More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl2603 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp2730  defect in organelle trafficking protein DotB (ATPase)  99.73 
 
 
377 aa  771    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2603  defect in organelle trafficking protein DotB (ATPase)  100 
 
 
377 aa  773    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0350  ATP-binding protein  65.65 
 
 
372 aa  504  9.999999999999999e-143  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1833  Dot/Icm secretion system ATPase DotB  65.37 
 
 
372 aa  502  1e-141  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3679  type II secretion system protein E  36.75 
 
 
380 aa  244  1.9999999999999999e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.165494 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4279  type II secretion system protein E  36.16 
 
 
403 aa  228  1e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5603  type II secretion system protein E  36.39 
 
 
393 aa  228  2e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.489222  normal  0.0238979 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0110  type IV secretion system protein DotB  38.1 
 
 
387 aa  225  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0132297  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0101  plasmid transfer ATPase TraJ  32.73 
 
 
382 aa  173  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0014  twitching motility protein PilT  32.94 
 
 
345 aa  166  5e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0210  twitching motility protein  32.94 
 
 
399 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0964904  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0544  twitching mobility protein PilT, type II/IV secretion system protein  31.75 
 
 
345 aa  164  2.0000000000000002e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03577  hypothetical protein  32.68 
 
 
346 aa  160  5e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002458  twitching motility protein PilT  31.56 
 
 
346 aa  159  7e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0052  type IV pilus biogenesis protein  36.39 
 
 
393 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0045  type IV pilus biogenesis protein  36.39 
 
 
393 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0166  twitching motility protein  31.7 
 
 
364 aa  154  2e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.197236 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0335  twitching motility protein PilT  33.24 
 
 
398 aa  155  2e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1750  twitching motility protein  31.59 
 
 
345 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3606  twitching motility protein  31.43 
 
 
338 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0536  twitching motility protein  30.91 
 
 
358 aa  152  7e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1305  twitching mobility protein  33.44 
 
 
402 aa  152  8e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3449  twitching motility protein  30.9 
 
 
338 aa  152  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0548659  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1661  twitching mobility protein  30.41 
 
 
402 aa  152  1e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.423515  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3221  twitching motility protein  30.91 
 
 
356 aa  150  3e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0505  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  32.01 
 
 
347 aa  150  3e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3084  twitching motility protein  31.14 
 
 
360 aa  150  3e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0672592 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3356  twitching motility protein  40.76 
 
 
326 aa  150  3e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00189861 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03297  twitching motility protein PilT  33.53 
 
 
349 aa  150  4e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.987753  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0257  twitching motility protein  30.42 
 
 
350 aa  149  7e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3717  twitching motility protein  32.73 
 
 
347 aa  149  9e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5093  twitching motility protein  34.19 
 
 
336 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0084  twitching motility protein  32.42 
 
 
357 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0847  twitching motility protein  31.96 
 
 
370 aa  149  1.0000000000000001e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.788432 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1694  twitching motility protein  33.04 
 
 
389 aa  149  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.12412  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1038  twitching motility protein  30.08 
 
 
372 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0375  pilus retraction protein PilT  31.38 
 
 
372 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1883  twitching motility protein  31.58 
 
 
351 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000175789  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1188  twitching motility protein  29.67 
 
 
358 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.231991  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0761  twitching motility protein  32.89 
 
 
340 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1917  twitching motility protein  33.84 
 
 
360 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.979204 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2517  twitching motility protein  27.84 
 
 
404 aa  147  3e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0242978 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0067  twitching motility protein  32.93 
 
 
356 aa  147  3e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.78052e-25 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0459  twitching motility protein  34.09 
 
 
364 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0174567  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4966  twitching motility protein  33.87 
 
 
332 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02780  predicted transporter  38.43 
 
 
326 aa  145  9e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.374196  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3053  twitching motility protein  32.33 
 
 
360 aa  145  9e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02743  hypothetical protein  38.43 
 
 
326 aa  145  9e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.390847  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0745  twitching motility protein  38.43 
 
 
326 aa  145  1e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.55991  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3092  twitching motility family protein  38.89 
 
 
341 aa  145  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000184946 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2107  twitching motility protein  33.53 
 
 
347 aa  145  1e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3110  twitching motility family protein  38.43 
 
 
326 aa  144  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4253  twitching motility family protein  38.43 
 
 
341 aa  144  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.626068  normal  0.518101 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08231  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  34.5 
 
 
347 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.338679  hitchhiker  0.0000605149 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3294  twitching motility family protein  38.43 
 
 
326 aa  145  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0764  twitching motility protein  38.43 
 
 
326 aa  144  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.160619  hitchhiker  0.0000267931 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2102  twitching motility protein  31.43 
 
 
348 aa  144  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.927915 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2020  twitching motility protein PilT  29.91 
 
 
350 aa  144  3e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.403517  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3703  twitching motility protein  35.24 
 
 
347 aa  144  3e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0436  twitching motility protein PilT  30.18 
 
 
356 aa  144  4e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3382  twitching motility family protein  37.96 
 
 
326 aa  143  4e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3178  twitching motility protein  33.23 
 
 
388 aa  143  5e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1584  twitching motility protein  30.65 
 
 
373 aa  143  6e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2476  twitching motility protein  34.21 
 
 
345 aa  142  6e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1737  twitching motility protein PilT  29.62 
 
 
350 aa  143  6e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00977471  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3662  twitching motility protein PilT  31.02 
 
 
347 aa  142  7e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.69581  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1145  twitching motility protein PilT  30.57 
 
 
353 aa  142  7e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0148447  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3256  twitching motility protein  31.11 
 
 
360 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2223  twitching motility protein  30.86 
 
 
366 aa  142  9.999999999999999e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.659766  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3527  twitching motility protein  30.59 
 
 
344 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.318184  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1362  Sodium:galactoside symporter  28.15 
 
 
397 aa  142  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06901  twitching motility protein  30.69 
 
 
357 aa  142  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.595138  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3883  pilus retraction protein PilT  33.66 
 
 
347 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0460  twitching motility protein  31.68 
 
 
356 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.16697  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1131  twitching motility protein  30.73 
 
 
360 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.809253  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0097  twitching motility protein  27.99 
 
 
357 aa  140  3e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.767539  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3039  type II secretion system protein (twitching motility protein) (PilT)  32.04 
 
 
344 aa  140  3e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.37999  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1361  pilus retraction protein PilT  28.7 
 
 
390 aa  140  3e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.678263  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3052  twitching motility protein  31.59 
 
 
387 aa  140  3e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5318  pilus retraction protein PilT  32.46 
 
 
344 aa  140  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3400  pilus retraction protein PilT  28.97 
 
 
356 aa  140  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1553  twitching motility protein  31.53 
 
 
339 aa  140  3e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0974985 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4696  twitching motility protein  29.43 
 
 
374 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.787911 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0310  twitching motility protein  31.71 
 
 
347 aa  140  3e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3338  twitching mobility protein  32.3 
 
 
326 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.394919 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03090  Pilus retraction protein  32.12 
 
 
344 aa  140  3e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.166876  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1637  twitching motility protein  30.36 
 
 
372 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.601857  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3346  twitching mobility protein  32.19 
 
 
326 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.732924  normal  0.263184 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3442  twitching motility protein PilT  32.3 
 
 
326 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.091783 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3878  twitching motility protein  33.88 
 
 
347 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0576559  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1611  twitching motility protein  30.36 
 
 
372 aa  140  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3262  twitching mobility protein  31.99 
 
 
326 aa  139  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3433  twitching motility protein  32.9 
 
 
437 aa  139  6e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.404261  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0372  twitching motility protein  31.83 
 
 
332 aa  139  6e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1138  twitching motility protein  34.1 
 
 
345 aa  139  7e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0256  twitching motility protein  33.33 
 
 
359 aa  139  7e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3273  twitching mobility protein  32.19 
 
 
326 aa  139  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0500481 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00181  PilT1-like protein  31.46 
 
 
358 aa  139  7.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1035  twitching motility protein  33.44 
 
 
360 aa  139  7.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2918  twitching motility protein PilT  33.24 
 
 
344 aa  139  7.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.683879  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>