More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1225 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1225  transporter component  100 
 
 		 377 aa  751    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.107173  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21021  leukotoxin secretion protein-like protein  58.33 
 
 		 376 aa  393  1e-108  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.326291  normal  0.825476 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00851  transporter component  44.74 
 
 		 391 aa  314  9.999999999999999e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0698432 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2526  leukotoxin secretion protein  41.82 
 
 		 417 aa  283  5.000000000000001e-75  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0218  leukotoxin secretion protein  38.99 
 
 		 396 aa  270  2.9999999999999997e-71  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14321  hypothetical protein  36.03 
 
 		 387 aa  233  3e-60  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.471821  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1842  secretion protein HlyD family protein  37.27 
 
 		 330 aa  186  8e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0372122  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0636  secretion protein HlyD family protein  35.42 
 
 		 329 aa  177  4e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0903899  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1904  hemolysin secretion protein-like  29.38 
 
 		 441 aa  173  2.9999999999999996e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.466134  normal  0.309514 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1658  secretion protein HlyD family protein  35.09 
 
 		 330 aa  167  4e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.51372  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1183  leukotoxin secretion protein-like  31.96 
 
 		 317 aa  166  6.9999999999999995e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01311  hypothetical protein  30.55 
 
 		 347 aa  165  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.420588 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1836  secretion protein HlyD family protein  46.59 
 
 		 522 aa  165  1.0000000000000001e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.161085  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1189  secretion protein HlyD  43.5 
 
 		 523 aa  158  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.981456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0527  secretion protein HlyD family protein  49.13 
 
 		 576 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0544  secretion protein HlyD family protein  49.13 
 
 		 576 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.212185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3579  secretion protein HlyD family protein  40.71 
 
 		 589 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.602098 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0118  hemolysin secretion protein-like  37.5 
 
 		 417 aa  137  2e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.00640851  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0729  secretion protein HlyD family protein  30.91 
 
 		 508 aa  86.7  6e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2003  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.25 
 
 		 456 aa  86.3  9e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.295152  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1890  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family protein  30.25 
 
 		 456 aa  86.3  9e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4382  secretion protein HlyD  28.85 
 
 		 515 aa  80.9  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807644  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06454  hypothetical protein  35.95 
 
 		 457 aa  80.1  0.00000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2368  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.24 
 
 		 447 aa  80.1  0.00000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0623  secretion protein HlyD  25.45 
 
 		 360 aa  79.7  0.00000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00726041 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4909  secretion protein HlyD family protein  28.8 
 
 		 404 aa  79.3  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.070438 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0983  secretion protein HlyD family protein  29.41 
 
 		 439 aa  79  0.0000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.213399  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0621  secretion protein HlyD  31.72 
 
 		 710 aa  75.5  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.749458  normal  0.582939 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5156  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.43 
 
 		 447 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.540903  normal  0.68595 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2557  secretion protein HlyD  26.34 
 
 		 498 aa  74.7  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5004  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.74 
 
 		 447 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278791  normal  0.604975 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2315  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  24.58 
 
 		 465 aa  73.9  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.321229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2692  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  24.58 
 
 		 465 aa  73.9  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2714  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  31.03 
 
 		 451 aa  73.6  0.000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.401669  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1969  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.64 
 
 		 468 aa  73.2  0.000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.786777  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3075  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  27.37 
 
 		 473 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.775261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1057  RTX toxin transporter  30.67 
 
 		 467 aa  72.4  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4164  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.21 
 
 		 469 aa  71.2  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.833076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6771  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.92 
 
 		 475 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3409  putative secretion protein  22.99 
 
 		 395 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.202661  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40230  putative secretion protein  22.99 
 
 		 395 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.975175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0020  leukotoxin secretion protein D  31.85 
 
 		 479 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15871  membrane fusion protein  29.69 
 
 		 357 aa  71.2  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1567  hemolysin secretion protein D  30.2 
 
 		 473 aa  71.2  0.00000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.496852  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03671  hemolysin secretion-like transmembrane protein  30.67 
 
 		 447 aa  70.9  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.107434 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0747  secretion protein HlyD  29.32 
 
 		 357 aa  70.5  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.554021  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2681  secretion protein HlyD family protein  26.83 
 
 		 509 aa  70.5  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3423  secretion protein HlyD family protein  26.83 
 
 		 509 aa  70.5  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.678336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3862  secretion protein-like protein  30.43 
 
 		 456 aa  70.5  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.941945  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0713  hypothetical protein  30.04 
 
 		 281 aa  70.1  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1515  HlyD family secretion protein  25.52 
 
 		 227 aa  70.1  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.619726 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1500  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.53 
 
 		 473 aa  70.1  0.00000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0567  secretion protein HlyD family  26.46 
 
 		 491 aa  69.7  0.00000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5422  HlyD family secretion protein  27.98 
 
 		 473 aa  68.9  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.970488  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1021  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  33.59 
 
 		 444 aa  68.9  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.458838 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0695  hypothetical protein  29.6 
 
 		 281 aa  68.6  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6210  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  30.82 
 
 		 480 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.596847  normal  0.481561 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1797  HlyD family secretion protein  34.53 
 
 		 441 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.250049  normal  0.0164192 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1509  secretion system protein D  23.97 
 
 		 378 aa  67  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6344  secretion protein HlyD family protein  26.53 
 
 		 387 aa  67  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0411  secretion protein HlyD family protein  24.62 
 
 		 504 aa  67  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1825  secretion protein HlyD family protein  31.94 
 
 		 457 aa  67  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0793741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2166  toxin secretion protein, HlyD family  31.94 
 
 		 445 aa  66.6  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3020  HlyD family secretion protein  25.52 
 
 		 179 aa  66.6  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.133267 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6669  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.86 
 
 		 466 aa  67  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00836718  normal  0.249657 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2166  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.83 
 
 		 427 aa  66.6  0.0000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862799 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3265  secretion protein HlyD family protein  30.37 
 
 		 549 aa  66.6  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2856  secretion protein HlyD family protein  30.37 
 
 		 549 aa  66.6  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0279875 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0883  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.54 
 
 		 491 aa  66.2  0.0000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.729698  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0076  secretion protein HlyD family protein  25.95 
 
 		 506 aa  66.2  0.0000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.247025  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1706  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  28.07 
 
 		 431 aa  66.2  0.0000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3707  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.44 
 
 		 354 aa  66.2  0.0000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2575  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.67 
 
 		 480 aa  65.9  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00303774 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0235  secretion protein HlyD  30.2 
 
 		 500 aa  65.5  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1445  putative membrane-fusion protein  29.9 
 
 		 434 aa  65.9  0.000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00910386  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0476  secretion protein HlyD  32.87 
 
 		 413 aa  65.9  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03509  membrane-fusion protein  27.91 
 
 		 417 aa  65.5  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1636  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.38 
 
 		 383 aa  65.1  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.372421  normal  0.934491 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1474  secretion system protein D  23.97 
 
 		 378 aa  64.7  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0934  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  34.44 
 
 		 440 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0970473  normal  0.242735 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1406  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  33.09 
 
 		 441 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.575733  normal  0.479497 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6406  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  30.19 
 
 		 480 aa  65.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1322  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  27.72 
 
 		 458 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.451764  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5105  secretion protein HlyD family protein  27.78 
 
 		 498 aa  64.7  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2759  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  25.42 
 
 		 421 aa  64.7  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.246245  normal  0.864922 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1094  secretion protein HlyD family protein  29.08 
 
 		 359 aa  63.9  0.000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1351  chromosome segregation ATPase-like protein  32.65 
 
 		 726 aa  63.9  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.100674 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0271  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  27.72 
 
 		 457 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1162  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.72 
 
 		 460 aa  63.5  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.793756 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0842  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30 
 
 		 394 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2276  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  24.03 
 
 		 389 aa  63.5  0.000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3346  secretion protein HlyD family protein  26.44 
 
 		 390 aa  63.5  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.605498  normal  0.0983986 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4926  HlyD family secretion protein  26.46 
 
 		 472 aa  63.2  0.000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2399  secretion protein HlyD  27.51 
 
 		 467 aa  63.2  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.105564  hitchhiker  0.0000263844 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0803  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.33 
 
 		 394 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4383  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.33 
 
 		 394 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.915143  normal  0.374406 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0090  putative multidrug transporter, HlyD family  26.63 
 
 		 368 aa  61.6  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1836  multidrug resistance efflux pump-like  28.18 
 
 		 431 aa  62  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0902612  normal  0.463921 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0827  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.33 
 
 		 394 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.72853  normal  0.590012 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6495  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.89 
 
 		 479 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>