More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_13643 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4540  OmpA/MotB domain-containing protein  49.07 
 
 		 643 aa  635    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13643  OmpA family protein  100 
 
 		 665 aa  1372    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.830628  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3950  OmpA/MotB domain-containing protein  46.21 
 
 		 653 aa  578  1.0000000000000001e-163  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1699  OmpA/MotB domain protein  45.47 
 
 		 650 aa  564  1.0000000000000001e-159  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1647  OmpA/MotB domain-containing protein  41.94 
 
 		 666 aa  541  9.999999999999999e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1700  OmpA/MotB domain protein  42.86 
 
 		 660 aa  522  1e-147  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3973  OmpA/MotB domain-containing protein  39.05 
 
 		 642 aa  472  1e-132  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04495  OmpA family protein  40.46 
 
 		 626 aa  434  1e-120  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.30865  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  37.14 
 
 		 645 aa  427  1e-118  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.41488  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01035  OmpA family protein  35.31 
 
 		 630 aa  347  3e-94  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2275  OmpA/MotB domain-containing protein  35.83 
 
 		 712 aa  319  7.999999999999999e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1311  OmpA/MotB domain protein  34.23 
 
 		 757 aa  292  2e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191554  normal  0.469378 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5752  OmpA/MotB domain protein  32.03 
 
 		 677 aa  281  2e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.219859  normal  0.716064 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3584  OmpA/MotB domain protein  32.21 
 
 		 798 aa  279  1e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.302775  normal  0.682864 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5203  OmpA/MotB domain protein  29.8 
 
 		 668 aa  270  8e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.543853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0125  outer membrane protein, peptidoglycan-associated lipoprotein  29.99 
 
 		 656 aa  256  1.0000000000000001e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4338  OmpA/MotB domain protein  29.66 
 
 		 648 aa  252  1e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.553848 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5272  OmpA/MotB domain protein  27.66 
 
 		 613 aa  245  1.9999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00153444  normal  0.0517848 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0547  OmpA/MotB domain protein  28.53 
 
 		 671 aa  223  7e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2715  peptidoglycan-associated lipoprotein  29.1 
 
 		 673 aa  222  1.9999999999999999e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234601  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1058  OmpA family protein  29.17 
 
 		 672 aa  220  7e-56  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0880702 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1796  outer membrane protein 3a  34.07 
 
 		 903 aa  207  4e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.446296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4945  OmpA/MotB domain protein  37.54 
 
 		 813 aa  204  3e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3744  OmpA/MotB domain protein  27.83 
 
 		 679 aa  188  3e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000811796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  28.16 
 
 		 640 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0595  outer membrane protein A  29.15 
 
 		 734 aa  185  3e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00808098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2066  OmpA/MotB domain protein  31.69 
 
 		 631 aa  183  8.000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0885806  normal  0.200128 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  26.09 
 
 		 641 aa  178  3e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0109  OmpA/MotB domain protein  32.17 
 
 		 585 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.012333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1781  OmpA/MotB domain protein  25.37 
 
 		 658 aa  174  3.9999999999999995e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.973049 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  25.46 
 
 		 620 aa  171  4e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  24.96 
 
 		 656 aa  163  7e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  26.7 
 
 		 630 aa  154  4e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0087  OmpA/MotB domain protein  29.09 
 
 		 638 aa  152  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3625  WD40 domain protein beta Propeller  28.42 
 
 		 471 aa  151  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13359  hitchhiker  0.000473153 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  30.53 
 
 		 694 aa  150  9e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1705  OmpA/MotB domain protein  36.04 
 
 		 340 aa  150  1.0000000000000001e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.597429  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2542  OmpA/MotB domain protein  28.51 
 
 		 704 aa  147  5e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  29.07 
 
 		 510 aa  146  1e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  28.26 
 
 		 631 aa  144  7e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  28.57 
 
 		 537 aa  143  8e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2183  OmpA/MotB domain protein  28.51 
 
 		 778 aa  141  3.9999999999999997e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.480779  normal  0.0613811 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2714  outer membrane protein  24.2 
 
 		 648 aa  136  9.999999999999999e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.882447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2993  outer membrane protein  23.97 
 
 		 712 aa  133  1.0000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  27.33 
 
 		 669 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5107  OmpA/MotB domain protein  26.94 
 
 		 673 aa  125  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0634849 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2606  outer membrane peptidoglycan-associated protein  27.54 
 
 		 710 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  26.64 
 
 		 670 aa  118  3.9999999999999997e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  26.01 
 
 		 525 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1585  OmpA family outer membrane protein  26.02 
 
 		 517 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167386  normal  0.202036 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2198  OmpA/MotB domain protein  26.46 
 
 		 594 aa  111  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000013848  decreased coverage  0.000000000020207 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  27.27 
 
 		 509 aa  110  7.000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1558  outer membrane protein  24.49 
 
 		 519 aa  108  3e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.335417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1741  OmpA/MotB domain protein  24.36 
 
 		 586 aa  99.4  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4274  OmpA/MotB domain protein  30.73 
 
 		 568 aa  97.1  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.24355  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08086  hypothetical protein  38.39 
 
 		 366 aa  93.6  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0800  OmpA/MotB domain protein  40.34 
 
 		 362 aa  87.8  5e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4812  OmpA/MotB domain protein  34.84 
 
 		 1755 aa  85.5  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1845  WD40 domain-containing protein  33.84 
 
 		 789 aa  82  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.418755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  41.51 
 
 		 454 aa  82  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  40.57 
 
 		 466 aa  81.6  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1880  outer membrane protein  40 
 
 		 375 aa  81.3  0.00000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000687097  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1802  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 375 aa  80.9  0.00000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252189  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  40.37 
 
 		 447 aa  80.9  0.00000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1255  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  41.28 
 
 		 422 aa  80.9  0.00000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.201684  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02523  OmpA family outer membrane protein  37.82 
 
 		 365 aa  80.1  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.654383  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1932  outer membrane protein  36.67 
 
 		 424 aa  79.3  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.259358 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  36.44 
 
 		 623 aa  79.3  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  37.61 
 
 		 230 aa  79  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  37.72 
 
 		 457 aa  77.4  0.0000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  39.42 
 
 		 429 aa  76.6  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2084  WD40 domain protein beta Propeller  37.76 
 
 		 293 aa  76.6  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.243995 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0127  outer membrane protein  34.85 
 
 		 415 aa  76.6  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017735  normal  0.0709429 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  35.65 
 
 		 427 aa  75.9  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0388  OmpA/MotB domain protein  41.18 
 
 		 459 aa  75.9  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134908  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3101  OmpA/MotB  40 
 
 		 230 aa  75.5  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.282577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3868  OmpA/MotB domain protein  36.67 
 
 		 412 aa  75.1  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  35.65 
 
 		 226 aa  74.7  0.000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  38.02 
 
 		 223 aa  74.7  0.000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1284  OmpA/MotB domain protein  36.94 
 
 		 456 aa  74.7  0.000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0382  OmpA/MotB domain protein  40.38 
 
 		 459 aa  74.3  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  39.09 
 
 		 374 aa  74.3  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  35.09 
 
 		 440 aa  74.3  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0239  OmpA/MotB domain-containing protein  30.61 
 
 		 317 aa  73.9  0.000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5477  OmpA/MotB domain protein  35.9 
 
 		 637 aa  73.9  0.000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.650705  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  34.58 
 
 		 320 aa  73.9  0.000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01273  hypothetical protein  35.78 
 
 		 318 aa  73.6  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  39.42 
 
 		 468 aa  73.6  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  36.11 
 
 		 319 aa  73.2  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  35.71 
 
 		 321 aa  72  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0393  OmpA/MotB domain protein  39.33 
 
 		 399 aa  72  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2905  OmpA/MotB domain protein  38.46 
 
 		 466 aa  71.6  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000108671 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3469  peptidoglycan-associated lipoprotein  35.9 
 
 		 188 aa  71.6  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00389403  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  38.78 
 
 		 375 aa  71.6  0.00000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  30.25 
 
 		 344 aa  71.2  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  30.25 
 
 		 344 aa  71.2  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  34.86 
 
 		 224 aa  71.2  0.00000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  35.59 
 
 		 296 aa  71.2  0.00000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  30.25 
 
 		 344 aa  71.2  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1275  OmpA/MotB domain protein  36.05 
 
 		 227 aa  70.9  0.00000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0265448  normal  0.247655 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>