180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3532 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA1148  outer membrane autotransporter  48.6 
 
 		 3420 aa  781    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0586  outer membrane autotransporter  50 
 
 		 2926 aa  865    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3532  outer membrane autotransporter  100 
 
 		 1571 aa  3066    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1053  outer membrane autotransporter  48.39 
 
 		 3415 aa  778    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2013  outer membrane autotransporter  37.01 
 
 		 1593 aa  606  9.999999999999999e-173  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2817  outer membrane autotransporter  45.85 
 
 		 950 aa  525  1e-147  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4504  outer membrane autotransporter  50.49 
 
 		 1012 aa  485  1e-135  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.590771  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3370  outer membrane autotransporter  44.01 
 
 		 1068 aa  479  1e-133  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2767  outer membrane autotransporter  43.95 
 
 		 1108 aa  474  1e-132  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0173  outer membrane autotransporter  41.64 
 
 		 1113 aa  446  1e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0108054  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4858  outer membrane autotransporter  42.31 
 
 		 2906 aa  431  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2810  outer membrane autotransporter  44.64 
 
 		 2578 aa  428  1e-118  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4855  outer membrane autotransporter  44.81 
 
 		 1861 aa  427  1e-118  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3513  outer membrane autotransporter  37.88 
 
 		 1268 aa  349  3e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.273383  normal  0.696988 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0695  putative autotransporter protein  38.31 
 
 		 1259 aa  346  2e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.931243  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0763  outer membrane autotransporter  43.37 
 
 		 1254 aa  345  4e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0694  putative autotransporter protein  38.15 
 
 		 1259 aa  345  4e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3775  putative autotransporter protein  38.15 
 
 		 1285 aa  344  8e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3865  outer membrane autotransporter  38.3 
 
 		 1269 aa  343  2e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0152  outermembrane transporter  42.95 
 
 		 861 aa  262  4e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000458443  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3756  Outer membrane autotransporter barrel  35.49 
 
 		 3506 aa  211  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1554  autotransporter-associated beta strand repeat protein  38.92 
 
 		 2363 aa  210  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.623464 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  32.72 
 
 		 1741 aa  181  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  33.99 
 
 		 1357 aa  162  6e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241851  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4307  outer membrane autotransporter  29.5 
 
 		 1099 aa  160  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157591  hitchhiker  0.00000542564 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2939  outer membrane autotransporter barrel  29.83 
 
 		 1115 aa  150  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.988742  normal  0.687954 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0779  hypothetical protein  32.72 
 
 		 1881 aa  147  1e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0318  outer membrane autotransporter  30.31 
 
 		 989 aa  145  4e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000433697 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3853  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.87 
 
 		 1055 aa  145  7e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.229574  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0673  putative autotransporter protein  28.99 
 
 		 4391 aa  145  9e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3759  outer membrane autotransporter barrel  30.48 
 
 		 1753 aa  142  6e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0743  outer membrane autotransporter  28.8 
 
 		 4312 aa  141  7.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4985  Outer membrane autotransporter barrel  28.52 
 
 		 1093 aa  140  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.68858  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3175  outer membrane autotransporter  28.52 
 
 		 1093 aa  140  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0115385 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2510  outer membrane autotransporter  28.01 
 
 		 2637 aa  139  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.995236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0640  outer membrane autotransporter  30.59 
 
 		 1763 aa  137  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2710  outer membrane autotransporter  32.75 
 
 		 1748 aa  132  4.0000000000000003e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0190  Outer membrane autotransporter barrel  30.23 
 
 		 1762 aa  132  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.487352  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0673  outer membrane autotransporter  30.23 
 
 		 1762 aa  132  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1979  Outer membrane autotransporter barrel  31.38 
 
 		 947 aa  131  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0897948  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03531  hypothetical protein  27.02 
 
 		 1165 aa  127  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.1665  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03479  hypothetical protein  27.02 
 
 		 1165 aa  127  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.112471  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1059  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.51 
 
 		 1023 aa  125  7e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1031  outer membrane autotransporter  38.74 
 
 		 1172 aa  125  7e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0914454  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1341  Outer membrane autotransporter barrel  32.72 
 
 		 1040 aa  125  8e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.108803  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1711  outer membrane autotransporter domain-containing protein  27.87 
 
 		 1327 aa  122  6e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0568  outer membrane autotransporter  29.46 
 
 		 1770 aa  122  7e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2876  outer membrane autotransporter  33.33 
 
 		 1550 aa  120  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2148  putative lipoprotein/autotransporter domain-containing protein  26.19 
 
 		 1806 aa  118  7.999999999999999e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.589392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4206  outer membrane autotransporter  29.12 
 
 		 1594 aa  117  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0734  outer membrane autotransporter barrel domain protein  52.21 
 
 		 1086 aa  117  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.837049 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0594  outer membrane autotransporter  29.26 
 
 		 1770 aa  117  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367872  normal  0.807711 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4066  outer membrane autotransporter barrel domain protein  39.49 
 
 		 1081 aa  114  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.392825  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1980  autotransporter (AT) family porin  28.86 
 
 		 773 aa  113  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0125961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1566  Outer membrane autotransporter barrel  35.64 
 
 		 1119 aa  112  8.000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0217  outer membrane protein IcsA  25.7 
 
 		 1102 aa  109  5e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2454  ShdA  40.19 
 
 		 3322 aa  108  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0377  putative outer membrane autotransporter  26.59 
 
 		 1349 aa  107  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.120406 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5838  outer membrane autotransporter barrel domain protein  38.04 
 
 		 1227 aa  105  7e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0332  putative outer membrane autotransporter  26.43 
 
 		 1327 aa  105  9e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2736  beta strand repeat-containing protein  37.05 
 
 		 1882 aa  105  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.883139  normal  0.0228341 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0374  putative outer membrane autotransporter  26.43 
 
 		 1327 aa  104  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.514292  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3228  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.92 
 
 		 868 aa  103  3e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00110064  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01481  hypothetical protein  28.51 
 
 		 466 aa  102  7e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3069  outer membrane autotransporter  27.07 
 
 		 825 aa  102  8e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.27692  normal  0.553853 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2348  outer membrane autotransporter  33.88 
 
 		 1971 aa  101  9e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.714224  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1662  pertactin family protein  28.37 
 
 		 1626 aa  101  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.459563 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4035  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase Dut  41.55 
 
 		 994 aa  101  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.565458 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0758  outer membrane autotransporter barrel  32.13 
 
 		 2396 aa  100  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291921 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2655  outer membrane autotransporter  27.07 
 
 		 819 aa  100  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4055  putative autotransporter protein  29.57 
 
 		 1067 aa  100  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1881  outer membrane autotransporter barrel domain protein  44.62 
 
 		 1532 aa  100  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4722  outer membrane autotransporter  38.94 
 
 		 2003 aa  99  7e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3770  Outer membrane autotransporter barrel  28.51 
 
 		 1234 aa  98.6  8e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0107  outer membrane autotransporter  29.07 
 
 		 1070 aa  98.2  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4077  putative autotransporter protein  29.03 
 
 		 1070 aa  97.1  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00997828 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5354  outer membrane autotransporter  30.74 
 
 		 2365 aa  96.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0199943  normal  0.02642 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4933  outer membrane autotransporter  30.74 
 
 		 2346 aa  96.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348524  unclonable  0.000124828 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4201  outer membrane autotransporter  25.82 
 
 		 1579 aa  96.3  4e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.597985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0854  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.98 
 
 		 3629 aa  96.3  4e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5200  autotransporter, putative  42.77 
 
 		 986 aa  95.5  7e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0336  Outer membrane autotransporter barrel  43.37 
 
 		 995 aa  94.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4300  Outer membrane autotransporter barrel  45.75 
 
 		 987 aa  94  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.359518 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1722  beta strand repeat-containing protein  46.23 
 
 		 1530 aa  93.2  4e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.885692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2662  ShdA  26.84 
 
 		 2057 aa  92.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.285141  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2797  outer membrane autotransporter  25.8 
 
 		 818 aa  90.1  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0467702  normal  0.0793019 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0480  outer membrane autotransporter barrel domain protein  32.65 
 
 		 1029 aa  90.1  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.876293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3962  outer membrane autotransporter barrel domain  45.08 
 
 		 955 aa  89.4  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2288  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28 
 
 		 806 aa  89.4  5e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.540701 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3981  outer membrane autotransporter barrel domain  45.08 
 
 		 955 aa  89.4  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3087  Outer membrane autotransporter barrel  41.33 
 
 		 2407 aa  87.8  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6171  outer membrane autotransporter  44.12 
 
 		 1458 aa  87.4  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1672  beta strand repeat-containing protein  46.38 
 
 		 3391 aa  87.8  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848841 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2492  Outer membrane autotransporter barrel  37.5 
 
 		 914 aa  85.9  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0372  Outer membrane autotransporter barrel  28.09 
 
 		 1277 aa  86.3  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.617347  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6464  outer membrane autotransporter  52.25 
 
 		 1459 aa  85.9  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0499  putative autotransporter protein  30.34 
 
 		 1004 aa  85.5  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0561  outer membrane autotransporter  30.34 
 
 		 997 aa  85.5  0.000000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5268  putative outer membrane autotransporter barrel  36.22 
 
 		 1078 aa  85.1  0.000000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.362559 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3806  Outer membrane autotransporter barrel  26.7 
 
 		 924 aa  83.2  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.27944  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>