911 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1990  hypothetical protein  29.91 
 
 		 344 aa  129  7.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1253  twitching motility protein  35.95 
 
 		 344 aa  129  7.000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1221  twitching motility protein  35.95 
 
 		 344 aa  129  7.000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.475571  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0410  twitching motility protein  31.66 
 
 		 378 aa  129  8.000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3878  twitching motility protein  30.33 
 
 		 347 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0576559  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3053  twitching motility protein  36.97 
 
 		 346 aa  129  8.000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.39006  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3662  twitching motility protein PilT  34.04 
 
 		 347 aa  129  9.000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.69581  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2414  twitching motility protein  31.97 
 
 		 344 aa  129  9.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1725  pilus retraction protein PilT  27.58 
 
 		 395 aa  129  9.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.544613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1688  twitching motility protein  30.86 
 
 		 347 aa  129  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.802614 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0372  twitching motility protein  30.59 
 
 		 332 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1747  twitching motility protein  30.79 
 
 		 370 aa  128  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.555642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1695  twitching motility protein  32.23 
 
 		 360 aa  129  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1068  twitching motility protein  29.57 
 
 		 347 aa  128  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.365161 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2195  twitching motility protein  28.74 
 
 		 390 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3221  twitching motility protein  30.19 
 
 		 356 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4149  twitching motility protein  33.61 
 
 		 344 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.84862 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2517  twitching motility protein  27.73 
 
 		 404 aa  128  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0242978 
 
 
-
 
NC_002936  DET0922  twitching mobility protein  28.27 
 
 		 363 aa  127  3e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.987668  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01993  twitching motility protein  35.71 
 
 		 345 aa  127  3e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.913118  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1387  twitching motility protein  28.39 
 
 		 364 aa  127  3e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.573259 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2936  twitching motility protein  28.45 
 
 		 347 aa  127  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.745836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0536  twitching motility protein  31.67 
 
 		 358 aa  127  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>