More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5720 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 291 aa  565  1e-160  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  63.19 
 
 		 332 aa  192  7e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0309  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 213 aa  104  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.302465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  39.33 
 
 		 203 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1613  TetR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 189 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.066311 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3710  regulatory protein, TetR  34.21 
 
 		 230 aa  91.3  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4115  transcriptional regulator, TetR family  36.48 
 
 		 194 aa  90.9  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.1417 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4091  TetR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 222 aa  89.4  6e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0267897 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8152  putative transcriptional regulator, TetR family  34.16 
 
 		 174 aa  84.7  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.687421 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1976  putative transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 181 aa  84  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2104  TetR family transcriptional regulator  52.11 
 
 		 191 aa  84  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  52.7 
 
 		 183 aa  84  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  32.91 
 
 		 255 aa  83.2  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1044  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 180 aa  82  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0206033 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0140  TetR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 176 aa  81.6  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26800  transcriptional regulator  34.69 
 
 		 184 aa  80.9  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.463482  normal  0.288316 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10920  transcriptional regulator  35.37 
 
 		 201 aa  81.3  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0917166  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0068  transcriptional regulator, TetR family  37.58 
 
 		 185 aa  79.3  0.00000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.139926 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3004  transcriptional regulator, TetR family  42.42 
 
 		 186 aa  79  0.00000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.519568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0589  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 191 aa  76.3  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5186  transcriptional regulator, TetR family  40.18 
 
 		 185 aa  75.9  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.225373  normal  0.188797 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0170  TetR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 192 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652591  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4094  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 204 aa  74.3  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0325183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  46.75 
 
 		 217 aa  70.9  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1681  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 217 aa  70.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.371055  normal  0.828695 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  40.5 
 
 		 201 aa  71.2  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2153  transcriptional regulator PsrA  41.23 
 
 		 233 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25180  transcriptional regulator PsrA  41.23 
 
 		 233 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0611  TetR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 193 aa  69.3  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0620  TetR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 193 aa  69.3  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0633  TetR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 193 aa  69.3  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0111  transcriptional regulator, TetR family  40.4 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.482364  normal  0.0755622 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0973  TetR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 198 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  37.38 
 
 		 229 aa  68.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0765  TetR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 228 aa  67  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0312  TetR family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 182 aa  66.6  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1745  TetR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1792  TetR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.651799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1726  TetR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.379747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  45.07 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0067  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 212 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000826521  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6913  putative transcriptional regulator, TetR family  34.25 
 
 		 183 aa  65.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19890  transcriptional regulator  37.08 
 
 		 346 aa  65.5  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.403358  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1590  transcriptional regulator, TetR family  49.28 
 
 		 231 aa  63.9  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.299217  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 221 aa  63.9  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2144  TetR family transcriptional regulator  46.75 
 
 		 235 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0903799 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1684  TetR family transcriptional regulator  46.75 
 
 		 235 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.46279  normal  0.0995016 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28300  transcriptional regulator  44.29 
 
 		 280 aa  63.5  0.000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3598  TetR family transcriptional regulator  46.75 
 
 		 235 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.153473  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 231 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 310 aa  62.8  0.000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1660  TetR family transcriptional regulator  46.75 
 
 		 235 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.903697  normal  0.835101 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  47.3 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19820  transcriptional regulator  41.79 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  41.54 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5380  TetR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.768843  normal  0.61228 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1742  transcriptional regulator, TetR family  37.11 
 
 		 235 aa  62.4  0.000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.666045  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1864  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.370614  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5593  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 233 aa  62.4  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.531399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1778  transcriptional regulator, TetR family  49.12 
 
 		 211 aa  61.6  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4218  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 202 aa  61.6  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.135159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0906  transcriptional regulator, TetR family  53.85 
 
 		 232 aa  61.6  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.052988  normal  0.0196 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0421  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 198 aa  62  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 205 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 215 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3368  transcriptional regulator, TetR family  38.04 
 
 		 229 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.823068  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 205 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 208 aa  62  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 206 aa  61.2  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0687  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 261 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.794796  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1034  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 204 aa  61.2  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 241 aa  60.8  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4681  TetR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 283 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  32.85 
 
 		 263 aa  61.2  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  38.82 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2052  TetR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634978  normal  0.379689 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2800  TetR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697977  decreased coverage  0.000162176 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2639  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2530  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.704068 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1017  repressor protein  36.99 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3711  transcriptional regulator, TetR family  51.79 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5941  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0857  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  36.99 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0855  transcriptional regulator, TetR family  53.85 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.835032 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 307 aa  60.5  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3324  TetR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.272078  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2348  transcriptional regulator, TetR family  41.03 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0187157  normal  0.0306872 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1283  transcriptional regulator, TetR family  45.16 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0196213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2000  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 234 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920156  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2657  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2610  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 234 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0852  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  36.99 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1827  regulatory protein, TetR  45.16 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10440  transcriptional regulator  46.27 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0189255  normal  0.0235057 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4531  hypothetical protein  29.14 
 
 		 227 aa  60.5  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0679  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2773  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 295 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00136461  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0609  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  36.99 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780096  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2443  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  36.99 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>