More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2666 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_2666  twitching motility protein  100 
 
 
368 aa  753    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0871  putative protein transport, PilT-like  63.22 
 
 
378 aa  419  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1744  twitching motility protein  50.29 
 
 
362 aa  343  2e-93  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1724  twitching motility protein  52.79 
 
 
360 aa  342  5.999999999999999e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0874  twitching motility protein  50.3 
 
 
360 aa  339  2.9999999999999998e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1106  twitching motility protein  51.49 
 
 
351 aa  335  7e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.321082  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4696  twitching motility protein  50.14 
 
 
374 aa  335  7.999999999999999e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.787911 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1883  twitching motility protein  50.86 
 
 
351 aa  334  1e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000175789  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0951  twitching motility protein  50.73 
 
 
372 aa  334  1e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3256  twitching motility protein  51.49 
 
 
360 aa  332  9e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0375  pilus retraction protein PilT  48.99 
 
 
372 aa  329  4e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1505  twitching motility protein  52.1 
 
 
349 aa  329  5.0000000000000004e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.831858  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3527  twitching motility protein  50 
 
 
344 aa  328  7e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.318184  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1165  pilus retraction ATPase PilT  51.19 
 
 
367 aa  328  8e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.591926  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0704  twitching motility protein  49.58 
 
 
383 aa  327  1.0000000000000001e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2070  twitching motility protein  49.57 
 
 
362 aa  327  2.0000000000000001e-88  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1637  twitching motility protein  48.14 
 
 
372 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.601857  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1188  twitching motility protein  48.57 
 
 
358 aa  326  3e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.231991  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1611  twitching motility protein  48.14 
 
 
372 aa  327  3e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1553  twitching motility protein  52.85 
 
 
339 aa  326  5e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0974985 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1969  twitching motility protein  48.7 
 
 
374 aa  324  1e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1823  twitching motility protein  47.06 
 
 
378 aa  323  2e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.227924  normal  0.842745 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1632  twitching motility protein  49.29 
 
 
366 aa  323  2e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2594  twitching motility protein  49.29 
 
 
366 aa  323  3e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17750  pilus retraction protein PilT  48.62 
 
 
397 aa  322  7e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.643822 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0310  twitching motility protein  49.4 
 
 
347 aa  321  9.999999999999999e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1035  twitching motility protein  48.25 
 
 
360 aa  321  9.999999999999999e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1391  twitching motility protein  47.26 
 
 
375 aa  321  9.999999999999999e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.899661  normal  0.0234159 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3244  twitching motility protein  48.81 
 
 
356 aa  320  3e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1321  twitching motility protein  49.24 
 
 
362 aa  319  3.9999999999999996e-86  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0136212 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03297  twitching motility protein PilT  49.7 
 
 
349 aa  318  7.999999999999999e-86  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.987753  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1126  twitching motility protein  48.48 
 
 
430 aa  318  9e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00181  PilT1-like protein  46.88 
 
 
358 aa  318  1e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1492  twitching motility protein PilT  48 
 
 
365 aa  317  2e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144768  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3662  twitching motility protein PilT  49.7 
 
 
347 aa  317  2e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.69581  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2681  twitching motility protein  47.99 
 
 
368 aa  317  2e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2936  twitching motility protein  48.25 
 
 
347 aa  317  2e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.745836  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1346  twitching motility protein  47.18 
 
 
566 aa  316  3e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4183  twitching motility protein  47.01 
 
 
372 aa  317  3e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.212541 
 
 
-
 
NC_002936  DET0922  twitching mobility protein  47.14 
 
 
363 aa  315  5e-85  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.987668  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_793  twitching mobility protein  46.57 
 
 
360 aa  315  8e-85  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4149  twitching motility protein  46.33 
 
 
344 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.84862 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2800  pilus retraction protein PilT  48.25 
 
 
347 aa  314  9.999999999999999e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0668  twitching motility protein  50 
 
 
365 aa  315  9.999999999999999e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.157686  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3039  type II secretion system protein (twitching motility protein) (PilT)  47.8 
 
 
344 aa  313  2.9999999999999996e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.37999  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0657  twitching motility protein  49.69 
 
 
366 aa  313  3.9999999999999997e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0657  twitching motility protein  49.69 
 
 
366 aa  312  5.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5045  twitching motility protein  46.63 
 
 
344 aa  312  6.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.597487  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1394  pilus retraction protein PilT  47.71 
 
 
365 aa  312  6.999999999999999e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0806  twitching motility protein  46 
 
 
360 aa  312  7.999999999999999e-84  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0623  twitching motility protein  49.69 
 
 
366 aa  311  9e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0478  pilus retraction protein PilT  46.04 
 
 
344 aa  311  1e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2918  twitching motility protein  46.63 
 
 
347 aa  310  2e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2419  pilus retraction ATPase PilT  46.76 
 
 
347 aa  310  2e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2506  twitching motility protein  46.63 
 
 
347 aa  310  2e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.876718 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0084  twitching motility protein  47.86 
 
 
357 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0495  twitching motility protein PilT  46.33 
 
 
344 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05180  twitching motility protein PilT  46.33 
 
 
344 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06901  twitching motility protein  46.86 
 
 
357 aa  309  4e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.595138  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1128  twitching motility protein  47.94 
 
 
345 aa  309  5e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0169735  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0257  twitching motility protein  45.69 
 
 
350 aa  308  6.999999999999999e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3027  twitching motility protein  47.38 
 
 
382 aa  308  9e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2102  twitching motility protein  48.22 
 
 
348 aa  308  1.0000000000000001e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.927915 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3053  twitching motility protein  46.2 
 
 
346 aa  306  2.0000000000000002e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.39006  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1333  twitching motility protein  49.24 
 
 
345 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0112575 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3717  twitching motility protein  48.02 
 
 
347 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3368  twitching motility protein  48.99 
 
 
427 aa  306  3e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00118657  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2681  twitching motility protein  47.94 
 
 
349 aa  306  3e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.172502  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0067  twitching motility protein  47.41 
 
 
356 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.78052e-25 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3351  twitching motility protein PilT  47.94 
 
 
345 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2215  twitching motility protein  47.93 
 
 
368 aa  306  4.0000000000000004e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3631  twitching motility protein  46.96 
 
 
383 aa  306  5.0000000000000004e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2682  twitching motility protein  46.33 
 
 
347 aa  305  6e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.310327 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3736  twitching motility protein  46.96 
 
 
383 aa  305  6e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1747  twitching motility protein  45.38 
 
 
370 aa  305  6e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.555642  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2413  twitching motility protein  47.09 
 
 
351 aa  305  7e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3450  twitching motility protein  48.7 
 
 
427 aa  305  7e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0803395  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1995  hypothetical protein  45.93 
 
 
344 aa  305  8.000000000000001e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3514  twitching motility protein  48.7 
 
 
427 aa  305  8.000000000000001e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.190641  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3039  twitching motility protein  47.65 
 
 
345 aa  305  8.000000000000001e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00110048  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3182  twitching motility protein  47.65 
 
 
345 aa  305  8.000000000000001e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000300358  normal  0.0171368 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1339  twitching motility protein  47.65 
 
 
345 aa  305  8.000000000000001e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0176269  hitchhiker  0.0000000675214 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1990  hypothetical protein  45.93 
 
 
344 aa  305  9.000000000000001e-82  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2686  twitching motility protein  47.94 
 
 
345 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1194  pilus retraction ATPase PilT  47.65 
 
 
345 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0809497  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1265  pilus retraction ATPase PilT  47.65 
 
 
345 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00395146  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1195  pilus retraction ATPase PilT  47.65 
 
 
345 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.035221  normal  0.726938 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2476  twitching motility protein  47.65 
 
 
345 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03090  Pilus retraction protein  46.63 
 
 
344 aa  303  2.0000000000000002e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.166876  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0245  twitching motility protein  48.05 
 
 
359 aa  304  2.0000000000000002e-81  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.292052  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002458  twitching motility protein PilT  47.11 
 
 
346 aa  304  2.0000000000000002e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3433  twitching motility protein  48.12 
 
 
437 aa  304  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.404261  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0014  twitching motility protein PilT  46.97 
 
 
345 aa  304  2.0000000000000002e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03577  hypothetical protein  47.11 
 
 
346 aa  304  2.0000000000000002e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1737  twitching motility protein PilT  47.37 
 
 
350 aa  304  2.0000000000000002e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00977471  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1138  twitching motility protein  46.78 
 
 
345 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1233  twitching motility protein PilT  48.63 
 
 
344 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000670856  normal  0.482312 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1750  twitching motility protein  48.33 
 
 
345 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0537  twitching motility protein  45.45 
 
 
344 aa  303  3.0000000000000004e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2859  twitching motility protein  47.06 
 
 
345 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00311104  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>