More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0814 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0814  twitching motility protein  100 
 
 		 361 aa  738    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17750  pilus retraction protein PilT  44.67 
 
 		 397 aa  298  1e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.643822 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1505  twitching motility protein  43.31 
 
 		 349 aa  295  8e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.831858  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1841  twitching motility protein  42.73 
 
 		 349 aa  288  1e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.616267  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0441  twitching motility protein  42.94 
 
 		 349 aa  285  7e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000176811 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0264  twitching motility protein PilT  42.94 
 
 		 349 aa  285  7e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2413  twitching motility protein  41.45 
 
 		 351 aa  285  1.0000000000000001e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0375  pilus retraction protein PilT  41.6 
 
 		 372 aa  283  2.0000000000000002e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1321  twitching motility protein  44.57 
 
 		 362 aa  282  8.000000000000001e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0136212 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1883  twitching motility protein  42.56 
 
 		 351 aa  281  1e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000175789  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1637  twitching motility protein  41.5 
 
 		 372 aa  279  6e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.601857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4183  twitching motility protein  41.53 
 
 		 372 aa  279  6e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.212541 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1969  twitching motility protein  41.24 
 
 		 374 aa  279  6e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1611  twitching motility protein  41.5 
 
 		 372 aa  278  8e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3662  twitching motility protein PilT  43.24 
 
 		 347 aa  278  1e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.69581  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1995  hypothetical protein  44.12 
 
 		 344 aa  278  2e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1990  hypothetical protein  44.12 
 
 		 344 aa  277  2e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0310  twitching motility protein  44.07 
 
 		 347 aa  277  2e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0889  twitching motility protein  42.82 
 
 		 351 aa  277  3e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0871  putative protein transport, PilT-like  40.97 
 
 		 378 aa  276  5e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2070  twitching motility protein  41.03 
 
 		 362 aa  276  5e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1737  twitching motility protein PilT  42.44 
 
 		 350 aa  276  5e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00977471  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1823  twitching motility protein  43.84 
 
 		 378 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.227924  normal  0.842745 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3027  twitching motility protein  43.06 
 
 		 382 aa  275  1.0000000000000001e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3703  twitching motility protein  43.53 
 
 		 347 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2020  twitching motility protein PilT  42.73 
 
 		 350 aa  275  1.0000000000000001e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.403517  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0067  twitching motility protein  41.48 
 
 		 356 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.78052e-25 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3527  twitching motility protein  42.77 
 
 		 344 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.318184  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0257  twitching motility protein  38.9 
 
 		 350 aa  274  2.0000000000000002e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0316  twitching motility protein  44.55 
 
 		 345 aa  273  5.000000000000001e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.436596  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1131  twitching motility protein  42.27 
 
 		 360 aa  272  5.000000000000001e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.809253  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0505  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  41.57 
 
 		 347 aa  273  5.000000000000001e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1917  twitching motility protein  42.33 
 
 		 360 aa  272  5.000000000000001e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.979204 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0267  pilus retraction protein PilT  42.27 
 
 		 350 aa  272  6e-72  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1750  twitching motility protein  42.35 
 
 		 345 aa  272  7e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3433  twitching motility protein  42.74 
 
 		 437 aa  271  1e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.404261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0084  twitching motility protein  41.67 
 
 		 357 aa  271  1e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1346  twitching motility protein  41.67 
 
 		 566 aa  271  1e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_793  twitching mobility protein  38.44 
 
 		 360 aa  271  2e-71  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3450  twitching motility protein  42.2 
 
 		 427 aa  270  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0803395  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03577  hypothetical protein  42.68 
 
 		 346 aa  270  2.9999999999999997e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0264  twitching motility protein  41.45 
 
 		 403 aa  270  2.9999999999999997e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.723918 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3514  twitching motility protein  42.2 
 
 		 427 aa  270  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.190641  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0806  twitching motility protein  39.13 
 
 		 360 aa  269  5e-71  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3368  twitching motility protein  41.62 
 
 		 427 aa  269  5.9999999999999995e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00118657  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1106  twitching motility protein  41.33 
 
 		 351 aa  269  5.9999999999999995e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.321082  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0478  pilus retraction protein PilT  43.33 
 
 		 344 aa  268  7e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0874  twitching motility protein  40.56 
 
 		 360 aa  269  7e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3878  twitching motility protein  43.82 
 
 		 347 aa  269  7e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0576559  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0922  twitching mobility protein  38.73 
 
 		 363 aa  268  8.999999999999999e-71  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.987668  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03297  twitching motility protein PilT  41.98 
 
 		 349 aa  268  8.999999999999999e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.987753  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0536  twitching motility protein  40.23 
 
 		 358 aa  268  8.999999999999999e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1724  twitching motility protein  41.69 
 
 		 360 aa  268  1e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2107  twitching motility protein  42.65 
 
 		 347 aa  267  2e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0293  twitching motility protein  41.4 
 
 		 350 aa  266  2.9999999999999995e-70  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002458  twitching motility protein PilT  41.77 
 
 		 346 aa  266  4e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2419  pilus retraction ATPase PilT  41.76 
 
 		 347 aa  266  4e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4696  twitching motility protein  40.17 
 
 		 374 aa  266  4e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.787911 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0951  twitching motility protein  41.03 
 
 		 372 aa  266  5e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1128  twitching motility protein  41.72 
 
 		 345 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0169735  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3717  twitching motility protein  41.42 
 
 		 347 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00181  PilT1-like protein  41.76 
 
 		 358 aa  265  8e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5045  twitching motility protein  43.33 
 
 		 344 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.597487  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0704  twitching motility protein  42.36 
 
 		 383 aa  265  1e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03090  Pilus retraction protein  43.37 
 
 		 344 aa  265  1e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.166876  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1195  pilus retraction ATPase PilT  41.59 
 
 		 345 aa  264  1e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.035221  normal  0.726938 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3883  pilus retraction protein PilT  41.76 
 
 		 347 aa  264  2e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0931  twitching motility protein  41.64 
 
 		 345 aa  264  2e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.413956  normal  0.826545 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2686  twitching motility protein  41.89 
 
 		 345 aa  264  2e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0495  twitching motility protein PilT  42.35 
 
 		 344 aa  264  2e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1194  pilus retraction ATPase PilT  41.59 
 
 		 345 aa  264  2e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0809497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1265  pilus retraction ATPase PilT  41.59 
 
 		 345 aa  264  2e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00395146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05180  twitching motility protein PilT  42.35 
 
 		 344 aa  264  2e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1138  twitching motility protein  41.84 
 
 		 345 aa  263  3e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3351  twitching motility protein PilT  41.59 
 
 		 345 aa  263  3e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2681  twitching motility protein  41 
 
 		 349 aa  263  3e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.172502  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2859  twitching motility protein  41.3 
 
 		 345 aa  263  3e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00311104  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2476  twitching motility protein  41.3 
 
 		 345 aa  263  4e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1126  twitching motility protein  39.83 
 
 		 430 aa  263  4e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2561  twitching motility protein  39.83 
 
 		 352 aa  263  4e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3160  twitching motility protein  40.17 
 
 		 387 aa  262  4.999999999999999e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217651  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3004  pilus retraction protein PilT  41.76 
 
 		 345 aa  263  4.999999999999999e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0278  twitching motility protein  43.33 
 
 		 347 aa  263  4.999999999999999e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1339  twitching motility protein  41.3 
 
 		 345 aa  262  6e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0176269  hitchhiker  0.0000000675214 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3182  twitching motility protein  41.3 
 
 		 345 aa  262  6e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000300358  normal  0.0171368 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3039  twitching motility protein  41.3 
 
 		 345 aa  262  6e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00110048  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0537  twitching motility protein  41.18 
 
 		 344 aa  262  8e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1537  twitching motility protein PilT  41.18 
 
 		 344 aa  261  8.999999999999999e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0396  twitching motility protein  42.65 
 
 		 347 aa  261  8.999999999999999e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.203182 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3221  twitching motility protein  40.8 
 
 		 356 aa  261  1e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3640  twitching motility protein PilT  43.03 
 
 		 344 aa  261  1e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0460  twitching motility protein  40.29 
 
 		 356 aa  261  1e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.16697  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1035  twitching motility protein  41.74 
 
 		 360 aa  261  1e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3178  twitching motility protein  40.46 
 
 		 388 aa  261  1e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4149  twitching motility protein  41.18 
 
 		 344 aa  261  2e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.84862 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1333  twitching motility protein  41.72 
 
 		 345 aa  260  2e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0112575 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4813  twitching motility protein  42.35 
 
 		 347 aa  260  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1233  twitching motility protein PilT  41.47 
 
 		 344 aa  261  2e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000670856  normal  0.482312 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1221  twitching motility protein  40.29 
 
 		 344 aa  260  3e-68  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.475571  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01993  twitching motility protein  41.64 
 
 		 345 aa  260  3e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.913118  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>