More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3369 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_3369  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 667 aa  1377    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0774784  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3824  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.69 
 
 		 1106 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138221 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3741  TPR repeat-containing protein  40.16 
 
 		 1106 aa  399  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  42.72 
 
 		 585 aa  384  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3331  TPR repeat-containing protein  34.28 
 
 		 633 aa  377  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.332967  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.77 
 
 		 589 aa  372  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3742  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.3 
 
 		 589 aa  362  1e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  34.21 
 
 		 968 aa  342  1e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0461  TPR repeat-containing protein  34.55 
 
 		 627 aa  342  1e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.999909  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2855  hypothetical protein  34.25 
 
 		 937 aa  323  5e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1509  TPR domain-containing protein  32.68 
 
 		 699 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000367862  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  31.89 
 
 		 708 aa  320  3.9999999999999996e-86  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3037  TPR repeat-containing protein  33.8 
 
 		 717 aa  316  9.999999999999999e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2809  TPR repeat-containing protein  33.74 
 
 		 717 aa  314  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  33.64 
 
 		 754 aa  312  1e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  32.07 
 
 		 754 aa  310  8e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2093  TPR repeat-containing protein  34.14 
 
 		 1714 aa  306  6e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  31.34 
 
 		 713 aa  297  4e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  32.09 
 
 		 732 aa  291  3e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3269  TPR repeat-containing protein  32.47 
 
 		 693 aa  285  1.0000000000000001e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.306934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0293  TPR repeat-containing protein  31.24 
 
 		 789 aa  285  2.0000000000000002e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3854  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.75 
 
 		 723 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  32.15 
 
 		 828 aa  283  8.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  31.77 
 
 		 828 aa  282  1e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  31.62 
 
 		 828 aa  280  4e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1986  sulfotransferase  31.87 
 
 		 1415 aa  280  5e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.634546  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27710  glycosyl transferase,TPR repeat protein  31.62 
 
 		 1221 aa  280  7e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5619  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  30.5 
 
 		 739 aa  278  3e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.474452 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  32.88 
 
 		 708 aa  278  3e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  33.28 
 
 		 833 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0164  TPR repeat-containing protein  33.11 
 
 		 833 aa  274  4.0000000000000004e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  30.13 
 
 		 715 aa  272  2e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  30.56 
 
 		 789 aa  271  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  31.91 
 
 		 824 aa  270  5e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2822  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.86 
 
 		 529 aa  270  8.999999999999999e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2569  Methyltransferase type 11  31.15 
 
 		 1143 aa  268  2e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2996  TPR repeat-containing protein  31.87 
 
 		 626 aa  267  4e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.637966  normal  0.0209641 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2869  tetratricopeptide TPR_2  32.48 
 
 		 780 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0238  TPR repeat-containing protein  32.48 
 
 		 780 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  27.76 
 
 		 909 aa  263  1e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0100  TPR domain-containing protein  32.19 
 
 		 790 aa  263  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3873  TPR repeat-containing protein  34.66 
 
 		 776 aa  261  4e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.661818  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3099  TPR domain-containing protein  34.66 
 
 		 776 aa  260  7e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3451  TPR domain-containing protein  34.66 
 
 		 776 aa  260  7e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0799942  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0094  TPR domain-containing protein  34.66 
 
 		 821 aa  260  7e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.822931  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3065  TPR repeat-containing protein  30.74 
 
 		 734 aa  260  7e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0065343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1668  TPR domain-containing protein  34.66 
 
 		 776 aa  260  7e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.329119  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3955  TPR repeat-containing protein  34.66 
 
 		 776 aa  260  7e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2876  TPR domain-containing protein  34.66 
 
 		 821 aa  259  8e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0220  TPR repeat-containing protein  30.42 
 
 		 779 aa  258  3e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.991207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5235  hypothetical protein  34.27 
 
 		 797 aa  257  4e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050699  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2520  methyltransferase type 12  31.45 
 
 		 1116 aa  255  2.0000000000000002e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1802  TPR repeat-containing protein  31.91 
 
 		 822 aa  254  5.000000000000001e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.984059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3835  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.52 
 
 		 790 aa  253  8.000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.304839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3210  TPR domain-containing protein  32.85 
 
 		 781 aa  253  1e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  29.85 
 
 		 3560 aa  247  4e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0161  TPR repeat-containing protein  30.69 
 
 		 598 aa  248  4e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  27.41 
 
 		 750 aa  245  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3338  TPR repeat-containing protein  30.99 
 
 		 595 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0148  TPR repeat-containing protein  30.67 
 
 		 619 aa  243  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0785  TPR repeat-containing protein  29.32 
 
 		 796 aa  240  5e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.225465  hitchhiker  0.00421983 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  28.59 
 
 		 1094 aa  240  5.999999999999999e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0863  TPR repeat-containing protein  34.55 
 
 		 647 aa  239  1e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399235 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1582  Methyltransferase type 12  28.85 
 
 		 1144 aa  238  3e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0699  FkbM family methyltransferase  32.13 
 
 		 921 aa  238  3e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25199 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3368  Tetratricopeptide domain protein  32.27 
 
 		 596 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  27.99 
 
 		 718 aa  236  1.0000000000000001e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0103  TPR repeat-containing protein  31.68 
 
 		 733 aa  235  2.0000000000000002e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467133  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  27.93 
 
 		 4489 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5617  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  28.36 
 
 		 739 aa  233  8.000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.277247 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0051  TPR repeat-containing protein  27.56 
 
 		 633 aa  232  2e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00284913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6522  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  31.43 
 
 		 740 aa  228  3e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.722582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3533  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  28.89 
 
 		 742 aa  226  9e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4399  TPR repeat-containing protein  36.56 
 
 		 727 aa  226  9e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.516213 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  28.96 
 
 		 3035 aa  226  1e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2639  tetratricopeptide TPR_2  31.21 
 
 		 552 aa  225  2e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5618  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  28.4 
 
 		 739 aa  222  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.645263 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  26.98 
 
 		 816 aa  223  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1755  TPR repeat-containing protein  29.31 
 
 		 647 aa  209  2e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0455441 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0605  tetratricopeptide domain-containing protein  30.14 
 
 		 553 aa  207  6e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.335277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  24.56 
 
 		 739 aa  205  2e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  29.86 
 
 		 1085 aa  204  4e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1874  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.99 
 
 		 793 aa  204  6e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  29.91 
 
 		 667 aa  203  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2139  TPR repeat-containing protein  30.65 
 
 		 654 aa  195  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0616  TPR repeat-containing protein  31.84 
 
 		 974 aa  189  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2288  TPR repeat-containing protein  33.07 
 
 		 740 aa  188  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1162  hypothetical protein  35.05 
 
 		 633 aa  186  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2579  hypothetical protein  34.77 
 
 		 588 aa  186  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.385383  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  27.6 
 
 		 700 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0489  TPR repeat-containing protein  26.25 
 
 		 618 aa  184  6e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0261011  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1891  hypothetical protein  33.78 
 
 		 492 aa  181  4e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.591473 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1088  hypothetical protein  33.6 
 
 		 566 aa  180  8e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1160  hypothetical protein  33.16 
 
 		 630 aa  179  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.795058  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  25.83 
 
 		 761 aa  179  2e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0327  hypothetical protein  27.89 
 
 		 657 aa  179  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.322162 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  26.34 
 
 		 732 aa  177  6e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1104  TPR repeat-containing protein  30.94 
 
 		 616 aa  177  6e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3428  tetratricopeptide TPR_2  33.6 
 
 		 560 aa  176  9e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0384278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1547  hypothetical protein  33.78 
 
 		 459 aa  176  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.948596 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>