243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_06910 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_06910  glycosidase  100 
 
 		 470 aa  967    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0553945  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1926  Alpha-amylase  53.83 
 
 		 688 aa  499  1e-140  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1927  alpha amylase catalytic region  56.29 
 
 		 914 aa  493  9.999999999999999e-139  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1130  alpha amylase catalytic region  52.89 
 
 		 566 aa  450  1e-125  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2001  Alpha-amylase  50.67 
 
 		 589 aa  439  9.999999999999999e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.357099  normal  0.053891 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0609  alpha amylase, catalytic domain protein  45.32 
 
 		 551 aa  410  1e-113  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  44.19 
 
 		 1888 aa  395  1e-109  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3337  Glycosidase-like protein  48.73 
 
 		 679 aa  392  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.543706  normal  0.14646 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4065  Alpha-amylase  44.01 
 
 		 596 aa  390  1e-107  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540437  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0985  alpha amylase domain-containing protein  46.89 
 
 		 605 aa  379  1e-104  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0694969  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05290  glycosidase  46.52 
 
 		 479 aa  374  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2478  alpha amylase catalytic region  44.95 
 
 		 612 aa  354  2e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0194919  normal  0.119382 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2859  Alpha-amylase  42.04 
 
 		 661 aa  348  2e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1247  alpha amylase catalytic region  41.42 
 
 		 494 aa  341  1e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.350307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4685  alpha amylase catalytic region  41.92 
 
 		 738 aa  341  1e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0930  alpha amylase catalytic region  44.35 
 
 		 614 aa  336  3.9999999999999995e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2938  ATPase  44.55 
 
 		 563 aa  336  5e-91  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5195  Alpha-amylase  41.67 
 
 		 707 aa  330  3e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2896  Alpha-amylase  40.09 
 
 		 722 aa  320  3e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.578872 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4292  Alpha-amylase A precursor (1,4-alpha-D-glucan glucanohydrolase)  37.9 
 
 		 528 aa  305  9.000000000000001e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2686  alpha amylase, catalytic region  40.31 
 
 		 722 aa  303  4.0000000000000003e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.288393 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2712  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  39.62 
 
 		 2156 aa  269  7e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05253  alpha-amylase  28.81 
 
 		 449 aa  126  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001376  glycosidase  26.13 
 
 		 449 aa  119  7.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000319288  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2728  alpha amylase catalytic region  28.54 
 
 		 453 aa  119  9e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3374  alpha amylase catalytic region  30.28 
 
 		 453 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1289  alkaline-resistant alpha-amylase precursor  28.1 
 
 		 458 aa  117  3.9999999999999997e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00644344  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1319  hypothetical protein  51.89 
 
 		 218 aa  113  8.000000000000001e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0191338  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4716  alpha amylase catalytic region  27.84 
 
 		 458 aa  110  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.79094 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3095  alpha amylase catalytic region  27.56 
 
 		 441 aa  105  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2654  alpha amylase catalytic region  26.74 
 
 		 461 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.181273  normal  0.26185 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3370  alpha-amylase  28.12 
 
 		 470 aa  94  6e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.1996  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0979  alpha-amylase  26.18 
 
 		 466 aa  93.2  8e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2110  alpha amylase catalytic region  25.45 
 
 		 439 aa  76.3  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1317  alpha amylase, catalytic domain protein  24.23 
 
 		 620 aa  67.4  0.0000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06324  alpha-amylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13460)  26.86 
 
 		 559 aa  67  0.0000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.639353  normal  0.112793 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2778  alpha amylase family protein  21.2 
 
 		 750 aa  63.5  0.000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.859165  normal  0.73378 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03402  Alpha-amylasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV09]  26.16 
 
 		 623 aa  62.8  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.91072 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1746  alpha amylase, catalytic region  26.4 
 
 		 1021 aa  61.2  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0173524 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2793  alpha amylase family protein  21.05 
 
 		 750 aa  60.1  0.00000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00275664  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03308  conserved hypothetical protein. (Eurofung)  24.21 
 
 		 552 aa  60.1  0.00000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.77903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  27.85 
 
 		 499 aa  58.9  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2969  alpha amylase catalytic region  26.69 
 
 		 524 aa  58.9  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1429  glycoside hydrolase, starch-binding  24.19 
 
 		 642 aa  58.2  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.56449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4622  alpha amylase catalytic region  23.27 
 
 		 649 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00204986 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1180  alpha amylase, catalytic region  25.99 
 
 		 526 aa  57.8  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000265218  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04507  conserved hypothetical protein  24.23 
 
 		 521 aa  57  0.0000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1176  alpha amylase catalytic region  30.23 
 
 		 647 aa  57  0.0000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02018  Alpha-amylase AmyAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV07]  24.65 
 
 		 490 aa  56.6  0.0000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3842  alpha amylase catalytic region  22.86 
 
 		 586 aa  56.2  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000752132  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36710  glycogen branching enzyme  29.78 
 
 		 732 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.633943 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2344  alpha amylase catalytic region  27.76 
 
 		 575 aa  56.2  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.520603  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3153  glycogen branching enzyme  29.61 
 
 		 732 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.252202  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01120  conserved hypothetical protein  23.31 
 
 		 561 aa  55.5  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0180752  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0889  1,4-alpha-glucan branching enzyme  27.02 
 
 		 807 aa  55.5  0.000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2293  glycogen branching enzyme  29.21 
 
 		 712 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.467117  hitchhiker  0.000028583 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3708  alpha amylase catalytic region  29.3 
 
 		 521 aa  55.1  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03480  Alpha-amylase precursor, putative  24.84 
 
 		 532 aa  55.1  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.389023  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2536  glycogen branching enzyme  23.77 
 
 		 743 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.507075 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0277  glycogen branching enzyme  27.41 
 
 		 727 aa  55.1  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5853  alpha amylase catalytic region  28.41 
 
 		 742 aa  54.7  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0389202  normal  0.176008 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2593  alpha amylase catalytic region  26.62 
 
 		 258 aa  55.1  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191559  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00080  alpha-amylase  22.25 
 
 		 456 aa  54.7  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.52316  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0983  alpha amylase catalytic region  30.88 
 
 		 555 aa  53.9  0.000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000965574  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0584  trehalose synthase  28.17 
 
 		 606 aa  53.5  0.000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0568  alpha amylase catalytic region  28.03 
 
 		 441 aa  53.5  0.000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.489897  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8729  alpha amylase catalytic region  26.95 
 
 		 441 aa  53.1  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.150253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0965  alpha amylase, catalytic region  30.15 
 
 		 555 aa  53.1  0.000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000585421  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0660  alpha amylase, catalytic region  27 
 
 		 484 aa  52.8  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0554  alpha amylase, catalytic region  26.85 
 
 		 441 aa  53.1  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0002426  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2425  alpha amylase catalytic region  25.18 
 
 		 509 aa  52.4  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144227  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2579  alpha amylase catalytic region  25.58 
 
 		 576 aa  52.4  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000456037  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4463  alpha amylase catalytic region  24.03 
 
 		 442 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.469495 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3205  alpha amylase catalytic region  27.09 
 
 		 583 aa  52  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00323479  normal  0.589076 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1683  alpha amylase catalytic region  22.22 
 
 		 836 aa  52.4  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.332102  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02410  alpha amylase  24.36 
 
 		 364 aa  52  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09700  alpha amylase  27.07 
 
 		 426 aa  51.6  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5099  glycogen branching enzyme  28 
 
 		 736 aa  51.2  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0222717  normal  0.0266219 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03388  alpha-amylase (Eurofung)  27.38 
 
 		 462 aa  50.8  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.792359 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02760  Alpha-amylase A precursor, putative  23.51 
 
 		 572 aa  50.8  0.00005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  24.53 
 
 		 1891 aa  50.8  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27990  glycogen branching enzyme  24.48 
 
 		 733 aa  50.8  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.6277  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2677  glycogen branching enzyme  25 
 
 		 738 aa  50.4  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.810703  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5384  glycogen branching enzyme  28.27 
 
 		 737 aa  50.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.475893  normal  0.712549 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1817  glycogen branching enzyme  22.63 
 
 		 736 aa  50.4  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.297047 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14740  alpha amylase  27.54 
 
 		 515 aa  50.1  0.00008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0597647  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0953  alpha amylase, catalytic region  23.08 
 
 		 814 aa  50.1  0.00008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0761659  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1980  trehalose synthase  27.8 
 
 		 1109 aa  50.1  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0525025  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0239  glycogen branching enzyme  24.69 
 
 		 775 aa  50.1  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0137851  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1727  alpha amylase catalytic region  27.1 
 
 		 454 aa  49.7  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000518329  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0152  trehalose synthase  27.97 
 
 		 1113 aa  49.7  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.38856 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3679  trehalose synthase-like  27.01 
 
 		 574 aa  49.7  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1844  glycoside hydrolase family 13 domain protein  30.5 
 
 		 414 aa  49.3  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.521996  normal  0.198003 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_46693  predicted protein  29.91 
 
 		 979 aa  49.3  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.649333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0014  alpha amylase, catalytic region  26.02 
 
 		 595 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328102 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8169  glycogen branching enzyme  27.91 
 
 		 785 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166235 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3657  glycogen branching enzyme  22.08 
 
 		 736 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0888692  normal  0.0129978 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6823  glycogen branching enzyme  29.1 
 
 		 736 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.851597 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3720  alpha amylase, catalytic region  25.96 
 
 		 468 aa  48.9  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4246  alpha amylase catalytic region  25.81 
 
 		 593 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.286976  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>