More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0254 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_0254  type II secretion system protein E  100 
 
 
654 aa  1340    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1906  type II secretion system protein E  52.56 
 
 
749 aa  607  9.999999999999999e-173  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124978  normal  0.483962 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2003  type II secretion system protein E  54.1 
 
 
791 aa  601  1e-170  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1500  type II secretion system protein E  52.95 
 
 
682 aa  596  1e-169  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0597313  normal  0.0634104 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3170  type II secretion system protein E  51.16 
 
 
609 aa  588  1e-167  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0448  type II secretion system protein E  50.87 
 
 
797 aa  531  1e-149  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0009  type II secretion system protein E  48.16 
 
 
547 aa  518  1.0000000000000001e-145  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2687  type II secretion system protein E  46.39 
 
 
549 aa  488  1e-136  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0006  type II secretion system protein E  44.53 
 
 
545 aa  475  1e-132  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2400  type II secretion system protein E  48.32 
 
 
549 aa  475  1e-132  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2721  type II secretion system protein E  46.04 
 
 
542 aa  473  1e-132  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.261716 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1172  type II secretion system protein E  46.76 
 
 
640 aa  468  9.999999999999999e-131  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00958345  normal  0.662669 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2814  type II secretion system protein E  48.41 
 
 
556 aa  457  1e-127  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0731  type II secretion system protein  43.13 
 
 
558 aa  452  1e-125  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1032  type II secretion system protein E  43.83 
 
 
551 aa  449  1e-125  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.621216  normal  0.536815 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2355  type II secretion system protein E  45.12 
 
 
628 aa  447  1.0000000000000001e-124  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.692167  normal  0.583317 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1064  type II secretion system protein E  45.14 
 
 
591 aa  439  9.999999999999999e-123  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2422  type II secretion system protein E  40.16 
 
 
722 aa  395  1e-108  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1459  hypothetical protein  41.06 
 
 
770 aa  387  1e-106  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.362322 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0978  type II secretion system protein E  48.09 
 
 
1255 aa  384  1e-105  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.742375  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2859  type II secretion system protein E  46.77 
 
 
847 aa  382  1e-105  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3137  type II secretion system protein E  47.07 
 
 
1319 aa  379  1e-103  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0446325  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0946  type II secretion system protein E  46.82 
 
 
1335 aa  376  1e-103  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2148  type II secretion system protein E  46.21 
 
 
831 aa  372  1e-102  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0453138 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1537  aminoacyl-tRNA hydrolase  42.14 
 
 
583 aa  367  1e-100  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20083  hitchhiker  0.0017261 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2386  type II secretion system protein E  41.81 
 
 
692 aa  361  3e-98  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.934402  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0808  type II secretion system protein E  38.54 
 
 
510 aa  357  5e-97  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1204  type II secretion system protein E  36.84 
 
 
519 aa  347  3e-94  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.431618  hitchhiker  0.000463314 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0439  type II secretion system protein E  38.02 
 
 
671 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0314  type II secretion system protein E  38.48 
 
 
991 aa  335  1e-90  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.281088  normal  0.2578 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3536  type II secretion system protein E  51.49 
 
 
612 aa  300  8e-80  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1965  flagella related protein FlaI  40.66 
 
 
604 aa  294  4e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1318  type II secretion system protein E  35.53 
 
 
547 aa  288  2.9999999999999996e-76  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.101894  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1862  type II secretion system protein E  38.21 
 
 
618 aa  285  3.0000000000000004e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0949  type II secretion system protein E  38.42 
 
 
617 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0134957  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0104  type II secretion system protein E  39.16 
 
 
620 aa  276  9e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1344  type II secretion system protein E  35.95 
 
 
491 aa  272  1e-71  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.286284 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1870  type II secretion system protein E  34.78 
 
 
492 aa  272  1e-71  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0816791  normal  0.90316 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1403  type II secretion system protein E  35 
 
 
492 aa  272  1e-71  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0975  type II secretion system protein E  35.04 
 
 
546 aa  271  2e-71  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.844334  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0352  type II secretion system protein E  38.96 
 
 
610 aa  271  2e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.540636  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1325  type II secretion system protein E  36.67 
 
 
512 aa  269  1e-70  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00455821  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0128  type II secretion system protein E  38.4 
 
 
513 aa  268  2e-70  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.510633  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1342  type II secretion system protein E  37.93 
 
 
622 aa  268  2e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.136296  normal  0.284799 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0424  type II secretion system protein E  33.48 
 
 
489 aa  265  2e-69  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.983223 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1732  type II secretion system protein E  32.57 
 
 
546 aa  263  6.999999999999999e-69  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0948  type II secretion system protein E  32.99 
 
 
546 aa  262  1e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0267  type II secretion system protein E  32.57 
 
 
543 aa  261  3e-68  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2568  type II secretion system protein E  33.69 
 
 
557 aa  259  1e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1574  type II secretion system protein E  32.3 
 
 
549 aa  259  1e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2874  type II secretion system protein E  32.12 
 
 
557 aa  258  2e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0997  type II secretion system protein E  32.57 
 
 
546 aa  258  2e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0196  type II secretion system protein E  38.98 
 
 
577 aa  258  3e-67  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191118  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0960  type II secretion system protein E  32.38 
 
 
557 aa  258  3e-67  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0230  type II secretion system protein E  31.33 
 
 
557 aa  249  1e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0650  type II secretion system protein E  31.46 
 
 
572 aa  246  9e-64  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.200962 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3412  type II secretion system protein E  32.81 
 
 
559 aa  237  4e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1037  type II secretion system protein E  33.77 
 
 
552 aa  216  9e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0840117 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0909  type II secretion system protein E  32.83 
 
 
548 aa  213  7.999999999999999e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1640  type II secretion system protein E  32.17 
 
 
552 aa  205  2e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.160134  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1154  type II secretion system protein E  30.21 
 
 
544 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1049  type II secretion system protein E  31.67 
 
 
553 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.487211  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1055  type II secretion system protein E  31.67 
 
 
553 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1037  type II secretion system protein E  31.67 
 
 
553 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1043  type II secretion system protein E  31.67 
 
 
553 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1095  type II secretion system protein E  32.75 
 
 
473 aa  197  7e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.132714  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0853  type II secretion system protein E  33.12 
 
 
311 aa  191  4e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.647249  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2290  type II secretion system protein E  33.15 
 
 
498 aa  190  7e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2104  type II secretion system protein E  30.73 
 
 
476 aa  187  6e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.609091  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1856  type II secretion system protein E  32.95 
 
 
521 aa  183  9.000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808966  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0495  type II secretion system protein E  32.58 
 
 
515 aa  179  1e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4346  FHA domain-containing protein  30.71 
 
 
563 aa  178  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.077355  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4613  type II secretion system protein E  29.21 
 
 
467 aa  176  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06193  flp pilus assembly ATPase CpaF  32.51 
 
 
423 aa  174  5e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3656  type II/IV secretion system protein, ATPase domain-containing protein  31.78 
 
 
438 aa  174  5e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0644  FHA domain-containing protein  30.15 
 
 
569 aa  173  1e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.61095 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6876  FHA domain containing protein  31.75 
 
 
634 aa  172  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4951  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1682  type II secretion system protein E  31.7 
 
 
465 aa  172  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000847512 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4396  type II secretion system protein E  33.68 
 
 
481 aa  172  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1274  type II secretion system protein E  31.5 
 
 
463 aa  171  4e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3490  type II secretion system protein E  32.58 
 
 
478 aa  171  5e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.057514 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  29.63 
 
 
463 aa  170  6e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4447  type II secretion system protein E  30.43 
 
 
438 aa  170  7e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  28.98 
 
 
463 aa  170  8e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4360  type II secretion system protein E  31.02 
 
 
451 aa  170  9e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4250  type II secretion system protein E  31.02 
 
 
451 aa  170  9e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.482793 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0608  type II secretion system protein E  31.56 
 
 
423 aa  169  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3931  type II secretion system protein E  32.75 
 
 
472 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0856952  normal  0.304546 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3424  type II secretion system protein E  32.75 
 
 
472 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  normal  0.677685 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5411  type II secretion system protein E  31.27 
 
 
440 aa  167  4e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593921  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0236  type II secretion system protein E  29.78 
 
 
482 aa  167  5e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.505122  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4190  type II secretion system protein E  29.46 
 
 
504 aa  167  5e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0682  type II secretion system protein E  34.06 
 
 
428 aa  167  5.9999999999999996e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.667296  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1085  secretion ATPase protein  30.75 
 
 
450 aa  167  6.9999999999999995e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0748  FHA domain-containing protein  29.4 
 
 
572 aa  167  6.9999999999999995e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0599  type II/IV secretion system protein  34.06 
 
 
428 aa  167  6.9999999999999995e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0260  type II/IV secretion system protein  34.06 
 
 
428 aa  167  6.9999999999999995e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000662566  hitchhiker  0.0000000763288 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  33.96 
 
 
444 aa  166  8e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  31.65 
 
 
445 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1405  type II secretion system protein E  29.59 
 
 
454 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>