More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0543 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0543  twitching motility protein  100 
 
 
362 aa  741    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.22582  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3160  twitching motility protein  45.92 
 
 
387 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217651  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0199  pilus retraction protein PilT  45.76 
 
 
387 aa  309  4e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.035098 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0146  twitching motility protein PilT  46.33 
 
 
386 aa  309  5.9999999999999995e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3736  twitching motility protein  45.3 
 
 
383 aa  306  3e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3631  twitching motility protein  45.27 
 
 
383 aa  306  5.0000000000000004e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0220  twitching motility protein  43.79 
 
 
383 aa  302  7.000000000000001e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0704  twitching motility protein  43.87 
 
 
383 aa  298  1e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3178  twitching motility protein  44.19 
 
 
388 aa  296  4e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2406  twitching motility protein, PilT-like  44.35 
 
 
388 aa  296  4e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.776095  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3433  twitching motility protein  42.58 
 
 
437 aa  295  7e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.404261  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1505  twitching motility protein  44.01 
 
 
349 aa  295  7e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.831858  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2413  twitching motility protein  41.79 
 
 
351 aa  294  2e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1167  twitching motility protein  42.86 
 
 
375 aa  293  3e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.69165  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1448  twitching motility protein  43.82 
 
 
358 aa  293  3e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.991053  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1106  twitching motility protein  43.6 
 
 
351 aa  291  1e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.321082  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1724  twitching motility protein  43.9 
 
 
360 aa  290  2e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3368  twitching motility protein  42.37 
 
 
427 aa  290  3e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00118657  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3450  twitching motility protein  41.81 
 
 
427 aa  288  9e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0803395  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3514  twitching motility protein  41.81 
 
 
427 aa  288  9e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.190641  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0257  twitching motility protein  43.2 
 
 
350 aa  286  4e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1492  twitching motility protein PilT  43.3 
 
 
365 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144768  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0871  putative protein transport, PilT-like  44.98 
 
 
378 aa  280  2e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2148  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  42.33 
 
 
374 aa  280  2e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1841  twitching motility protein  42.03 
 
 
349 aa  280  4e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.616267  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1165  pilus retraction ATPase PilT  43.48 
 
 
367 aa  280  4e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.591926  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1990  hypothetical protein  45.03 
 
 
344 aa  279  5e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0874  twitching motility protein  43.03 
 
 
360 aa  279  5e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03297  twitching motility protein PilT  43.11 
 
 
349 aa  279  6e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.987753  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1995  hypothetical protein  45.03 
 
 
344 aa  279  6e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1737  twitching motility protein PilT  44.04 
 
 
350 aa  279  6e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00977471  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1333  twitching motility protein  41.81 
 
 
345 aa  278  8e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0112575 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1969  twitching motility protein  40.87 
 
 
374 aa  278  8e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0668  twitching motility protein  42.32 
 
 
365 aa  278  8e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.157686  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1128  twitching motility protein  41.23 
 
 
345 aa  278  8e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0169735  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1194  pilus retraction ATPase PilT  41.89 
 
 
345 aa  278  8e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0809497  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1265  pilus retraction ATPase PilT  41.89 
 
 
345 aa  278  8e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00395146  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0657  twitching motility protein  43.24 
 
 
366 aa  278  1e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3351  twitching motility protein PilT  41.89 
 
 
345 aa  278  1e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0657  twitching motility protein  43.24 
 
 
366 aa  278  1e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03577  hypothetical protein  42.04 
 
 
346 aa  278  1e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3527  twitching motility protein  42.99 
 
 
344 aa  278  1e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.318184  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1654  twitching motility protein  39.83 
 
 
363 aa  278  1e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2020  twitching motility protein PilT  44.34 
 
 
350 aa  278  1e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.403517  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3703  twitching motility protein  44 
 
 
347 aa  277  2e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0931  twitching motility protein  42.59 
 
 
345 aa  277  2e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.413956  normal  0.826545 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0623  twitching motility protein  43.24 
 
 
366 aa  277  2e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01993  twitching motility protein  42.59 
 
 
345 aa  277  2e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.913118  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1233  twitching motility protein PilT  41.4 
 
 
344 aa  277  2e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000670856  normal  0.482312 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2476  twitching motility protein  41.59 
 
 
345 aa  277  2e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1195  pilus retraction ATPase PilT  41.59 
 
 
345 aa  277  2e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.035221  normal  0.726938 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1883  twitching motility protein  42.11 
 
 
351 aa  276  3e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000175789  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0758  twitching motility protein  41.83 
 
 
366 aa  276  4e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0178166 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3883  pilus retraction protein PilT  42.77 
 
 
347 aa  276  4e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2859  twitching motility protein  41.3 
 
 
345 aa  276  4e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00311104  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4827  twitching motility protein  42.18 
 
 
366 aa  276  4e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.465197  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3662  twitching motility protein PilT  43.25 
 
 
347 aa  276  5e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.69581  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2594  twitching motility protein  41.16 
 
 
366 aa  276  5e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0969  twitching motility protein  48.24 
 
 
365 aa  276  5e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3717  twitching motility protein  42.94 
 
 
347 aa  276  5e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2686  twitching motility protein  41.59 
 
 
345 aa  276  5e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002458  twitching motility protein PilT  41.74 
 
 
346 aa  276  6e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1138  twitching motility protein  40.76 
 
 
345 aa  275  7e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1339  twitching motility protein  41.3 
 
 
345 aa  275  8e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0176269  hitchhiker  0.0000000675214 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3182  twitching motility protein  41.3 
 
 
345 aa  275  8e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000300358  normal  0.0171368 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3039  twitching motility protein  41.3 
 
 
345 aa  275  8e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00110048  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2070  twitching motility protein  39.71 
 
 
362 aa  275  1.0000000000000001e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2681  twitching motility protein  41.3 
 
 
349 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.172502  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1346  twitching motility protein  43.11 
 
 
566 aa  275  1.0000000000000001e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1632  twitching motility protein  40.88 
 
 
366 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0264  twitching motility protein PilT  41.16 
 
 
349 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0441  twitching motility protein  41.16 
 
 
349 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000176811 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1221  twitching motility protein  43.69 
 
 
344 aa  274  2.0000000000000002e-72  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.475571  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2223  twitching motility protein  41.83 
 
 
366 aa  274  2.0000000000000002e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.659766  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2419  pilus retraction ATPase PilT  42.77 
 
 
347 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1253  twitching motility protein  43.69 
 
 
344 aa  274  2.0000000000000002e-72  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2243  hypothetical protein  40.68 
 
 
373 aa  273  3e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0375  pilus retraction protein PilT  39.2 
 
 
372 aa  273  3e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1131  twitching motility protein  40.98 
 
 
360 aa  273  4.0000000000000004e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.809253  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1394  pilus retraction protein PilT  42.03 
 
 
365 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3024  twitching motility protein  41 
 
 
345 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00035663  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0256  twitching motility protein  43.47 
 
 
359 aa  273  4.0000000000000004e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2271  hypothetical protein  40.56 
 
 
373 aa  273  5.000000000000001e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4149  twitching motility protein  41.4 
 
 
344 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.84862 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0998  putative type II/IV secretion system protein  41.64 
 
 
373 aa  272  6e-72  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00360033  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1387  twitching motility protein  39.83 
 
 
364 aa  272  6e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.573259 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1917  twitching motility protein  42.86 
 
 
360 aa  272  6e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.979204 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0544  twitching mobility protein PilT, type II/IV secretion system protein  40.84 
 
 
345 aa  272  7e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2681  twitching motility protein  42.2 
 
 
368 aa  272  8.000000000000001e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1391  twitching motility protein  40.97 
 
 
375 aa  272  8.000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.899661  normal  0.0234159 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3878  twitching motility protein  43.38 
 
 
347 aa  271  9e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0576559  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4696  twitching motility protein  39.2 
 
 
374 aa  271  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.787911 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0077  twitching motility protein  42.44 
 
 
384 aa  271  1e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2215  twitching motility protein  43.6 
 
 
368 aa  271  1e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1661  twitching mobility protein  40.51 
 
 
402 aa  271  1e-71  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.423515  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2513  twitching motility protein  39.34 
 
 
365 aa  271  1e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_793  twitching mobility protein  41.47 
 
 
360 aa  271  1e-71  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3244  twitching motility protein  40.46 
 
 
356 aa  271  1e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1255  twitching mobility protein  40.57 
 
 
358 aa  271  2e-71  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2916  type II secretion system protein (twitching motility protein)  43.88 
 
 
402 aa  270  2e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.465688  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>