227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0692 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0692  translocation protein TolB  100 
 
 		 417 aa  845    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00862547  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0922  translocation protein TolB  58.43 
 
 		 418 aa  506  9.999999999999999e-143  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.484523  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1520  translocation protein TolB  57.78 
 
 		 421 aa  506  9.999999999999999e-143  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000368707  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1743  translocation protein TolB  57.55 
 
 		 421 aa  499  1e-140  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00450172  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0520  TolB domain protein  50.24 
 
 		 422 aa  431  1e-120  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0200  translocation protein TolB  49.88 
 
 		 399 aa  418  1e-116  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.000000701864  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0119  translocation protein TolB  48.1 
 
 		 402 aa  398  9.999999999999999e-111  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  unclonable  0.000000000125322  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0147  translocation protein TolB  47.87 
 
 		 402 aa  399  9.999999999999999e-111  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  unclonable  0.00000000000145725  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0107  translocation protein TolB  47.63 
 
 		 402 aa  396  1e-109  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.133002  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1398  translocation protein TolB  41.27 
 
 		 417 aa  342  8e-93  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.468764  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3513  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  26.33 
 
 		 407 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000266488  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3582  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  24.8 
 
 		 407 aa  114  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  25.13 
 
 		 427 aa  109  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000381605  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  22.72 
 
 		 432 aa  107  5e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0133  WD40 domain protein beta Propeller  25.95 
 
 		 445 aa  99  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1279  WD40 domain-containing protein  29.25 
 
 		 428 aa  97.8  3e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3540  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  30.38 
 
 		 429 aa  97.1  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000000050948  normal  1 
 
 
 
NC_007498  Pcar_2975  TolB protein  21.36 
 
 		 443 aa  93.6  5e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.508751  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2731  translocation protein TolB  24.5 
 
 		 442 aa  93.6  6e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00144802  decreased coverage  0.0000043993 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1229  translocation protein TolB  28.04 
 
 		 424 aa  93.2  8e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.910184  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3323  WD40 domain-containing protein  26.69 
 
 		 435 aa  91.3  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000401957  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1527  translocation protein TolB  23.69 
 
 		 441 aa  90.5  4e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000832022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3470  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  23.22 
 
 		 430 aa  90.5  5e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0247936  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2050  translocation protein TolB  26.87 
 
 		 429 aa  90.5  5e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1857  translocation protein TolB  24.1 
 
 		 442 aa  90.5  5e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00113428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0328  translocation protein TolB  30.56 
 
 		 454 aa  90.1  7e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0067  tol-pal system beta propeller repeat protein TolB  23.74 
 
 		 422 aa  89.4  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.518188  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0068  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  23.74 
 
 		 422 aa  89.4  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2529  translocation protein TolB  23.05 
 
 		 445 aa  89  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000320948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2229  translocation protein TolB  24.33 
 
 		 435 aa  89.4  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3394  translocation protein TolB  25.11 
 
 		 441 aa  88.2  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0076717 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2564  translocation protein TolB  23.29 
 
 		 440 aa  88.6  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000866572  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4751  translocation protein TolB  22.77 
 
 		 450 aa  87.8  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1853  translocation protein TolB  24 
 
 		 428 aa  87.8  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1785  translocation protein TolB  23.44 
 
 		 442 aa  87  5e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000978843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3119  translocation protein TolB  23.4 
 
 		 439 aa  87  5e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1742  translocation protein TolB  23.44 
 
 		 442 aa  87  5e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000714613  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1746  translocation protein TolB  23.44 
 
 		 442 aa  87  5e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000149314  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2538  translocation protein TolB  23.44 
 
 		 442 aa  87  6e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000186682  hitchhiker  0.0000162747 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3512  translocation protein TolB  25.88 
 
 		 450 aa  86.7  7e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1585  WD40 domain protein beta Propeller  23.1 
 
 		 437 aa  86.7  7e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.637887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2717  translocation protein TolB  25.69 
 
 		 450 aa  86.7  8e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.599754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0592  TolB-like protein  27.68 
 
 		 438 aa  86.7  8e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1812  translocation protein TolB  25.45 
 
 		 449 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.431319  normal  0.360787 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1311  translocation protein TolB  25.45 
 
 		 444 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0242  translocation protein TolB  24.4 
 
 		 428 aa  85.5  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1607  translocation protein TolB  23.05 
 
 		 442 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000108344  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0755  TolB domain-containing protein  28.91 
 
 		 457 aa  84.7  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4147  translocation protein TolB  25 
 
 		 449 aa  84.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2194  translocation protein TolB  23.29 
 
 		 432 aa  84.3  0.000000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.246481  normal  0.294233 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2748  translocation protein TolB  23.39 
 
 		 442 aa  83.6  0.000000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0145  translocation protein TolB  23.81 
 
 		 434 aa  83.6  0.000000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1462  translocation protein TolB  22.49 
 
 		 442 aa  83.6  0.000000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000134108  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1394  translocation protein TolB  21.69 
 
 		 442 aa  83.6  0.000000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000203609  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2531  translocation protein TolB  22.66 
 
 		 442 aa  83.2  0.000000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000171266  normal  0.044306 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1017  translocation protein TolB  28.87 
 
 		 461 aa  82.4  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.609487  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2368  translocation protein TolB  22.98 
 
 		 442 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000751795  normal  0.188875 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2440  translocation protein TolB  22.98 
 
 		 442 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000137237  normal  0.263362 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3406  translocation protein TolB  24.23 
 
 		 438 aa  82.4  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569267 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1011  translocation protein TolB  20.83 
 
 		 421 aa  82.4  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0949  translocation protein TolB  25.25 
 
 		 474 aa  81.6  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.400419  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0566  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  21.54 
 
 		 428 aa  82.4  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.22163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6881  translocation protein TolB  25.98 
 
 		 462 aa  82  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464057 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2206  translocation protein TolB  27.52 
 
 		 427 aa  81.3  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281817 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0694  TolB domain protein  24.39 
 
 		 434 aa  80.9  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659148  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1984  translocation protein TolB  24.67 
 
 		 426 aa  80.9  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.517365  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1068  translocation protein TolB  25.25 
 
 		 439 aa  80.9  0.00000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.360403  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2692  translocation protein TolB  23.79 
 
 		 408 aa  80.9  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1415  translocation protein TolB  25.22 
 
 		 433 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00100672  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3972  tolB protein  25.22 
 
 		 433 aa  80.5  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0956227  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01564  translocation protein TolB  24.24 
 
 		 439 aa  80.1  0.00000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188797  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0703  TolB domain-containing protein  22.4 
 
 		 437 aa  79.7  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.408363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0659  TolB-like protein  24.04 
 
 		 434 aa  79.7  0.00000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.481566  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2902  translocation protein TolB  23.78 
 
 		 428 aa  79.7  0.00000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000513444  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0693  TolB domain protein  24.39 
 
 		 434 aa  79.7  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180783  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1454  TolB protein  25.4 
 
 		 419 aa  79.3  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4402  translocation protein TolB  25.22 
 
 		 414 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.145947  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1529  TolB protein  25.4 
 
 		 419 aa  79  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0393  translocation protein TolB  30 
 
 		 451 aa  79  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2210  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  27.83 
 
 		 438 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000769838  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1723  translocation protein TolB  23.35 
 
 		 443 aa  79  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0502645 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3632  tolB protein, putative  21.91 
 
 		 441 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000231281  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1981  translocation protein TolB  23.35 
 
 		 440 aa  77.8  0.0000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0684  translocation protein TolB  23.04 
 
 		 434 aa  78.2  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672983  normal  0.603997 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0744  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  21.07 
 
 		 445 aa  77.4  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.950557  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0728  translocation protein TolB  23.04 
 
 		 434 aa  77  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00650912  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2092  translocation protein TolB  19.34 
 
 		 425 aa  77  0.0000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.626129  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0747  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  23.02 
 
 		 444 aa  76.6  0.0000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000257607  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0898  TolB-like  22.62 
 
 		 432 aa  76.6  0.0000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336659  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1346  translocation protein TolB  25.52 
 
 		 421 aa  76.6  0.0000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1222  translocation protein TolB  22.57 
 
 		 433 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1910  TolB protein, putative  26.74 
 
 		 440 aa  75.9  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2675  translocation protein TolB  23.48 
 
 		 446 aa  75.5  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1251  translocation protein TolB  22.57 
 
 		 423 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0936092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1699  translocation protein TolB  23.01 
 
 		 442 aa  76.3  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.182328  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4196  translocation protein TolB  22.57 
 
 		 423 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1279  translocation protein TolB  23.13 
 
 		 430 aa  75.9  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000335238  decreased coverage  0.00000521877 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1711  WD40 domain protein beta Propeller  24.06 
 
 		 444 aa  75.5  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000750977  decreased coverage  0.0000915698 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0588  WD40 domain protein beta Propeller  20.95 
 
 		 439 aa  75.5  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000301748  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2086  translocation protein TolB  21.29 
 
 		 441 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000540509  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>