More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_3170 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_1500  type II secretion system protein E  63.57 
 
 
682 aa  764    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0597313  normal  0.0634104 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3170  type II secretion system protein E  100 
 
 
609 aa  1257    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1906  type II secretion system protein E  69.33 
 
 
749 aa  800    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124978  normal  0.483962 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2003  type II secretion system protein E  73.18 
 
 
791 aa  807    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0254  type II secretion system protein E  51.16 
 
 
654 aa  588  1e-167  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0448  type II secretion system protein E  52.66 
 
 
797 aa  556  1e-157  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0009  type II secretion system protein E  48.98 
 
 
547 aa  506  9.999999999999999e-143  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2721  type II secretion system protein E  48.03 
 
 
542 aa  487  1e-136  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.261716 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2687  type II secretion system protein E  46.07 
 
 
549 aa  480  1e-134  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2400  type II secretion system protein E  45.79 
 
 
549 aa  477  1e-133  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1064  type II secretion system protein E  47.08 
 
 
591 aa  471  1.0000000000000001e-131  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2814  type II secretion system protein E  45.4 
 
 
556 aa  468  9.999999999999999e-131  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0006  type II secretion system protein E  46.41 
 
 
545 aa  459  9.999999999999999e-129  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1032  type II secretion system protein E  47.58 
 
 
551 aa  459  9.999999999999999e-129  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.621216  normal  0.536815 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1172  type II secretion system protein E  41.74 
 
 
640 aa  457  1e-127  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00958345  normal  0.662669 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2355  type II secretion system protein E  44.94 
 
 
628 aa  454  1.0000000000000001e-126  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.692167  normal  0.583317 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0731  type II secretion system protein  45.15 
 
 
558 aa  449  1e-125  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3137  type II secretion system protein E  42.14 
 
 
1319 aa  429  1e-119  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0446325  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0946  type II secretion system protein E  43.17 
 
 
1335 aa  420  1e-116  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0978  type II secretion system protein E  50.62 
 
 
1255 aa  419  1e-116  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.742375  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2859  type II secretion system protein E  50.89 
 
 
847 aa  422  1e-116  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2148  type II secretion system protein E  49.88 
 
 
831 aa  416  9.999999999999999e-116  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0453138 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2422  type II secretion system protein E  40 
 
 
722 aa  387  1e-106  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1537  aminoacyl-tRNA hydrolase  39.21 
 
 
583 aa  382  1e-104  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20083  hitchhiker  0.0017261 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1459  hypothetical protein  41.27 
 
 
770 aa  374  1e-102  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.362322 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2386  type II secretion system protein E  41.65 
 
 
692 aa  368  1e-100  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.934402  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0808  type II secretion system protein E  40.73 
 
 
510 aa  365  1e-100  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1204  type II secretion system protein E  38.98 
 
 
519 aa  337  2.9999999999999997e-91  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.431618  hitchhiker  0.000463314 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0314  type II secretion system protein E  40.87 
 
 
991 aa  332  1e-89  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.281088  normal  0.2578 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3536  type II secretion system protein E  59.92 
 
 
612 aa  331  2e-89  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0439  type II secretion system protein E  42.11 
 
 
671 aa  314  3.9999999999999997e-84  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1318  type II secretion system protein E  36.97 
 
 
547 aa  307  4.0000000000000004e-82  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.101894  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1965  flagella related protein FlaI  38.73 
 
 
604 aa  301  3e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0949  type II secretion system protein E  41 
 
 
617 aa  300  7e-80  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0134957  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1862  type II secretion system protein E  37.7 
 
 
618 aa  296  7e-79  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1574  type II secretion system protein E  34.14 
 
 
549 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0128  type II secretion system protein E  38.62 
 
 
513 aa  284  3.0000000000000004e-75  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.510633  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0104  type II secretion system protein E  38.93 
 
 
620 aa  282  1e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1342  type II secretion system protein E  40.4 
 
 
622 aa  282  1e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.136296  normal  0.284799 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1325  type II secretion system protein E  38.48 
 
 
512 aa  281  3e-74  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00455821  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1403  type II secretion system protein E  36.58 
 
 
492 aa  278  3e-73  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1870  type II secretion system protein E  36.36 
 
 
492 aa  276  5e-73  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0816791  normal  0.90316 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0352  type II secretion system protein E  39.01 
 
 
610 aa  273  7e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.540636  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2568  type II secretion system protein E  33.6 
 
 
557 aa  273  8.000000000000001e-72  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0267  type II secretion system protein E  37.85 
 
 
543 aa  269  1e-70  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2874  type II secretion system protein E  32.12 
 
 
557 aa  266  7e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0948  type II secretion system protein E  38.24 
 
 
546 aa  265  2e-69  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0997  type II secretion system protein E  38.24 
 
 
546 aa  265  2e-69  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1732  type II secretion system protein E  37.47 
 
 
546 aa  263  6.999999999999999e-69  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0960  type II secretion system protein E  31.72 
 
 
557 aa  262  1e-68  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0975  type II secretion system protein E  37.73 
 
 
546 aa  261  2e-68  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.844334  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0424  type II secretion system protein E  32.4 
 
 
489 aa  261  3e-68  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.983223 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3412  type II secretion system protein E  32.65 
 
 
559 aa  259  7e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1344  type II secretion system protein E  33.19 
 
 
491 aa  259  8e-68  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.286284 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0230  type II secretion system protein E  31.93 
 
 
557 aa  249  1e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1154  type II secretion system protein E  37.15 
 
 
544 aa  234  4.0000000000000004e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0909  type II secretion system protein E  38.05 
 
 
548 aa  233  7.000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0650  type II secretion system protein E  33.41 
 
 
572 aa  231  4e-59  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.200962 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1037  type II secretion system protein E  37.28 
 
 
552 aa  230  5e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0840117 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1640  type II secretion system protein E  36.5 
 
 
552 aa  226  1e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.160134  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0196  type II secretion system protein E  32.75 
 
 
577 aa  224  3e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191118  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1037  type II secretion system protein E  35.99 
 
 
553 aa  216  9.999999999999999e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1055  type II secretion system protein E  35.99 
 
 
553 aa  216  9.999999999999999e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1049  type II secretion system protein E  35.99 
 
 
553 aa  216  9.999999999999999e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.487211  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1043  type II secretion system protein E  35.99 
 
 
553 aa  216  9.999999999999999e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1095  type II secretion system protein E  34.76 
 
 
473 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.132714  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0853  type II secretion system protein E  35.58 
 
 
311 aa  190  5.999999999999999e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.647249  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2104  type II secretion system protein E  32.39 
 
 
476 aa  187  4e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.609091  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0495  type II secretion system protein E  30.87 
 
 
515 aa  187  5e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2018  type II secretion system protein E  34.15 
 
 
445 aa  185  2.0000000000000003e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1756  type II secretion system protein E  35.1 
 
 
430 aa  181  4e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.154  normal  0.161423 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3490  type II secretion system protein E  31.84 
 
 
478 aa  178  2e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.057514 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  30.33 
 
 
472 aa  177  6e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0422  type II secretion system protein E  29.97 
 
 
508 aa  175  1.9999999999999998e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4613  type II secretion system protein E  31.11 
 
 
467 aa  172  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  28.04 
 
 
463 aa  172  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2290  type II secretion system protein E  30.15 
 
 
498 aa  171  2e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4479  type II secretion system protein E  30.16 
 
 
491 aa  171  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  30.36 
 
 
460 aa  171  4e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1640  type II secretion system protein E  31.77 
 
 
417 aa  170  6e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.75229  normal  0.33759 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  31.82 
 
 
479 aa  170  7e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1515  secretory protein kinase, cpaF  32.17 
 
 
432 aa  170  7e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0638595  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3793  type II secretion system protein E  29.52 
 
 
485 aa  170  9e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3966  type II secretion system protein E  29.55 
 
 
449 aa  169  1e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.406102 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  32.21 
 
 
453 aa  169  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  30.28 
 
 
454 aa  168  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1856  type II secretion system protein E  28.8 
 
 
521 aa  169  2e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808966  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4190  type II secretion system protein E  29.64 
 
 
504 aa  168  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1682  type II secretion system protein E  32.42 
 
 
465 aa  168  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000847512 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  31.35 
 
 
463 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2694  type II secretion system protein E  30.92 
 
 
474 aa  168  2.9999999999999998e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1274  type II secretion system protein E  32.11 
 
 
463 aa  167  4e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  31.28 
 
 
444 aa  167  4e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0247  type II secretion system protein E  31.43 
 
 
639 aa  167  4e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.68853  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  30.23 
 
 
464 aa  167  5e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4191  type II secretion system protein E  28.64 
 
 
491 aa  167  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1522  type II secretion system protein E  30.3 
 
 
467 aa  167  6.9999999999999995e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3355  type II secretion system protein E  29.25 
 
 
488 aa  167  6.9999999999999995e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1918  type II secretion system protein E  31.69 
 
 
442 aa  166  8e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.250738  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4447  type II secretion system protein E  33.74 
 
 
438 aa  166  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>