71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1845 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1845  WD40 domain-containing protein  100 
 
 		 789 aa  1571    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.418755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1770  WD40 domain protein beta Propeller  30.45 
 
 		 316 aa  126  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1824  WD40 domain-containing protein  38.66 
 
 		 309 aa  126  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.687468  normal  0.378526 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4395  hypothetical protein  29.81 
 
 		 300 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.198402  normal  0.0643344 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2087  hypothetical protein  27.8 
 
 		 296 aa  90.1  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4540  OmpA/MotB domain-containing protein  30.46 
 
 		 643 aa  82  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13643  OmpA family protein  33.33 
 
 		 665 aa  82  0.00000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.830628  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  27.94 
 
 		 537 aa  82  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2066  OmpA/MotB domain protein  29.18 
 
 		 631 aa  80.1  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0885806  normal  0.200128 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3950  OmpA/MotB domain-containing protein  28.64 
 
 		 653 aa  80.5  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  32.16 
 
 		 645 aa  80.1  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.41488  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4001  hypothetical protein  24.83 
 
 		 299 aa  79.3  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  29.46 
 
 		 656 aa  79  0.0000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3584  OmpA/MotB domain protein  30.53 
 
 		 798 aa  78.6  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.302775  normal  0.682864 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  26.55 
 
 		 669 aa  78.2  0.0000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0439  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  26.14 
 
 		 306 aa  77.8  0.0000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00226891  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2542  OmpA/MotB domain protein  27.63 
 
 		 704 aa  76.6  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2275  OmpA/MotB domain-containing protein  27.69 
 
 		 712 aa  76.6  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  26.42 
 
 		 631 aa  76.3  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1311  OmpA/MotB domain protein  25.73 
 
 		 757 aa  74.7  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191554  normal  0.469378 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1781  OmpA/MotB domain protein  25.97 
 
 		 658 aa  73.6  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.973049 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4002  hypothetical protein  28.57 
 
 		 285 aa  73.9  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0438  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  27.2 
 
 		 294 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000271356  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  29.2 
 
 		 525 aa  73.2  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1844  metallophosphoesterase  37.93 
 
 		 776 aa  73.6  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.213592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1660  hypothetical protein  24.81 
 
 		 288 aa  71.6  0.00000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.515318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  27.52 
 
 		 670 aa  71.2  0.00000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1058  OmpA family protein  27.02 
 
 		 672 aa  70.9  0.00000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0880702 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3973  OmpA/MotB domain-containing protein  28.86 
 
 		 642 aa  70.5  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1647  OmpA/MotB domain-containing protein  27.69 
 
 		 666 aa  70.5  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0562  WD40 domain-containing protein  31.25 
 
 		 297 aa  69.3  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.65057  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04495  OmpA family protein  26.94 
 
 		 626 aa  69.7  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.30865  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2715  peptidoglycan-associated lipoprotein  28.33 
 
 		 673 aa  68.6  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2084  WD40 domain protein beta Propeller  31.74 
 
 		 293 aa  68.2  0.0000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.243995 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1699  OmpA/MotB domain protein  25.09 
 
 		 650 aa  67.8  0.0000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4338  OmpA/MotB domain protein  32.8 
 
 		 648 aa  67  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.553848 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0087  OmpA/MotB domain protein  25.2 
 
 		 638 aa  65.1  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5107  OmpA/MotB domain protein  24.09 
 
 		 673 aa  63.9  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0634849 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  25.71 
 
 		 630 aa  63.9  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1700  OmpA/MotB domain protein  24.15 
 
 		 660 aa  63.9  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0109  OmpA/MotB domain protein  28.64 
 
 		 585 aa  60.8  0.00000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.012333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  26.1 
 
 		 620 aa  60.8  0.00000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  30.36 
 
 		 641 aa  60.5  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2714  outer membrane protein  27.42 
 
 		 648 aa  60.5  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.882447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5203  OmpA/MotB domain protein  28.03 
 
 		 668 aa  59.7  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.543853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2993  outer membrane protein  36.89 
 
 		 712 aa  60.1  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1558  outer membrane protein  21.5 
 
 		 519 aa  59.7  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.335417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  26.96 
 
 		 509 aa  57.8  0.0000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5272  OmpA/MotB domain protein  30.24 
 
 		 613 aa  57.4  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00153444  normal  0.0517848 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4945  OmpA/MotB domain protein  27.09 
 
 		 813 aa  57  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  29.2 
 
 		 640 aa  56.2  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2198  OmpA/MotB domain protein  24.67 
 
 		 594 aa  56.2  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000013848  decreased coverage  0.000000000020207 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0547  OmpA/MotB domain protein  26.6 
 
 		 671 aa  55.5  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1454  outer membrane protein  26.98 
 
 		 504 aa  54.3  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.298256  normal  0.596382 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  34.12 
 
 		 510 aa  53.5  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02820  hypothetical protein  31.98 
 
 		 263 aa  53.5  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5752  OmpA/MotB domain protein  37.33 
 
 		 677 aa  53.5  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.219859  normal  0.716064 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  40.62 
 
 		 694 aa  53.9  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1796  outer membrane protein 3a  28.14 
 
 		 903 aa  52  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.446296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4155  transcriptional regulatory protein-like  28.36 
 
 		 717 aa  50.8  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.297616 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6416  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  25.84 
 
 		 362 aa  48.9  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2183  OmpA/MotB domain protein  30.53 
 
 		 778 aa  48.1  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.480779  normal  0.0613811 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1161  hypothetical protein  27 
 
 		 344 aa  48.5  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1823  hypothetical protein  29.56 
 
 		 761 aa  48.1  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2606  outer membrane peptidoglycan-associated protein  32.8 
 
 		 710 aa  47.4  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3744  OmpA/MotB domain protein  32.58 
 
 		 679 aa  46.6  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000811796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0595  outer membrane protein A  27.84 
 
 		 734 aa  46.2  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00808098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2689  WD40 domain protein beta Propeller  42.25 
 
 		 339 aa  46.6  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.612701  normal  0.326284 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4234  transcriptional regulatory protein-like  24.88 
 
 		 469 aa  45.8  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3347  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  35.85 
 
 		 160 aa  43.9  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.52168  normal  0.409524 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2755  WD40 domain-containing protein  35.85 
 
 		 160 aa  43.9  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>