More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6918 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 847 aa  1724    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  38.31 
 
 		 878 aa  361  3e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  38.97 
 
 		 810 aa  355  2e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.18 
 
 		 1056 aa  278  3e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.37 
 
 		 988 aa  260  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.64 
 
 		 1022 aa  259  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.94 
 
 		 818 aa  242  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.7 
 
 		 1056 aa  239  1e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.05 
 
 		 784 aa  234  6e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  27.89 
 
 		 1676 aa  224  4.9999999999999996e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  29 
 
 		 1737 aa  213  7.999999999999999e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  33.25 
 
 		 795 aa  213  1e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.72 
 
 		 632 aa  212  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  34.62 
 
 		 909 aa  206  2e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  35.91 
 
 		 649 aa  204  7e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  37.82 
 
 		 685 aa  193  1e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  29.64 
 
 		 566 aa  191  4e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  35.74 
 
 		 816 aa  191  5.999999999999999e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  35.58 
 
 		 681 aa  190  1e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  27.87 
 
 		 3301 aa  190  1e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  27.05 
 
 		 3172 aa  189  1e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  31.3 
 
 		 681 aa  182  2e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  27.39 
 
 		 887 aa  180  8e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  38.55 
 
 		 875 aa  177  5e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.73 
 
 		 2240 aa  178  5e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  27.15 
 
 		 448 aa  177  5e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  25.17 
 
 		 1486 aa  177  6e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  28.91 
 
 		 486 aa  175  2.9999999999999996e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  31.41 
 
 		 725 aa  175  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  26.06 
 
 		 732 aa  173  1e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  29.09 
 
 		 3145 aa  171  4e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  35.76 
 
 		 626 aa  170  9e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  35.44 
 
 		 620 aa  169  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  35.86 
 
 		 714 aa  169  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  35.76 
 
 		 626 aa  167  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  35.76 
 
 		 614 aa  167  9e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  21.93 
 
 		 1421 aa  166  2.0000000000000002e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  35.44 
 
 		 626 aa  165  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  35.44 
 
 		 614 aa  165  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  35.44 
 
 		 614 aa  165  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  34.49 
 
 		 620 aa  165  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  35.44 
 
 		 614 aa  165  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  34.18 
 
 		 615 aa  164  8.000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  34.28 
 
 		 637 aa  163  1e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  34.85 
 
 		 865 aa  163  2e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  27.18 
 
 		 1276 aa  161  5e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  35.28 
 
 		 714 aa  158  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  36.48 
 
 		 612 aa  156  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  36.48 
 
 		 636 aa  155  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  23.81 
 
 		 1154 aa  156  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  31.96 
 
 		 808 aa  155  4e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  29.49 
 
 		 824 aa  155  4e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  36.39 
 
 		 639 aa  154  5e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  37.05 
 
 		 362 aa  154  5.9999999999999996e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  37.25 
 
 		 614 aa  154  7e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  26.73 
 
 		 676 aa  154  8.999999999999999e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  27.1 
 
 		 543 aa  153  1e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0689  TPR repeat-containing protein  26.44 
 
 		 632 aa  153  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000734837  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  25.87 
 
 		 927 aa  153  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  25.58 
 
 		 1694 aa  153  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  29.67 
 
 		 764 aa  150  8e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  36.08 
 
 		 637 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  27.25 
 
 		 733 aa  150  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0595  TPR repeat-containing protein  34.76 
 
 		 795 aa  149  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  37.83 
 
 		 611 aa  148  5e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  31.3 
 
 		 827 aa  147  6e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  37.97 
 
 		 635 aa  147  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 392 aa  147  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  37.97 
 
 		 635 aa  147  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  26.05 
 
 		 594 aa  147  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.21 
 
 		 639 aa  146  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  23.68 
 
 		 617 aa  146  2e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3191  TPR domain-containing protein  26.95 
 
 		 638 aa  145  3e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  31.99 
 
 		 833 aa  145  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  40.38 
 
 		 340 aa  145  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 718 aa  144  8e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.44 
 
 		 689 aa  144  9e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  27.19 
 
 		 576 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2859  sulfotransferase  24.36 
 
 		 832 aa  142  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.398491 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  33.48 
 
 		 750 aa  139  2e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  30.1 
 
 		 622 aa  139  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  27.93 
 
 		 1094 aa  139  3.0000000000000003e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  33.64 
 
 		 828 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3197  O-GlcNAc transferase, p110 subunit  31.96 
 
 		 395 aa  138  4e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.187148  normal  0.017581 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  33.94 
 
 		 828 aa  138  4e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  33.96 
 
 		 789 aa  138  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  34.92 
 
 		 573 aa  138  4e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  28.93 
 
 		 935 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  25.63 
 
 		 936 aa  137  6.0000000000000005e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  29.38 
 
 		 767 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  24.81 
 
 		 462 aa  135  3e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1870  TPR repeat-containing protein  33.96 
 
 		 686 aa  135  3e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1350  TPR repeat-containing protein  35.22 
 
 		 766 aa  135  3.9999999999999996e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  33.67 
 
 		 732 aa  134  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  27.14 
 
 		 837 aa  133  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  31.1 
 
 		 603 aa  133  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  26.43 
 
 		 4079 aa  133  1.0000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3216  TPR repeat-containing protein  27.71 
 
 		 643 aa  133  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000674385  hitchhiker  0.00000466075 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  26.72 
 
 		 706 aa  131  5.0000000000000004e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  28.75 
 
 		 3035 aa  130  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>