More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1500 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1906  type II secretion system protein E  74.21 
 
 		 749 aa  1068    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124978  normal  0.483962 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3170  type II secretion system protein E  64.29 
 
 		 609 aa  772    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1500  type II secretion system protein E  100 
 
 		 682 aa  1409    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0597313  normal  0.0634104 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2003  type II secretion system protein E  63.62 
 
 		 791 aa  827    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0254  type II secretion system protein E  52.95 
 
 		 654 aa  596  1e-169  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0448  type II secretion system protein E  49.36 
 
 		 797 aa  547  1e-154  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0009  type II secretion system protein E  48.19 
 
 		 547 aa  507  9.999999999999999e-143  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2687  type II secretion system protein E  46.01 
 
 		 549 aa  491  1e-137  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0006  type II secretion system protein E  47.39 
 
 		 545 aa  473  1e-132  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2721  type II secretion system protein E  43.52 
 
 		 542 aa  472  1e-132  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.261716 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2400  type II secretion system protein E  46.71 
 
 		 549 aa  474  1e-132  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1064  type II secretion system protein E  44.66 
 
 		 591 aa  469  1.0000000000000001e-131  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2355  type II secretion system protein E  47.06 
 
 		 628 aa  460  9.999999999999999e-129  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.692167  normal  0.583317 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1172  type II secretion system protein E  45.74 
 
 		 640 aa  459  9.999999999999999e-129  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00958345  normal  0.662669 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2814  type II secretion system protein E  44.58 
 
 		 556 aa  460  9.999999999999999e-129  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0731  type II secretion system protein  44.51 
 
 		 558 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1032  type II secretion system protein E  43 
 
 		 551 aa  434  1e-120  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.621216  normal  0.536815 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0946  type II secretion system protein E  42.96 
 
 		 1335 aa  432  1e-119  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0978  type II secretion system protein E  48.93 
 
 		 1255 aa  430  1e-119  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.742375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3137  type II secretion system protein E  50.5 
 
 		 1319 aa  430  1e-119  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0446325  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2148  type II secretion system protein E  39.08 
 
 		 831 aa  428  1e-118  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0453138 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2859  type II secretion system protein E  50 
 
 		 847 aa  422  1e-117  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2422  type II secretion system protein E  40.54 
 
 		 722 aa  398  1e-109  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1537  aminoacyl-tRNA hydrolase  40.69 
 
 		 583 aa  386  1e-106  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20083  hitchhiker  0.0017261 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2386  type II secretion system protein E  43.81 
 
 		 692 aa  378  1e-103  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.934402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1459  hypothetical protein  40.47 
 
 		 770 aa  375  1e-102  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.362322 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0808  type II secretion system protein E  36.35 
 
 		 510 aa  342  2e-92  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3536  type II secretion system protein E  41.83 
 
 		 612 aa  332  1e-89  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0314  type II secretion system protein E  40.13 
 
 		 991 aa  327  3e-88  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.281088  normal  0.2578 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1204  type II secretion system protein E  36.4 
 
 		 519 aa  318  1e-85  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.431618  hitchhiker  0.000463314 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0439  type II secretion system protein E  36.64 
 
 		 671 aa  312  1e-83  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1965  flagella related protein FlaI  38.69 
 
 		 604 aa  305  3.0000000000000004e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0128  type II secretion system protein E  39.12 
 
 		 513 aa  293  7e-78  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.510633  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0949  type II secretion system protein E  40.57 
 
 		 617 aa  290  5.0000000000000004e-77  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0134957  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1862  type II secretion system protein E  34.83 
 
 		 618 aa  282  1e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1318  type II secretion system protein E  33.76 
 
 		 547 aa  280  7e-74  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.101894  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1325  type II secretion system protein E  35.16 
 
 		 512 aa  276  6e-73  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00455821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0104  type II secretion system protein E  38.88 
 
 		 620 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0975  type II secretion system protein E  35.74 
 
 		 546 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.844334  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0948  type II secretion system protein E  35.15 
 
 		 546 aa  274  3e-72  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0997  type II secretion system protein E  35.15 
 
 		 546 aa  275  3e-72  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1732  type II secretion system protein E  34.69 
 
 		 546 aa  272  1e-71  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0352  type II secretion system protein E  35.62 
 
 		 610 aa  272  2e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.540636  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1574  type II secretion system protein E  32.93 
 
 		 549 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1342  type II secretion system protein E  39.16 
 
 		 622 aa  271  2.9999999999999997e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.136296  normal  0.284799 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0267  type II secretion system protein E  34.96 
 
 		 543 aa  270  8.999999999999999e-71  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2568  type II secretion system protein E  33.13 
 
 		 557 aa  265  2e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2874  type II secretion system protein E  33 
 
 		 557 aa  265  2e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1403  type II secretion system protein E  35.65 
 
 		 492 aa  258  3e-67  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1870  type II secretion system protein E  35.06 
 
 		 492 aa  253  8.000000000000001e-66  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0816791  normal  0.90316 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1344  type II secretion system protein E  33.48 
 
 		 491 aa  249  1e-64  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.286284 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0960  type II secretion system protein E  31.21 
 
 		 557 aa  249  1e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3412  type II secretion system protein E  33.26 
 
 		 559 aa  247  6.999999999999999e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0230  type II secretion system protein E  31.21 
 
 		 557 aa  246  9.999999999999999e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0424  type II secretion system protein E  31.29 
 
 		 489 aa  244  3e-63  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.983223 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0650  type II secretion system protein E  33.49 
 
 		 572 aa  228  3e-58  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.200962 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0196  type II secretion system protein E  32.76 
 
 		 577 aa  223  9.999999999999999e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191118  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0909  type II secretion system protein E  35.49 
 
 		 548 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1037  type II secretion system protein E  35.23 
 
 		 552 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0840117 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1640  type II secretion system protein E  35.49 
 
 		 552 aa  213  9e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.160134  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1154  type II secretion system protein E  34.09 
 
 		 544 aa  209  2e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1043  type II secretion system protein E  34.97 
 
 		 553 aa  206  1e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1049  type II secretion system protein E  34.97 
 
 		 553 aa  206  1e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.487211  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1055  type II secretion system protein E  34.97 
 
 		 553 aa  206  1e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1037  type II secretion system protein E  34.97 
 
 		 553 aa  206  1e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2104  type II secretion system protein E  33.17 
 
 		 476 aa  200  7e-50  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.609091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0853  type II secretion system protein E  35.28 
 
 		 311 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.647249  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1095  type II secretion system protein E  33.13 
 
 		 473 aa  184  6e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.132714  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0495  type II secretion system protein E  28.81 
 
 		 515 aa  176  1.9999999999999998e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4613  type II secretion system protein E  30.11 
 
 		 467 aa  172  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2290  type II secretion system protein E  31.01 
 
 		 498 aa  169  1e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1856  type II secretion system protein E  29.64 
 
 		 521 aa  168  2.9999999999999998e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808966  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4479  type II secretion system protein E  29.57 
 
 		 491 aa  167  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3793  type II secretion system protein E  30.1 
 
 		 485 aa  167  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1756  type II secretion system protein E  30.19 
 
 		 430 aa  166  9e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.154  normal  0.161423 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  30.26 
 
 		 445 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4191  type II secretion system protein E  27.58 
 
 		 491 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2018  type II secretion system protein E  31.62 
 
 		 445 aa  166  2.0000000000000002e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4346  FHA domain-containing protein  27.89 
 
 		 563 aa  164  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.077355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1197  type II secretion system protein E  31.4 
 
 		 483 aa  164  4.0000000000000004e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.585907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0236  type II secretion system protein E  27.91 
 
 		 482 aa  164  5.0000000000000005e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.505122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0422  type II secretion system protein E  29.03 
 
 		 508 aa  164  7e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3794  type II secretion system protein E  29.69 
 
 		 480 aa  162  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0875515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0604  type II secretion system protein E  27.33 
 
 		 476 aa  162  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4190  type II secretion system protein E  28.3 
 
 		 504 aa  162  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3716  type II secretion system protein E  29.97 
 
 		 490 aa  162  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.058843  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  30.59 
 
 		 453 aa  162  3e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3523  type II secretion system protein E  29.41 
 
 		 482 aa  161  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.779224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4000  type II secretion system protein E  31.92 
 
 		 500 aa  161  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737782  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0298  type II secretion system protein E  29.97 
 
 		 488 aa  161  4e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3422  type II secretion system protein E  30.69 
 
 		 468 aa  161  4e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.351074  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3355  type II secretion system protein E  27.25 
 
 		 488 aa  160  5e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1781  type II secretion system protein E  29.69 
 
 		 467 aa  160  5e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal  0.227871 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0388  type II secretion system protein E  29.41 
 
 		 489 aa  160  5e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7034  putative secretory protein kinase, cpaF-like gene  29.69 
 
 		 433 aa  160  6e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.473497 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2694  type II secretion system protein E  29 
 
 		 474 aa  160  7e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6876  FHA domain containing protein  27.49 
 
 		 634 aa  160  7e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4951  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1640  type II secretion system protein E  29.64 
 
 		 417 aa  160  9e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.75229  normal  0.33759 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0372  type II/IV secretion system protein, ATP binding domain  30.18 
 
 		 428 aa  160  1e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00402347  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4447  type II secretion system protein E  29.44 
 
 		 438 aa  160  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>