More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2583 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2583  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 		 502 aa  1034    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000000863952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3360  OmpA/MotB domain protein  41.1 
 
 		 484 aa  348  1e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  30.22 
 
 		 440 aa  162  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1944  OmpA/MotB domain protein  27.73 
 
 		 445 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000859012 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0154  OmpA/MotB domain protein  25.71 
 
 		 445 aa  125  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.436369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6431  OmpA/MotB domain protein  27.5 
 
 		 449 aa  120  7.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  37.36 
 
 		 427 aa  108  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  37.57 
 
 		 447 aa  98.2  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  38.42 
 
 		 319 aa  97.1  7e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  37.06 
 
 		 429 aa  96.7  8e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  35.33 
 
 		 428 aa  96.7  8e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000218101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 417 aa  94  6e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  32.98 
 
 		 478 aa  93.2  9e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  35.58 
 
 		 240 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0586  OmpA domain-containing protein  34.74 
 
 		 381 aa  92  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000977039  normal  0.0156715 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3591  HAD family hydrolase  34.24 
 
 		 380 aa  92.4  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168113  normal  0.23721 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  40 
 
 		 640 aa  92.4  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  34.46 
 
 		 420 aa  91.7  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  33.12 
 
 		 344 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0307  OmpA/MotB  35 
 
 		 533 aa  91.3  4e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  33.12 
 
 		 344 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  31.98 
 
 		 345 aa  91.3  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  32.56 
 
 		 350 aa  90.9  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  33.12 
 
 		 344 aa  90.9  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  32.56 
 
 		 350 aa  90.9  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  33.33 
 
 		 266 aa  90.5  7e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0280  OmpA family outer membrane protein  35 
 
 		 533 aa  90.1  9e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1901  OmpA/MotB domain protein  35.9 
 
 		 335 aa  90.1  9e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000028398  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3656  OmpA/MotB domain-containing protein  34.83 
 
 		 401 aa  89.7  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0655983  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  31.95 
 
 		 344 aa  89  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4812  OmpA/MotB domain protein  36.87 
 
 		 1755 aa  88.2  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0210  OmpA/MotB  34.27 
 
 		 314 aa  87.4  5e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  31.95 
 
 		 344 aa  87  6e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  37.58 
 
 		 294 aa  87.4  6e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  41.59 
 
 		 223 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  31.29 
 
 		 344 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  39.32 
 
 		 224 aa  85.1  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  39.83 
 
 		 525 aa  84.7  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  41.46 
 
 		 230 aa  84.3  0.000000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  34.66 
 
 		 543 aa  84  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  26.84 
 
 		 345 aa  83.6  0.000000000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0689  OmpA/MotB domain protein  40.37 
 
 		 443 aa  83.6  0.000000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000828786  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  30.59 
 
 		 351 aa  83.6  0.000000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6987  OmpA/MotB domain protein  23.68 
 
 		 514 aa  83.2  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.146113  hitchhiker  0.000256581 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0282  OmpA/MotB domain protein  38.18 
 
 		 230 aa  83.2  0.000000000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000802819  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10923  OmpA family protein  40.37 
 
 		 233 aa  83.2  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.497163  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2789  OmpA/MotB domain-containing protein  42.72 
 
 		 210 aa  82.8  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000026968  hitchhiker  0.00127263 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  34.16 
 
 		 237 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2821  OmpA/MotB domain-containing protein  42.99 
 
 		 236 aa  82.4  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3975  OmpA/MotB domain protein  35.83 
 
 		 1026 aa  82.4  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0116692  normal  0.107099 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  44.12 
 
 		 321 aa  81.6  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0800  OmpA/MotB domain protein  31.93 
 
 		 362 aa  81.3  0.00000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1086  OmpA/MotB domain-containing protein  41.12 
 
 		 314 aa  81.3  0.00000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142163 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  36.88 
 
 		 510 aa  81.3  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5203  OmpA/MotB domain protein  44.55 
 
 		 668 aa  81.3  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.543853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  33.33 
 
 		 320 aa  80.9  0.00000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  37.84 
 
 		 262 aa  80.9  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  39.81 
 
 		 537 aa  80.1  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0313  OmpA/MotB domain-containing protein  34.18 
 
 		 537 aa  80.1  0.00000000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0125359  hitchhiker  0.00574347 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  31.25 
 
 		 544 aa  79.7  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  40.87 
 
 		 620 aa  80.1  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0553  OmpA/MotB domain-containing protein  35.67 
 
 		 224 aa  79.7  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  33.71 
 
 		 333 aa  79.7  0.0000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  40.95 
 
 		 466 aa  79  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0547  OmpA/MotB domain protein  38.26 
 
 		 671 aa  79  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  41.51 
 
 		 219 aa  79  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2042  OmpA/MotB  40.74 
 
 		 286 aa  79  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  41.75 
 
 		 219 aa  79  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2727  OmpA/MotB  35.51 
 
 		 398 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  37.17 
 
 		 352 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2018  OmpA/MotB  37.69 
 
 		 348 aa  78.6  0.0000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  33.52 
 
 		 542 aa  79  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  34.76 
 
 		 244 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3646  OmpA/MotB domain-containing protein  31.72 
 
 		 587 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  37.18 
 
 		 337 aa  78.6  0.0000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  41.75 
 
 		 242 aa  78.6  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  35.14 
 
 		 263 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0728  OmpA/MotB domain protein  37.58 
 
 		 209 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0621  putative outer membrane protein, OmpA family  36.54 
 
 		 185 aa  77.8  0.0000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  34.23 
 
 		 261 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1284  OmpA/MotB domain protein  30.22 
 
 		 456 aa  78.2  0.0000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  35.26 
 
 		 337 aa  78.2  0.0000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  32.92 
 
 		 239 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  35.65 
 
 		 210 aa  77.4  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0070  OmpA/MotB domain protein  29.92 
 
 		 458 aa  77.4  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1506  ompA family protein  34.11 
 
 		 260 aa  77.4  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1035  OmpA/MotB domain protein  37.04 
 
 		 360 aa  77.4  0.0000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  40.78 
 
 		 218 aa  77.4  0.0000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  33.53 
 
 		 375 aa  77.8  0.0000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  37.27 
 
 		 218 aa  77.4  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0958  OmpA/MotB domain-containing protein  41.07 
 
 		 243 aa  77.8  0.0000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02523  OmpA family outer membrane protein  30.12 
 
 		 365 aa  77.4  0.0000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.654383  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  40.78 
 
 		 218 aa  77.4  0.0000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1805  OmpA/OmpF family outer membrane protein  38.74 
 
 		 217 aa  77.4  0.0000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1066  OmpA/MotB  33.33 
 
 		 264 aa  77.4  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  40.78 
 
 		 214 aa  77.4  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2341  OmpA/MotB domain protein  35.77 
 
 		 222 aa  77  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0087  OmpA/MotB domain protein  38.46 
 
 		 638 aa  77  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  43.69 
 
 		 468 aa  77  0.0000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1344  OmpA/MotB domain-containing protein  31.33 
 
 		 190 aa  77  0.0000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00124071  hitchhiker  0.0000223206 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>