More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1843 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1843  transcriptional regulatory protein  100 
 
 		 201 aa  401  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.677238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3998  transcriptional regulator, TetR family  37.77 
 
 		 205 aa  102  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0825494  normal  0.0160725 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1173  regulatory protein, TetR  34.17 
 
 		 202 aa  102  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.959952 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2134  TetR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 205 aa  100  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.269562  normal  0.11419 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  34.83 
 
 		 194 aa  97.4  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7736  putative transcriptional regulator, TetR family  33.9 
 
 		 205 aa  97.4  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1426  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 204 aa  95.1  7e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0803354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 223 aa  86.3  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 213 aa  85.9  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1090  transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 		 204 aa  84.7  9e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1372  TetR family transcriptional regulator  41.53 
 
 		 212 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027491 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0395  regulatory protein TetR  32.11 
 
 		 211 aa  81.3  0.000000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.796791 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0369  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 204 aa  81.3  0.000000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.238864 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1493  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 198 aa  81.3  0.000000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0428  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 211 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1015  transcriptional regulator, TetR family  34.46 
 
 		 201 aa  79.3  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0464  transcriptional regulator, TetR family  27.57 
 
 		 211 aa  75.9  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.128175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3781  TetR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 214 aa  72.4  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6941  transcriptional regulator, TetR family  35.34 
 
 		 221 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22050  transcriptional regulator  33.7 
 
 		 199 aa  71.6  0.000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0903673 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 222 aa  71.6  0.000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00350  transcriptional regulator  31.89 
 
 		 199 aa  71.2  0.000000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3469  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.930137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1508  transcriptional regulator, TetR family  31.16 
 
 		 215 aa  70.1  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0994502  normal  0.123569 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0332  TetR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 208 aa  69.7  0.00000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0700  TetR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 178 aa  68.6  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 212 aa  65.9  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 216 aa  65.5  0.0000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2292  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 186 aa  65.1  0.0000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.030142  hitchhiker  0.00610108 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5773  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 198 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6138  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 198 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.890581 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7672  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 198 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245363  normal  0.688993 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0018  TetR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 196 aa  63.9  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  26.56 
 
 		 198 aa  63.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 202 aa  63.5  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 203 aa  63.9  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5076  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5784  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2948  TetR family transcriptional regulator  22.28 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11567  transcriptional regulator  52.94 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  52.54 
 
 		 206 aa  62  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2477  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 190 aa  62  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3301  transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 		 193 aa  60.8  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000664283 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4394  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 198 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2111  transcriptional regulator, TetR family  34.46 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.780559 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3578  TetR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 198 aa  60.1  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00935563  normal  0.0256006 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1253  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0477994 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0394  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 186 aa  60.1  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.509635  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1694  TetR family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0960426 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3493  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.729173  normal  0.75311 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3293  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124137 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3066  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.122558 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0452  transcriptional regulator, TetR family  28.02 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0191  transcriptional regulator, TetR family  24.85 
 
 		 243 aa  58.5  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00113557  decreased coverage  0.000257741 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3750  TetR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 230 aa  58.5  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3546  transcriptional regulator, TetR family  38.38 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  30.18 
 
 		 242 aa  58.5  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1924  TetR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 189 aa  58.2  0.00000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.147097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 237 aa  58.2  0.00000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1699  transcriptional regulator, TetR family  28.02 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.502572  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  27.97 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  26 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  26 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 202 aa  58.2  0.00000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0067  TetR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000826521  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4426  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.062473  normal  0.279059 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1387  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.649854  normal  0.844436 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1305  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 181 aa  57.4  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0684  transcriptional regulator, TetR family  33.05 
 
 		 197 aa  57  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.84339  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1009  transcriptional regulator BetI  27.37 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0400  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2965  TetR family transcriptional regulator  25.31 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0278757  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1827  regulatory protein, TetR  31.21 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0290  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.547414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1281  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.781108  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2657  TetR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2530  TetR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.704068 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1591  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.194821 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0304  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.661097  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16270  transcriptional regulator  30.77 
 
 		 287 aa  56.2  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4525  transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.397871 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4336  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.426629 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0765  TetR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.448904  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1032  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  31.88 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0316  putative transcriptional regulator, TetR family  31.46 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  42.59 
 
 		 307 aa  55.5  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2200  transcriptional regulator, TetR family  30.59 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>