More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3233 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3233  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 907 aa  1857    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000192727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0199  TonB-dependent siderophore receptor  48.8 
 
 		 810 aa  762    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.286371 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2119  TonB-dependent siderophore receptor  51.95 
 
 		 810 aa  838    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2282  TonB-dependent siderophore receptor  42.36 
 
 		 809 aa  614  9.999999999999999e-175  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.664141  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5681  TonB-dependent siderophore receptor  43.49 
 
 		 786 aa  615  9.999999999999999e-175  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0807191 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07040  ferrichrome-iron receptor  41.91 
 
 		 808 aa  608  9.999999999999999e-173  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1729  TonB-dependent siderophore receptor  38.54 
 
 		 852 aa  603  1.0000000000000001e-171  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.411333 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5138  TonB-dependent siderophore receptor  44.49 
 
 		 789 aa  592  1e-167  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0272944 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0816  TonB-dependent receptor  39.43 
 
 		 816 aa  581  1e-164  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2844  TonB-dependent siderophore receptor  41.79 
 
 		 782 aa  578  1.0000000000000001e-163  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.350592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2496  TonB-dependent siderophore receptor  40.78 
 
 		 785 aa  570  1e-161  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0975  TonB-dependent siderophore receptor  39.45 
 
 		 806 aa  566  1e-160  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.608799  normal  0.162482 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4221  TonB-dependent siderophore receptor  38.87 
 
 		 795 aa  531  1e-149  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1761  TonB-dependent siderophore receptor  38.57 
 
 		 769 aa  503  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00472024  normal  0.310787 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2284  TonB-dependent siderophore receptor  36.86 
 
 		 767 aa  474  1e-132  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.175544  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5579  TonB-dependent siderophore receptor  27.28 
 
 		 812 aa  265  4e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.761851 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4298  TonB-dependent siderophore receptor  26.33 
 
 		 824 aa  244  5e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.742577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4039  TonB-dependent siderophore receptor  26.08 
 
 		 814 aa  233  1e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5755  TonB-dependent siderophore receptor  28.36 
 
 		 793 aa  217  9.999999999999999e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3320  TonB-dependent siderophore receptor  25.87 
 
 		 807 aa  215  2.9999999999999995e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0685  TonB-dependent siderophore receptor  26.28 
 
 		 781 aa  210  1e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00630295  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2239  TonB-dependent siderophore receptor  26.39 
 
 		 789 aa  208  4e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.609704 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4805  TonB-dependent siderophore receptor  24.37 
 
 		 791 aa  204  6e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0410465  normal  0.0531231 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3917  TonB-dependent siderophore receptor  26.89 
 
 		 730 aa  196  2e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121009 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  27.18 
 
 		 837 aa  196  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  25.39 
 
 		 850 aa  195  3e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3121  TonB-dependent siderophore receptor  26.64 
 
 		 809 aa  191  4e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  26.69 
 
 		 859 aa  189  3e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3133  TonB-dependent siderophore receptor  26.14 
 
 		 776 aa  188  3e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989614  normal  0.593866 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3640  TonB-dependent siderophore receptor  26.45 
 
 		 767 aa  188  3e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0918046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0150  TonB-dependent siderophore receptor  26.39 
 
 		 843 aa  185  4.0000000000000006e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.13947  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6718  TonB-dependent siderophore receptor  23.26 
 
 		 805 aa  184  8.000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.960052 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2280  TonB-dependent siderophore receptor  28.41 
 
 		 742 aa  183  1e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2785  TonB-dependent siderophore receptor  25.03 
 
 		 786 aa  182  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00424821  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2470  TonB-dependent siderophore receptor  25.77 
 
 		 794 aa  181  4e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.555764  normal  0.521946 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0010  TonB-dependent siderophore receptor  25.45 
 
 		 864 aa  178  3e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144404  decreased coverage  0.00213669 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  26.25 
 
 		 825 aa  174  7.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  26.59 
 
 		 825 aa  174  7.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0148  TonB-dependent siderophore receptor  27.95 
 
 		 862 aa  173  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732956  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0102  TonB-dependent siderophore receptor  24.75 
 
 		 795 aa  172  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  26.28 
 
 		 817 aa  171  7e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  23.84 
 
 		 815 aa  170  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  24.39 
 
 		 860 aa  169  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3561  TonB-dependent siderophore receptor  25.69 
 
 		 713 aa  164  5.0000000000000005e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  24.41 
 
 		 709 aa  162  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  23.94 
 
 		 703 aa  162  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  23.67 
 
 		 696 aa  161  4e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0747  TonB-dependent siderophore receptor  24.96 
 
 		 806 aa  161  6e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  25 
 
 		 708 aa  160  8e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  25.63 
 
 		 734 aa  160  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  23.49 
 
 		 696 aa  160  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  24.97 
 
 		 711 aa  159  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  24.72 
 
 		 708 aa  159  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  24.1 
 
 		 708 aa  159  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4225  TonB-dependent siderophore receptor  25.31 
 
 		 689 aa  158  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3808  TonB-dependent siderophore receptor  24.97 
 
 		 741 aa  157  6e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.071582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0983  TonB-dependent siderophore receptor  24.69 
 
 		 723 aa  155  4e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.698273  normal  0.622732 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11443  ferrichrome-iron receptor  25.15 
 
 		 792 aa  154  7e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.601841  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2399  TonB-dependent siderophore receptor  23.66 
 
 		 726 aa  154  8e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2122  TonB-dependent siderophore receptor  23.62 
 
 		 726 aa  152  3e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.892393  normal  0.0378186 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  24.69 
 
 		 692 aa  147  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2458  TonB-dependent siderophore receptor  24.3 
 
 		 742 aa  147  7.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4886  TonB-dependent siderophore receptor  25.67 
 
 		 730 aa  147  8.000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.928986 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0979  TonB-dependent siderophore receptor  24.03 
 
 		 724 aa  146  1e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.16439 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2386  TonB-dependent siderophore receptor  24.16 
 
 		 742 aa  147  1e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000185534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1141  TonB-dependent siderophore receptor  25.84 
 
 		 736 aa  147  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3043  TonB-dependent siderophore receptor  24.75 
 
 		 819 aa  146  2e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8274  TonB-dependent siderophore receptor  26.29 
 
 		 715 aa  146  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6070  TonB-dependent siderophore receptor  25.33 
 
 		 738 aa  145  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  25.34 
 
 		 707 aa  145  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2551  TonB-dependent siderophore receptor  23.72 
 
 		 738 aa  144  6e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000835907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  23.89 
 
 		 710 aa  144  9e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1122  TonB-dependent siderophore receptor  24.29 
 
 		 701 aa  143  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625422  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1156  TonB-dependent receptor  24.45 
 
 		 715 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  22.71 
 
 		 743 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  25.07 
 
 		 689 aa  141  3.9999999999999997e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1767  TonB-dependent siderophore receptor  23.62 
 
 		 748 aa  141  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000312172  normal  0.573538 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1724  TonB-dependent siderophore receptor  23.62 
 
 		 748 aa  141  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000700289  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1044  TonB-dependent siderophore receptor  23.89 
 
 		 724 aa  141  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00225756 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0192  TonB-dependent siderophore receptor  25.64 
 
 		 710 aa  141  4.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1443  TonB-dependent siderophore receptor  24.2 
 
 		 743 aa  140  8.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281605  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1729  TonB-dependent siderophore receptor  23.88 
 
 		 749 aa  140  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.775588  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3776  TonB-dependent siderophore receptor  26.2 
 
 		 707 aa  139  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.658574  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3406  TonB-dependent siderophore receptor  25.31 
 
 		 722 aa  139  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.155193  decreased coverage  0.0000340201 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6108  TonB-dependent siderophore receptor  25.38 
 
 		 796 aa  138  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3736  TonB-dependent siderophore receptor  24.96 
 
 		 735 aa  138  4e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0687  TonB-dependent siderophore receptor  24.22 
 
 		 797 aa  138  5e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.862135  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06299  hypothetical protein  24.96 
 
 		 715 aa  137  7.000000000000001e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1362  TonB-dependent siderophore receptor  25.26 
 
 		 732 aa  137  7.000000000000001e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.619941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3442  TonB-dependent siderophore receptor  24.91 
 
 		 713 aa  136  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.827795  normal  0.101631 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1202  TonB-dependent siderophore receptor  25.15 
 
 		 714 aa  136  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534631  normal  0.117708 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0398  ferrichrome-iron receptor  22.92 
 
 		 698 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5324  TonB-dependent siderophore receptor  25.46 
 
 		 710 aa  136  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0890511 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1523  TonB-dependent siderophore receptor  23.79 
 
 		 727 aa  135  3.9999999999999996e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.249023  normal  0.758259 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0395  ferrichrome-iron receptor  22.92 
 
 		 696 aa  135  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.458077  hitchhiker  0.000000000000143872 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0416  ferrichrome-iron receptor  22.92 
 
 		 696 aa  135  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345861 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5875  TonB-dependent siderophore receptor  25.07 
 
 		 689 aa  134  6e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.18447 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0458  ferrichrome-iron receptor  22.92 
 
 		 696 aa  134  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000766311 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1436  TonB-dependent siderophore receptor  23.45 
 
 		 750 aa  134  7.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2881  TonB-dependent siderophore receptor  24.15 
 
 		 714 aa  134  9e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>