More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_A0101 on replicon NC_011081
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011081  SeHA_A0101  plasmid transfer ATPase TraJ  100 
 
 		 382 aa  782    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0052  type IV pilus biogenesis protein  47.75 
 
 		 393 aa  354  1e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0045  type IV pilus biogenesis protein  47.75 
 
 		 393 aa  354  1e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2603  defect in organelle trafficking protein DotB (ATPase)  32.73 
 
 		 377 aa  173  5e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1833  Dot/Icm secretion system ATPase DotB  34.77 
 
 		 372 aa  173  5.999999999999999e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0350  ATP-binding protein  34.46 
 
 		 372 aa  171  2e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2730  defect in organelle trafficking protein DotB (ATPase)  32.42 
 
 		 377 aa  171  3e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1883  twitching motility protein  29.77 
 
 		 351 aa  153  5e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000175789  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0210  twitching motility protein  30.62 
 
 		 399 aa  146  7.0000000000000006e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0964904  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0110  type IV secretion system protein DotB  30.72 
 
 		 387 aa  145  9e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0132297  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3092  twitching motility family protein  30.6 
 
 		 341 aa  143  6e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000184946 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1995  twitching motility protein  29.04 
 
 		 401 aa  142  7e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.206221 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3294  twitching motility family protein  31.85 
 
 		 326 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0889  twitching motility protein  33.04 
 
 		 351 aa  140  3e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2561  twitching motility protein  32.9 
 
 		 352 aa  140  3e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4253  twitching motility family protein  33.46 
 
 		 341 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.626068  normal  0.518101 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3679  type II secretion system protein E  30.6 
 
 		 380 aa  140  4.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.165494 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0745  twitching motility protein  31.02 
 
 		 326 aa  139  6e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.55991  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3110  twitching motility family protein  33.09 
 
 		 326 aa  139  8.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0764  twitching motility protein  33.09 
 
 		 326 aa  139  8.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.160619  hitchhiker  0.0000267931 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02780  predicted transporter  30.72 
 
 		 326 aa  138  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.374196  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0245  twitching motility protein  36.27 
 
 		 359 aa  137  2e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.292052  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02743  hypothetical protein  30.72 
 
 		 326 aa  138  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.390847  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1167  twitching motility protein  33.11 
 
 		 375 aa  138  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.69165  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1448  twitching motility protein  33.33 
 
 		 358 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.991053  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2068  twitching motility protein  28.33 
 
 		 387 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0618461  normal  0.330404 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1891  twitching motility protein  28.33 
 
 		 387 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3615  twitching motility protein  29.43 
 
 		 389 aa  137  4e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.326241  normal  0.111826 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0310  twitching motility protein  29.97 
 
 		 347 aa  137  4e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3527  twitching motility protein  30.65 
 
 		 344 aa  137  4e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.318184  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3192  twitching motility protein  36.06 
 
 		 367 aa  135  9e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0324177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2483  twitching motility protein  28.9 
 
 		 387 aa  135  9e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0708894  normal  0.285122 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3631  twitching motility protein  36.36 
 
 		 383 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3382  twitching motility family protein  33.09 
 
 		 326 aa  135  9.999999999999999e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06741  PilT2-like protein  31.33 
 
 		 423 aa  135  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0257  twitching motility protein  27.82 
 
 		 350 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0278  twitching motility protein  32.23 
 
 		 352 aa  134  1.9999999999999998e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.378494  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3084  twitching motility protein  34.76 
 
 		 360 aa  135  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0672592 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06901  twitching motility protein  32.32 
 
 		 357 aa  134  3e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.595138  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2020  twitching motility protein PilT  36.5 
 
 		 350 aa  134  3e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.403517  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1584  twitching motility protein  34.98 
 
 		 373 aa  134  3e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08231  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  29.8 
 
 		 347 aa  133  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.338679  hitchhiker  0.0000605149 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3736  twitching motility protein  35.89 
 
 		 383 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0220  twitching motility protein  37.32 
 
 		 383 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1421  twitching motility protein  32.03 
 
 		 360 aa  133  5e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0544  twitching mobility protein PilT, type II/IV secretion system protein  35.1 
 
 		 345 aa  132  1.0000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3324  twitching motility protein  34.21 
 
 		 445 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416705 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0505  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  30.58 
 
 		 347 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1811  twitching motility protein  28.37 
 
 		 380 aa  132  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.148684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2777  twitching motility protein  34.21 
 
 		 434 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3356  twitching motility protein  32.19 
 
 		 326 aa  132  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00189861 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1737  twitching motility protein PilT  36.5 
 
 		 350 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00977471  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3660  pilus retraction protein PilT  37.62 
 
 		 431 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0847  twitching motility protein  37.68 
 
 		 370 aa  131  2.0000000000000002e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.788432 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1805  hypothetical protein  29.61 
 
 		 392 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00695665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5603  type II secretion system protein E  30.65 
 
 		 393 aa  130  3e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.489222  normal  0.0238979 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1802  twitching motility protein  32.33 
 
 		 369 aa  130  3e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.579397 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0335  twitching motility protein PilT  38 
 
 		 398 aa  130  3e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0230  twitching motility protein PilT  37.09 
 
 		 356 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.571301  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1066  twitching motility protein  34.63 
 
 		 358 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1747  twitching motility protein  34.59 
 
 		 370 aa  130  6e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.555642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2102  twitching motility protein  30.25 
 
 		 348 aa  130  6e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.927915 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1744  twitching motility protein  33.2 
 
 		 362 aa  130  6e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2517  twitching motility protein  30.52 
 
 		 404 aa  129  6e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0242978 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2031  twitching motility protein  35.91 
 
 		 356 aa  129  6e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.517106  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0260  pilus retraction protein PilT  37.09 
 
 		 356 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0840945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1661  twitching mobility protein  29.52 
 
 		 402 aa  129  7.000000000000001e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.423515  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5029  twitching motility protein  35.64 
 
 		 428 aa  129  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.580739 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0264  twitching motility protein  31.6 
 
 		 403 aa  129  8.000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.723918 
 
 
-
 
NC_002936  DET0922  twitching mobility protein  34.13 
 
 		 363 aa  129  9.000000000000001e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.987668  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1543  twitching motility protein  34.15 
 
 		 423 aa  129  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2718  twitching motility protein  28.92 
 
 		 382 aa  129  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0507108  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1188  twitching motility protein  32.96 
 
 		 358 aa  129  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.231991  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5655  type II secretion system protein E  36.84 
 
 		 366 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0094034 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1467  twitching motility protein  31.32 
 
 		 360 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002458  twitching motility protein PilT  34.62 
 
 		 346 aa  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5872  type II secretion system protein E  36.84 
 
 		 366 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03150  Tfp pilus assembly protein  25.93 
 
 		 377 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.602648  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1359  twitching mobility protein  35.5 
 
 		 371 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00791421  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0146  twitching motility protein PilT  33.05 
 
 		 386 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2476  twitching motility protein  29.58 
 
 		 345 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0833  twitching motility protein  38.07 
 
 		 374 aa  128  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.213742  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1990  hypothetical protein  36.65 
 
 		 344 aa  128  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1505  twitching motility protein  31.76 
 
 		 349 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.831858  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2420  pilus retraction protein PilT  31.02 
 
 		 377 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0603  twitching motility protein  34.9 
 
 		 357 aa  127  2.0000000000000002e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03577  hypothetical protein  34.62 
 
 		 346 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1750  twitching motility protein  27.74 
 
 		 345 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1141  Tfp pilus assembly protein pilus retraction ATPase  32.33 
 
 		 371 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000163324  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1553  twitching motility protein  31.9 
 
 		 339 aa  128  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0974985 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05980  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  34.04 
 
 		 360 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1795  twitching motility protein  31.31 
 
 		 426 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.567146 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0831  twitching motility protein  38.07 
 
 		 374 aa  128  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.859854  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2705  twitching motility protein  30.28 
 
 		 370 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.48227  normal  0.974837 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_793  twitching mobility protein  33.73 
 
 		 360 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3586  twitching motility protein  34.48 
 
 		 377 aa  127  3e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4148  twitching motility protein  34.12 
 
 		 381 aa  127  3e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2966  twitching motility protein  35.75 
 
 		 357 aa  127  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3606  twitching motility protein  30.59 
 
 		 338 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0256  twitching motility protein  36.65 
 
 		 359 aa  127  4.0000000000000003e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>