209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1524 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1524  glycoside hydrolase family 43  100 
 
 		 524 aa  1082    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3360  glycoside hydrolase family 43  58.19 
 
 		 522 aa  648    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0779432 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6044  glycoside hydrolase family 43  39.84 
 
 		 501 aa  352  8.999999999999999e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.845022  normal  0.0554344 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2639  glycoside hydrolase family 43  33.05 
 
 		 472 aa  266  8.999999999999999e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  0.0143862 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  31.91 
 
 		 495 aa  264  2e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2392  glycoside hydrolase family 43  35.34 
 
 		 306 aa  137  5e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540158  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2423  glycoside hydrolase family 43  32.43 
 
 		 699 aa  137  6.0000000000000005e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3622  Xylan 1,4-beta-xylosidase  30.25 
 
 		 540 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.573352  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2723  glycoside hydrolase family protein  32.75 
 
 		 345 aa  127  5e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.469303  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3811  glycoside hydrolase family 43  29.64 
 
 		 535 aa  127  5e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3403  glycoside hydrolase family 43  29.78 
 
 		 357 aa  124  6e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000194853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  32.53 
 
 		 510 aa  123  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4021  glycoside hydrolase family protein  28.23 
 
 		 537 aa  122  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.701147 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4703  glycoside hydrolase family 43  32.38 
 
 		 341 aa  121  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.184013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  32.76 
 
 		 304 aa  120  7e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1435  glycoside hydrolase family 43  28.99 
 
 		 545 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2914  glycoside hydrolase family protein  25.12 
 
 		 547 aa  112  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2082  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  30.1 
 
 		 356 aa  108  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000230744  hitchhiker  0.000000189943 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1390  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  30.42 
 
 		 341 aa  108  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.287204  normal  0.664348 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1980  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  30.1 
 
 		 355 aa  108  3e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000532018  hitchhiker  0.000349844 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1995  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  29.77 
 
 		 355 aa  106  8e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000026265  hitchhiker  0.0000968585 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4284  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  29.26 
 
 		 327 aa  106  9e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3522  glycoside hydrolase family protein  26.42 
 
 		 534 aa  105  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.653851  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0191  glycoside hydrolase family protein  30.32 
 
 		 512 aa  105  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1423  Xylan 1,4-beta-xylosidase  25.38 
 
 		 558 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.423704 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0737  glycoside hydrolase family protein  31.03 
 
 		 345 aa  104  3e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612706  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20580  glycoside hydrolase family 43  31.1 
 
 		 315 aa  103  8e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3531  glycoside hydrolase family 43  30.65 
 
 		 511 aa  102  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185955 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3228  glycoside hydrolase family protein  25 
 
 		 563 aa  101  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00674596  normal  0.0120766 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2156  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  26.75 
 
 		 352 aa  100  6e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000116592  hitchhiker  0.00999646 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1616  alpha-L-arabinofuranosidase  25.84 
 
 		 550 aa  99.4  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2556  glycoside hydrolase family 43  28.22 
 
 		 319 aa  99.4  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.149373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1710  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.85 
 
 		 541 aa  99.8  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.783601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  29.63 
 
 		 537 aa  98.6  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2482  glycoside hydrolase family 43  30 
 
 		 384 aa  98.2  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.24102 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6022  glycoside hydrolase family 43  29.17 
 
 		 319 aa  98.2  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3750  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  29.02 
 
 		 319 aa  97.4  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00407758  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3903  glycoside hydrolase family protein  30.69 
 
 		 340 aa  97.8  5e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.969992  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3042  twin-arginine translocation pathway signal  25.46 
 
 		 537 aa  97.4  6e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.351967  normal  0.568346 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2051  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  28.16 
 
 		 357 aa  94.7  4e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1068  glycoside hydrolase family 43  27.89 
 
 		 797 aa  94.4  5e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000256501  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0786  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  26.95 
 
 		 346 aa  93.6  8e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141301  normal  0.447167 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2732  glycoside hydrolase family 43  28 
 
 		 315 aa  93.6  8e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2022  glycoside hydrolase family 43  29.22 
 
 		 334 aa  93.2  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2698  glycoside hydrolase family 43  31.62 
 
 		 369 aa  92.8  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.898004  normal  0.338928 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1729  glycoside hydrolase family 43  27.4 
 
 		 472 aa  93.2  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.101805  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0875  glycoside hydrolase family protein  26.54 
 
 		 636 aa  92.4  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000412559  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0700  glycoside hydrolase family 43  24.54 
 
 		 522 aa  91.3  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2532  glycoside hydrolase family 43  25.51 
 
 		 586 aa  90.5  7e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1143  Alpha-L-arabinofuranosidase  26.9 
 
 		 523 aa  89  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2028  glycoside hydrolase family protein  25.55 
 
 		 498 aa  89.4  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0536  glycoside hydrolase family 43  29.07 
 
 		 393 aa  88.2  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.812392 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0842  Alpha-L-arabinofuranosidase  24.23 
 
 		 546 aa  88.2  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.122484  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1420  glycoside hydrolase family 43  28.83 
 
 		 530 aa  88.2  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.394008  normal  0.931127 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5511  glycoside hydrolase family 43  27.59 
 
 		 536 aa  86.3  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20520  beta-xylosidase  28.45 
 
 		 542 aa  86.3  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129044  normal  0.254652 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0628  glycoside hydrolase family 43  27.93 
 
 		 505 aa  86.3  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2318  alpha-N-arabinofuranosidase  28.63 
 
 		 512 aa  86.3  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0289  xylan 1,4-beta-xylosidase  23.66 
 
 		 532 aa  85.5  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000021727  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2632  glycoside hydrolase family protein  25.92 
 
 		 543 aa  85.5  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0211688  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2329  Xylan 1,4-beta-xylosidase  24.15 
 
 		 537 aa  85.1  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2090  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.28 
 
 		 537 aa  85.1  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00759162  normal  0.572245 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2518  glycoside hydrolase family protein  23.27 
 
 		 516 aa  84.7  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3545  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.42 
 
 		 547 aa  84.3  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0270111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2044  beta-xylosidase/alpha-L-arabinofuranosidase- like protein  24.68 
 
 		 1474 aa  84  0.000000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0739  glycoside hydrolase family protein  26.09 
 
 		 348 aa  84  0.000000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1878  beta-xylosidase  24.66 
 
 		 539 aa  84  0.000000000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04520  beta-xylosidase  29.58 
 
 		 491 aa  83.6  0.000000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.130696  normal  0.0670778 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07864  conserved hypothetical protein  27.27 
 
 		 540 aa  83.6  0.000000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0157749  normal  0.535242 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2409  hypothetical protein  26.01 
 
 		 541 aa  83.2  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0457  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.88 
 
 		 539 aa  83.2  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0354643 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3237  glycoside hydrolase family protein  27.83 
 
 		 1195 aa  82.8  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414155 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2114  glycoside hydrolase family 43  27.6 
 
 		 518 aa  82  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.554254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2722  glycoside hydrolase family protein  32.03 
 
 		 310 aa  82  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123508  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  26.93 
 
 		 503 aa  82.4  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3398  glycoside hydrolase family protein  21.14 
 
 		 514 aa  82.4  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740676  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2813  glycoside hydrolase family 43  25.93 
 
 		 331 aa  82  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0257715  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4289  glycoside hydrolase family protein  30.52 
 
 		 572 aa  81.6  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.786059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2699  glycoside hydrolase family 43  24.43 
 
 		 496 aa  81.3  0.00000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.276179  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3875  glycoside hydrolase family protein  23.75 
 
 		 518 aa  81.3  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4249  glycoside hydrolase family protein  27.01 
 
 		 532 aa  81.3  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0507  glycoside hydrolase family 43  28.88 
 
 		 337 aa  80.9  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.412329 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3438  glycoside hydrolase family 43  24.88 
 
 		 519 aa  80.5  0.00000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.990127  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0935  glycoside hydrolase family 43  26.72 
 
 		 522 aa  79.7  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2996  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.84 
 
 		 559 aa  79.3  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4281  glycoside hydrolase family protein  27.87 
 
 		 304 aa  80.1  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.394059  normal  0.201547 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1251  glycoside hydrolase family protein  25.85 
 
 		 665 aa  79.7  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3880  glycoside hydrolase family protein  23.31 
 
 		 571 aa  79.3  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0745  glycoside hydrolase family 43  26.4 
 
 		 327 aa  79.3  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.465475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0936  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.54 
 
 		 546 aa  79  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.789253 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0430  glycoside hydrolase family 43  26.4 
 
 		 497 aa  79.3  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.710686 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3048  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.06 
 
 		 515 aa  78.6  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0608814  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3351  glycoside hydrolase family 43  25.9 
 
 		 522 aa  77.8  0.0000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1257  glycoside hydrolase family 43  25.66 
 
 		 500 aa  77.4  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0431  glycoside hydrolase family protein  27.3 
 
 		 451 aa  77.4  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4681  glycoside hydrolase family protein  24.83 
 
 		 492 aa  77.8  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.026787  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0179  cellulose-binding family II  28.35 
 
 		 598 aa  77.4  0.0000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00318302 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0501  glycoside hydrolase family 43  26.94 
 
 		 525 aa  77  0.0000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1400  glycoside hydrolase family 43  26.58 
 
 		 517 aa  77  0.0000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.587173  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3011  Alpha-N-arabinofuranosidase  22.7 
 
 		 538 aa  76.6  0.0000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>