103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2846 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_2846  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  100 
 
 
708 aa  1415    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0899  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  59.89 
 
 
713 aa  733    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.935654  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1011  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  59.92 
 
 
718 aa  746    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.114785 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5336  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  54.55 
 
 
495 aa  350  5e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.053898  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5030  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  53.87 
 
 
479 aa  343  5.999999999999999e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0195468 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7623  hypothetical protein  54.28 
 
 
619 aa  317  7e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0861286  normal  0.398812 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  51.46 
 
 
1056 aa  249  1e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  51.44 
 
 
818 aa  248  2e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2382  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  53.02 
 
 
778 aa  247  6e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  52.52 
 
 
988 aa  244  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  51.26 
 
 
784 aa  243  7e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  51.74 
 
 
1056 aa  241  2e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6666  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  50.64 
 
 
839 aa  239  1e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00671712  normal  0.283936 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  51.08 
 
 
1022 aa  236  8e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2468  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  40.36 
 
 
629 aa  187  4e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0996556  normal  0.406351 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4352  hypothetical protein  36.62 
 
 
486 aa  182  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4354  hypothetical protein  42.5 
 
 
477 aa  174  5e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1274  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.58 
 
 
485 aa  162  2e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.843083  normal  0.111493 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7203  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.27 
 
 
859 aa  160  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0476078 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5464  caspase domain-containing protein  30 
 
 
499 aa  159  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.673288  normal  0.689353 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6045  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.39 
 
 
860 aa  156  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5561  caspase-like domain-containing protein  32.91 
 
 
576 aa  155  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481458  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0920  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  39.24 
 
 
680 aa  154  4e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.800014 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1080  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  38.77 
 
 
502 aa  154  4e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3754  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.81 
 
 
478 aa  154  5e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.629066  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1810  hypothetical protein  38.49 
 
 
449 aa  153  8.999999999999999e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1719  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.14 
 
 
515 aa  152  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.648302  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4387  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  38.7 
 
 
485 aa  150  8e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0766304  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2162  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  37.13 
 
 
472 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0611523 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3501  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  36.29 
 
 
445 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  37.12 
 
 
554 aa  149  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2884  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.2 
 
 
1155 aa  148  3e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158927 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1326  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  39.33 
 
 
728 aa  148  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.164047  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0572  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  40.27 
 
 
421 aa  146  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.229301 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3482  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  36.9 
 
 
490 aa  144  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.268767 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3497  caspase-1, p20  34.96 
 
 
971 aa  140  1e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3142  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.55 
 
 
971 aa  139  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.089148 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2549  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.34 
 
 
489 aa  131  4.0000000000000003e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.98894  normal  0.217885 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1556  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.62 
 
 
486 aa  131  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.388564  hitchhiker  0.00312965 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2462  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.32 
 
 
649 aa  129  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.10862  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3731  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.19 
 
 
652 aa  127  9e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.016109  normal  0.736011 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0773  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.9 
 
 
481 aa  122  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0307  hypothetical protein  34.87 
 
 
472 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.453732  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4852  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.87 
 
 
766 aa  120  7.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.771827 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2399  ICE-like protease  33.77 
 
 
276 aa  117  6e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00930458  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0960  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.91 
 
 
862 aa  117  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.355322  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0137  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.6 
 
 
915 aa  111  4.0000000000000004e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.193132  normal  0.854443 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3976  hypothetical protein  32.47 
 
 
500 aa  110  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.435936  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3029  peptidase C14  32.92 
 
 
527 aa  107  6e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.148896  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3182  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.78 
 
 
1026 aa  107  9e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.740099  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0887  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.07 
 
 
504 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.389457  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1009  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.49 
 
 
528 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.781757  normal  0.111483 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4521  caspase-like domain-containing protein  33.78 
 
 
798 aa  105  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2758  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.73 
 
 
501 aa  105  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.224771  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3269  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.22 
 
 
828 aa  105  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.336347  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0897  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.86 
 
 
541 aa  104  5e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.713797  normal 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4069  caspase-1, p20  31.42 
 
 
482 aa  104  6e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1335  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.94 
 
 
522 aa  104  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.479436  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1656  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.94 
 
 
499 aa  103  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.211719  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6467  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.56 
 
 
511 aa  101  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3036  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.67 
 
 
295 aa  100  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2982  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.52 
 
 
502 aa  99.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0310724 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0910  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.2 
 
 
553 aa  99  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.354692  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0290  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.19 
 
 
776 aa  98.2  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.106858  hitchhiker  0.00955586 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5158  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.86 
 
 
474 aa  98.2  5e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.927175  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0554  caspase-like domain- and TPR repeat-containing peptidase  30.47 
 
 
518 aa  97.1  9e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.463703 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3606  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.97 
 
 
292 aa  95.1  4e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.222651  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1734  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.33 
 
 
570 aa  95.1  4e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.055042 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4626  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.08 
 
 
291 aa  92  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1894  protein of unknown function DUF323  30.77 
 
 
523 aa  91.7  5e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2466  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.9 
 
 
497 aa  91.3  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.246743  normal  0.257462 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5502  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.6 
 
 
813 aa  91.3  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0031  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.06 
 
 
442 aa  90.9  7e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0940426  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1332  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.25 
 
 
824 aa  89.7  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0029  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.45 
 
 
397 aa  89.7  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.760745  normal  0.0274344 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0861  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.51 
 
 
288 aa  89  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0548  putative peptidase  29.39 
 
 
287 aa  87  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0752  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.22 
 
 
479 aa  87  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.121113 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_3994  protein of unknown function DUF323  26.43 
 
 
657 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0784  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.19 
 
 
291 aa  82.4  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0467  hypothetical protein  26.1 
 
 
654 aa  82  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  27.03 
 
 
925 aa  81.6  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5032  hypothetical protein  30.3 
 
 
535 aa  81.6  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00427193 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4686  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.63 
 
 
289 aa  78.6  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452049  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5333  protein of unknown function DUF323  31.17 
 
 
570 aa  76.6  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00984541  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3842  hypothetical protein  29.96 
 
 
616 aa  75.9  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.360861 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1617  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.33 
 
 
798 aa  67.8  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154049  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0028  hypothetical protein  27.27 
 
 
331 aa  58.2  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.194493 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2689  hypothetical protein  31.21 
 
 
781 aa  57.8  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.36496  decreased coverage  0.00230732 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2871  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.06 
 
 
1203 aa  54.7  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5450  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.62 
 
 
652 aa  53.9  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.530037  normal  0.170483 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2005  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.23 
 
 
477 aa  52.8  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000318218  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3572  diguanylate cyclase  26.73 
 
 
902 aa  52.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0031  TIR protein  31.19 
 
 
544 aa  51.6  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0055  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.68 
 
 
316 aa  50.8  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000868193  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1450  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.96 
 
 
578 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0185927  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1470  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.52 
 
 
753 aa  48.9  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1545  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.96 
 
 
578 aa  48.9  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.314376  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0288  peptidase M56 BlaR1  33.54 
 
 
651 aa  48.5  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.139173  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3616  hypothetical protein  27.69 
 
 
328 aa  47.8  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.666747  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>