154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1077 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1077  hypothetical protein  100 
 
 		 298 aa  590  1e-168  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225792  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11740  hypothetical protein  90.6 
 
 		 297 aa  503  1e-141  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.22588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1461  extracellular solute-binding protein  34.85 
 
 		 251 aa  130  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.617285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5251  extracellular solute-binding protein  31.54 
 
 		 245 aa  120  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1200  hypothetical protein  31.03 
 
 		 274 aa  119  7e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.285337  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3146  extracellular solute-binding protein family 3  35.81 
 
 		 288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1423  putative polar amino acid transport system substrate-binding proetin  33.91 
 
 		 254 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0156729  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0260  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.38 
 
 		 243 aa  111  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.906193  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5004  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.18 
 
 		 245 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.828614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2954  hypothetical protein  33.01 
 
 		 244 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0510  extracellular solute-binding protein  31.67 
 
 		 245 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2470  solute-binding family 1 protein  26.69 
 
 		 245 aa  105  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.162983  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5010  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  31.33 
 
 		 251 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0342  amino acid ABC transporter periplasmic protein  34.53 
 
 		 247 aa  104  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.649622  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3481  hypothetical protein  26.36 
 
 		 264 aa  102  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0513  extracellular solute-binding protein  30.77 
 
 		 251 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0719  hypothetical protein  34.43 
 
 		 251 aa  101  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0507397  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1879  ABC transporter  31.88 
 
 		 263 aa  101  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00601  probable ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.55 
 
 		 265 aa  100  3e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0258  hypothetical protein  33.33 
 
 		 247 aa  99.8  4e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4955  hypothetical protein  28.33 
 
 		 245 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4828  extracellular solute-binding protein  27.95 
 
 		 232 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.425372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0556  amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  31.67 
 
 		 253 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2719  ABC transporter  34.27 
 
 		 248 aa  97.4  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.860262 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1741  conserved hypothetical ABC transporter protein  34.27 
 
 		 248 aa  97.4  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.497041  hitchhiker  0.00104039 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0823  extracellular solute-binding protein  34.05 
 
 		 270 aa  97.4  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.457883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0477  extracellular solute-binding protein  30.13 
 
 		 246 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2644  ABC transporter  34.27 
 
 		 248 aa  97.4  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1071  extracellular solute-binding protein  26.47 
 
 		 258 aa  97.1  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2682  ABC transporter  33.67 
 
 		 235 aa  96.7  4e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.76928 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05910  putative periplasmic transport system  31.3 
 
 		 243 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.760752 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2605  ABC transporter  33.95 
 
 		 248 aa  96.3  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2202  amino acid ABC transporter periplasmic protein  28.38 
 
 		 265 aa  95.5  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3063  amino acid ABC transporter periplasmic protein  31.56 
 
 		 264 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.898818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2149  ABC transporter  31.03 
 
 		 286 aa  92  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2148  hypothetical protein  34.81 
 
 		 258 aa  91.3  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.8287  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1085  hypothetical protein  26.5 
 
 		 264 aa  89.7  5e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.113674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1574  ABC transporter  32.55 
 
 		 259 aa  89  8e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00475707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3312  hypothetical protein  25.21 
 
 		 264 aa  87.8  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000132852  normal  0.0735869 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2283  ABC transporter  33.65 
 
 		 250 aa  87.8  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0261619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3168  hypothetical protein  25.21 
 
 		 264 aa  87.8  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000679304  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3169  hypothetical protein  25.21 
 
 		 264 aa  87.8  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000178583  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1202  extracellular solute-binding protein family 3  25 
 
 		 264 aa  87  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000133475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1151  hypothetical protein  27.54 
 
 		 264 aa  87  4e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000453875  normal  0.246745 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2355  ABC transporter  35.21 
 
 		 250 aa  87  4e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0184824  normal  0.0716025 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2473  succinate dehydrogenase (ubiquinone)  34.45 
 
 		 243 aa  86.7  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.675099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0421  extracellular solute-binding protein  35.8 
 
 		 252 aa  87  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4000  extracellular solute-binding protein  26.55 
 
 		 245 aa  86.3  6e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.167606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2551  extracellular solute-binding protein  27.07 
 
 		 272 aa  85.9  7e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.36291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1085  hypothetical protein  26.13 
 
 		 264 aa  85.5  9e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0391886  normal  0.830979 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5282  extracellular solute-binding protein  35.2 
 
 		 270 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2571  extracellular solute-binding protein  25.5 
 
 		 269 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0744474  hitchhiker  0.0010566 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3223  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding  29.36 
 
 		 255 aa  80.9  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.338771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1011  hypothetical protein  25.91 
 
 		 248 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0100  extracellular solute-binding protein family 3  26.03 
 
 		 251 aa  79.3  0.00000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.246862  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3985  hypothetical protein  23.37 
 
 		 262 aa  79.3  0.00000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.817581 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1937  ABC transporter  34.16 
 
 		 241 aa  79  0.00000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.579626  normal  0.017487 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3070  extracellular solute-binding protein  24.43 
 
 		 286 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2177  extracellular solute-binding protein  30.77 
 
 		 258 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0443241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1008  amino acid ABC transporter  27.62 
 
 		 259 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0840  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein, putative  23.61 
 
 		 247 aa  75.1  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0730433  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2034  extracellular solute-binding protein  29.81 
 
 		 260 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.530629  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1973  ABC transporter  30.5 
 
 		 235 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5028  extracellular solute-binding protein  32.18 
 
 		 262 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3729  periplasmic amino acid-binding protein-related protein  29.81 
 
 		 260 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.958357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0486  extracellular solute-binding protein  27.88 
 
 		 262 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2079  extracellular solute-binding protein  24.4 
 
 		 262 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4852  extracellular solute-binding protein  29.09 
 
 		 262 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157097  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4979  periplasmic binding protein, putative  28.48 
 
 		 262 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0056  transporter, putative  24.9 
 
 		 252 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1477  extracellular solute-binding protein family 3  29.25 
 
 		 254 aa  67  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3223  extracellular solute-binding protein  25.45 
 
 		 268 aa  67.4  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0247  extracellular solute-binding protein  28.02 
 
 		 258 aa  65.9  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000342463  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1295  hypothetical protein  28.51 
 
 		 239 aa  65.5  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.634955  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4441  amino acid ABC transporter periplasmic protein  30.65 
 
 		 259 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65870  hypothetical protein  31.25 
 
 		 258 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2944  hypothetical protein  26.56 
 
 		 246 aa  63.9  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5716  hypothetical protein  31.25 
 
 		 258 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3879  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.61 
 
 		 235 aa  62.4  0.000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0051  extracellular solute-binding protein family 3  27.72 
 
 		 264 aa  62.8  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3932  amino acid ABC transporter periplasmic protein  23.81 
 
 		 262 aa  59.7  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3734  extracellular solute-binding protein  30.65 
 
 		 247 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1919  amino acid ABC transporter periplasmic protein  29.07 
 
 		 247 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0371115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1595  extracellular solute-binding protein  27.34 
 
 		 262 aa  57.4  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.614347  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4230  hypothetical protein  23.58 
 
 		 247 aa  57  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4365  hypothetical protein  23.17 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3391  putative PAS/PAC sensor protein  26.52 
 
 		 1301 aa  56.2  0.0000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0258089  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1080  extracellular solute-binding protein  28.24 
 
 		 241 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.950195  normal  0.541205 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4158  extracellular solute-binding protein family 3  23.89 
 
 		 247 aa  55.8  0.0000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4742  hypothetical protein  30.51 
 
 		 250 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.177685  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1583  ABC transporter periplasmic-binding protein  24.31 
 
 		 253 aa  55.1  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0436102  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0482  hypothetical protein  25.83 
 
 		 258 aa  55.1  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3508  amino acid ABC transporter  22.88 
 
 		 250 aa  55.5  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1070  extracellular solute-binding protein  24.11 
 
 		 272 aa  54.3  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000162274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54230  hypothetical protein  30.43 
 
 		 250 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.638501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4251  amino acid ABC transporter periplasmic protein  28.18 
 
 		 244 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000526957 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3858  hypothetical protein  26.49 
 
 		 257 aa  53.9  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1142  extracellular solute-binding protein  23.66 
 
 		 272 aa  53.5  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000284369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1074  extracellular solute-binding protein  23.66 
 
 		 272 aa  53.5  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0387  extracellular solute-binding protein family 3  27.56 
 
 		 259 aa  53.1  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0965219 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>