More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0148 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A3338  TPR repeat-containing protein  81.74 
 
 
595 aa  959  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0161  TPR repeat-containing protein  97.66 
 
 
598 aa  1170  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0148  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
619 aa  1251  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2996  TPR repeat-containing protein  63.56 
 
 
626 aa  768  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.637966  normal  0.0209641 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  47.38 
 
 
708 aa  544  1e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  50.87 
 
 
828 aa  524  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  50.53 
 
 
828 aa  508  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0164  TPR repeat-containing protein  51.43 
 
 
833 aa  507  1e-142  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863115  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  50.53 
 
 
828 aa  506  1e-142  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  51.34 
 
 
833 aa  503  1e-141  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  49.72 
 
 
789 aa  498  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  47.91 
 
 
732 aa  487  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  49.51 
 
 
824 aa  478  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  44.68 
 
 
754 aa  449  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  45.72 
 
 
754 aa  446  1e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0293  TPR repeat-containing protein  42.7 
 
 
789 aa  418  1e-115  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  41.67 
 
 
585 aa  333  8e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0461  TPR repeat-containing protein  35.07 
 
 
627 aa  317  6e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.999909  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2809  TPR repeat-containing protein  35.88 
 
 
717 aa  316  9e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  35.45 
 
 
718 aa  310  5e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3037  TPR repeat-containing protein  35.07 
 
 
717 aa  310  6e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3368  Tetratricopeptide domain protein  35.51 
 
 
596 aa  305  2e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2093  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
1714 aa  302  1e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.34 
 
 
589 aa  300  4e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27710  glycosyl transferase,TPR repeat protein  32.52 
 
 
1221 aa  298  3e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1986  sulfotransferase  34.04 
 
 
1415 aa  297  4e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.634546  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3824  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.98 
 
 
1106 aa  296  9e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138221 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3854  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.11 
 
 
723 aa  292  1e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3741  TPR repeat-containing protein  36.19 
 
 
1106 aa  290  7e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3742  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.69 
 
 
589 aa  289  1e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5235  hypothetical protein  33.73 
 
 
797 aa  284  4e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050699  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0238  TPR repeat-containing protein  35.29 
 
 
780 aa  283  8e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2869  tetratricopeptide TPR_2  35.29 
 
 
780 aa  283  8e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0220  TPR repeat-containing protein  35.33 
 
 
779 aa  280  7e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.991207  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3873  TPR repeat-containing protein  34.42 
 
 
776 aa  275  2e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.661818  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0094  TPR domain-containing protein  34.25 
 
 
821 aa  273  7e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.822931  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2876  TPR domain-containing protein  34.6 
 
 
821 aa  272  1e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0100  TPR domain-containing protein  33.22 
 
 
790 aa  272  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3451  TPR domain-containing protein  34.77 
 
 
776 aa  271  2e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0799942  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1668  TPR domain-containing protein  34.77 
 
 
776 aa  271  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.329119  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3835  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.22 
 
 
790 aa  272  2e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.304839  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3099  TPR domain-containing protein  34.77 
 
 
776 aa  271  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3955  TPR repeat-containing protein  34.08 
 
 
776 aa  270  4e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3210  TPR domain-containing protein  35.86 
 
 
781 aa  269  1e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  30.97 
 
 
708 aa  268  2e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1802  TPR repeat-containing protein  32.38 
 
 
822 aa  266  6e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.984059  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3331  TPR repeat-containing protein  31.86 
 
 
633 aa  266  8e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.332967  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2822  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.32 
 
 
529 aa  263  7e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6522  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  32.68 
 
 
740 aa  263  1e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.722582  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0785  TPR repeat-containing protein  33.51 
 
 
796 aa  261  2e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.225465  hitchhiker  0.00421983 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  30.98 
 
 
968 aa  260  5e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5619  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  32.58 
 
 
739 aa  259  9e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.474452 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1509  TPR domain-containing protein  31.5 
 
 
699 aa  255  1e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000367862  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5618  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  32.76 
 
 
739 aa  251  3e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.645263 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0051  TPR repeat-containing protein  33.19 
 
 
633 aa  251  3e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00284913  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5617  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  30.45 
 
 
739 aa  249  8e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.277247 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3369  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.52 
 
 
667 aa  249  8e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0774784  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  27.47 
 
 
909 aa  248  2e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  31.17 
 
 
3035 aa  247  4e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3065  TPR repeat-containing protein  31.01 
 
 
734 aa  243  8e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0065343  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  30.7 
 
 
715 aa  243  1e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2569  Methyltransferase type 11  31.59 
 
 
1143 aa  241  2e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  28.46 
 
 
3560 aa  241  4e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0103  TPR repeat-containing protein  31.97 
 
 
733 aa  240  5e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467133  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  30.82 
 
 
1085 aa  240  6e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2855  hypothetical protein  35.97 
 
 
937 aa  240  6e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  31.76 
 
 
713 aa  239  8e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3269  TPR repeat-containing protein  31.16 
 
 
693 aa  238  2e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.306934  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  28.42 
 
 
4489 aa  238  3e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1582  Methyltransferase type 12  31.66 
 
 
1144 aa  237  4e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  29.38 
 
 
700 aa  237  4e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4399  TPR repeat-containing protein  31.39 
 
 
727 aa  235  2e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.516213 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  25.7 
 
 
750 aa  233  6e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3533  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  32.57 
 
 
742 aa  232  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  32.83 
 
 
667 aa  230  6e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0863  TPR repeat-containing protein  30.08 
 
 
647 aa  229  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.399235 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  26.52 
 
 
816 aa  228  2e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  30.38 
 
 
1094 aa  227  5e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  26.97 
 
 
761 aa  219  9e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0699  FkbM family methyltransferase  30.8 
 
 
921 aa  215  2e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.25199 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2139  TPR repeat-containing protein  31.29 
 
 
654 aa  215  2e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43176  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  25.52 
 
 
739 aa  211  2e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2520  methyltransferase type 12  31.21 
 
 
1116 aa  211  3e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  31.18 
 
 
808 aa  210  5e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0489  TPR repeat-containing protein  26.63 
 
 
618 aa  204  5e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0261011  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0451  TPR repeat-containing protein  32.24 
 
 
574 aa  202  1e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.871153  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2639  tetratricopeptide TPR_2  29.92 
 
 
552 aa  201  3e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0772  TPR repeat-containing protein  28.52 
 
 
611 aa  201  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447572  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1202  TPR repeat-containing protein  22.58 
 
 
632 aa  197  5e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0616  TPR repeat-containing protein  29.02 
 
 
974 aa  196  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0605  tetratricopeptide domain-containing protein  27.82 
 
 
553 aa  194  4e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.335277  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3361  TPR repeat-containing protein  28.93 
 
 
750 aa  194  5e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.311751 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3091  hypothetical protein  28.66 
 
 
680 aa  192  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677352  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1755  TPR repeat-containing protein  28.26 
 
 
647 aa  186  9e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0455441 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1160  hypothetical protein  32.63 
 
 
630 aa  184  5e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.795058  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1874  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.26 
 
 
793 aa  183  7e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0327  hypothetical protein  32.47 
 
 
657 aa  182  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.322162 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1088  hypothetical protein  33.77 
 
 
566 aa  182  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0113  O-linked N-acetylglucosamine transferase  31.73 
 
 
726 aa  181  2e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0423432  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0114  TPR repeat-containing protein  25.76 
 
 
724 aa  179  9e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.029745  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>