256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0093 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0093  haloacid dehalogenase, type II  100 
 
 		 203 aa  407  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0102  haloacid dehalogenase, type II  100 
 
 		 203 aa  407  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0923081 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0083  haloacid dehalogenase, type II  99.01 
 
 		 234 aa  404  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.767236  normal  0.307849 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0108  haloacid dehalogenase, type II  79.21 
 
 		 239 aa  322  3e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0739  haloacid dehalogenase, type II  78.71 
 
 		 233 aa  321  4e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.42181  normal  0.827752 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3998  putative (S)-2-haloacid dehalogenase  62.38 
 
 		 239 aa  247  8e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.666733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2536  haloacid dehalogenase, type II  62.14 
 
 		 344 aa  239  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.762748  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1601  haloacid dehalogenase, type II  62.14 
 
 		 346 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.321746  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0962  haloacid dehalogenase, type II  62.14 
 
 		 316 aa  238  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1404  haloacid dehalogenase, type II  62.14 
 
 		 346 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0260  haloacid dehalogenase, type II  62.14 
 
 		 336 aa  238  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0223  haloacid dehalogenase, type II  62.14 
 
 		 240 aa  238  5e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.285633  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1029  haloacid dehalogenase, type II  58.13 
 
 		 241 aa  236  1e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1108  haloacid dehalogenase, type II  57.64 
 
 		 241 aa  235  4e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0507  haloacid dehalogenase, type II  61.27 
 
 		 240 aa  234  6e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.817391  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2963  haloacid dehalogenase, type II  55.94 
 
 		 241 aa  232  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1324  haloacid dehalogenase, type II  56.93 
 
 		 240 aa  230  9e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3493  haloacid dehalogenase, type II  58.25 
 
 		 237 aa  228  6e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.017334  normal  0.49554 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2498  haloacid dehalogenase, type II  55.45 
 
 		 242 aa  226  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0700401  normal  0.0985785 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1485  haloacid dehalogenase, type II  56.06 
 
 		 235 aa  226  3e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0508  haloacid dehalogenase, type II  59.51 
 
 		 245 aa  222  3e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0228305  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4220  haloacid dehalogenase, type II  52.68 
 
 		 242 aa  221  4.9999999999999996e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2786  haloacid dehalogenase, type II  53.96 
 
 		 241 aa  219  3e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4539  haloacid dehalogenase, type II  53.69 
 
 		 239 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0366562  normal  0.757002 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2814  haloacid dehalogenase, type II  54.46 
 
 		 242 aa  218  5e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0540446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3206  haloacid dehalogenase, type II  56.31 
 
 		 228 aa  218  5e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4708  putative haloacid dehalogenase  51.5 
 
 		 233 aa  217  7e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.301624  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53790  putative haloacid dehalogenase  51.5 
 
 		 233 aa  217  7e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0417823  normal  0.160959 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5600  haloacid dehalogenase, type II  55.39 
 
 		 240 aa  216  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1310  haloacid dehalogenase, type II  54.81 
 
 		 240 aa  215  2.9999999999999998e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3474  haloacid dehalogenase, type II  55.17 
 
 		 240 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0637675 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2027  haloacid dehalogenase, type II  54.68 
 
 		 240 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.253695  normal  0.218956 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4382  haloacid dehalogenase, type II  60.5 
 
 		 233 aa  209  2e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4315  haloacid dehalogenase, type II  54.68 
 
 		 266 aa  209  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.103346  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4051  haloacid dehalogenase, type II  54.68 
 
 		 266 aa  209  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3446  haloacid dehalogenase, type II  54.19 
 
 		 266 aa  206  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.301788 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1791  HAD family hydrolase  50.97 
 
 		 240 aa  206  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0351964 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3953  haloacid dehalogenase, type II  53.69 
 
 		 252 aa  205  3e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.797127  normal  0.122028 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3706  haloacid dehalogenase, type II  55.77 
 
 		 242 aa  197  7e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3414  haloacid dehalogenase, type II  48.51 
 
 		 233 aa  171  5e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.392985 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3008  haloacid dehalogenase, type II  49.01 
 
 		 248 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.21479 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4408  haloacid dehalogenase, type II  48.02 
 
 		 233 aa  164  9e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0492  haloacid dehalogenase, type II  43.5 
 
 		 232 aa  160  9e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2679  haloacid dehalogenase, type II  62.6 
 
 		 149 aa  159  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154065  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5331  haloacid dehalogenase, type II  46.77 
 
 		 233 aa  156  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.416578  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05830  haloacid dehalogenase, type II (AFU_orthologue; AFUA_2G07750)  36.57 
 
 		 263 aa  133  1.9999999999999998e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.675232 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2716  haloacid dehalogenase type II  36.14 
 
 		 227 aa  107  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0447  haloacid dehalogenase, type II  35.45 
 
 		 230 aa  100  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.399561 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6423  haloacid dehalogenase, type II  29.8 
 
 		 234 aa  85.9  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.599394 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6135  haloacid dehalogenase, type II  29.29 
 
 		 234 aa  85.9  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2680  haloacid dehalogenase, type II  64.18 
 
 		 99 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.202486  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4292  HAD family hydrolase  25.96 
 
 		 230 aa  78.2  0.00000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4737  haloacid dehalogenase, type II  27.86 
 
 		 279 aa  76.3  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0275  haloacid dehalogenase, type II  36.75 
 
 		 227 aa  68.6  0.00000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5721  haloacid dehalogenase, type II  35.29 
 
 		 234 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014238 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2713  haloacid dehalogenase, type II  30.2 
 
 		 226 aa  65.1  0.0000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1654  2-haloacid dehalogenase  26.47 
 
 		 251 aa  63.5  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02539  haloalkanoic acid dehalogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14460)  27.32 
 
 		 297 aa  62.8  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09518  haloalkanoic acid dehalogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14460)  27.32 
 
 		 243 aa  62.4  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6593  haloacid dehalogenase, type II  25.62 
 
 		 222 aa  62  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.838711 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0978  haloacid dehalogenase, type II  26.34 
 
 		 247 aa  61.2  0.000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4920  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  30.81 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175084  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1493  HAD family hydrolase  25.37 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259091 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10473  Cryptic haloacid dehalogenase 1  33.65 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.236103  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6092  haloacid dehalogenase, type II  24.88 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.350061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2236  haloacid dehalogenase, type II  27.27 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.765842  normal  0.282262 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1202  haloacid dehalogenase, type II  36.51 
 
 		 223 aa  58.2  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.673793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0736  haloacid dehalogenase, type II  19.9 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.439384  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5903  haloacid dehalogenase, type II  24.61 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1952  HAD family hydrolase  30.35 
 
 		 233 aa  57  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.478316  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1648  HAD family hydrolase  29.17 
 
 		 270 aa  57  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.322198  normal  0.025801 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4499  haloacid dehalogenase, type II  28.57 
 
 		 225 aa  57  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.191667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3953  HAD family hydrolase  34.96 
 
 		 240 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.261724 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2489  haloacid dehalogenase, type II  28.31 
 
 		 271 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.154459  hitchhiker  0.000896523 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1951  haloacid dehalogenase, type II  27.23 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6192  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  29.49 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.544063  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0969  HAD family hydrolase  29.68 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3496  haloacid dehalogenase, type II  27.75 
 
 		 224 aa  55.1  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.84855  normal  0.416002 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0860  haloacid dehalogenase, type II  28.44 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.427031  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2128  haloacid dehalogenase, type II  25 
 
 		 198 aa  55.1  0.0000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00190875  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2616  haloacid dehalogenase, type II  28.44 
 
 		 260 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0354122  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1088  haloacid dehalogenase, type II  26.92 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2025  HAD family hydrolase  28.85 
 
 		 223 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0440204 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1396  haloacid dehalogenase, type II  29.75 
 
 		 231 aa  53.9  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.430532  normal  0.787834 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5662  HAD family hydrolase  22.82 
 
 		 247 aa  54.3  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.604957  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1226  haloacid dehalogenase, type II  27.36 
 
 		 253 aa  54.3  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613669  normal  0.177429 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3811  haloacid dehalogenase, type II  35.71 
 
 		 226 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.277165  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0901  haloacid dehalogenase, type II  24.49 
 
 		 231 aa  54.3  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6055  haloacid dehalogenase, type II  31.71 
 
 		 222 aa  54.3  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6447  haloacid dehalogenase, type II  31.71 
 
 		 222 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.868203  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6279  haloacid dehalogenase, type II  28.02 
 
 		 222 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138045  normal  0.720875 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5153  haloacid dehalogenase, type II  27.67 
 
 		 228 aa  54.7  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6351  haloacid dehalogenase, type II  31.71 
 
 		 222 aa  54.3  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6682  haloacid dehalogenase, type II  31.71 
 
 		 222 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2198  haloacid dehalogenase, type II  25.76 
 
 		 230 aa  53.9  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3567  HAD family hydrolase  34.15 
 
 		 240 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.210535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2070  haloacid dehalogenase, type II  27.31 
 
 		 255 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.421316  normal  0.779082 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1389  haloacid dehalogenase, type II  28.86 
 
 		 237 aa  53.1  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0325211  normal  0.752698 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3684  haloacid dehalogenase, type II  32.76 
 
 		 249 aa  52.8  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3956  haloacid dehalogenase, type II  36.36 
 
 		 260 aa  53.1  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>