More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1943 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_1943  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 
917 aa  1838    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0509436 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.42 
 
 
810 aa  79.3  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  29.53 
 
 
543 aa  75.5  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0447  TPR domain-containing protein  28.47 
 
 
992 aa  75.1  0.000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000620141  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  33.1 
 
 
1676 aa  75.1  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
718 aa  75.1  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  29.55 
 
 
1276 aa  74.3  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  30.8 
 
 
764 aa  74.3  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  29.61 
 
 
927 aa  74.3  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  26.57 
 
 
3560 aa  74.3  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  28.37 
 
 
465 aa  73.6  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0424  TPR repeat-containing protein  31.76 
 
 
313 aa  73.2  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.446862  normal  0.0100173 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  27.37 
 
 
878 aa  73.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.07 
 
 
632 aa  72  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2908  TPR repeat-containing protein  30.57 
 
 
203 aa  71.6  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  29.79 
 
 
725 aa  71.2  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  29.66 
 
 
622 aa  70.5  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  33.11 
 
 
397 aa  69.7  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.61 
 
 
1056 aa  70.1  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.01 
 
 
818 aa  68.9  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  24.42 
 
 
340 aa  68.9  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3199  TPR repeat-containing protein  29.51 
 
 
565 aa  68.9  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.714786  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  30.83 
 
 
374 aa  68.6  0.0000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1166  TPR domain-containing protein  28.86 
 
 
266 aa  67.4  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.194624  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  26.76 
 
 
1979 aa  67.4  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.61 
 
 
1034 aa  67.4  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  33.79 
 
 
615 aa  67.4  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  31.03 
 
 
362 aa  67  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  29.37 
 
 
1138 aa  66.2  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  33.07 
 
 
847 aa  66.6  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  29.52 
 
 
750 aa  66.6  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.68 
 
 
1022 aa  65.9  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  32.03 
 
 
505 aa  66.2  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1009  TPR repeat-containing protein  28.88 
 
 
273 aa  66.2  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0715627  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0308  TPR repeat-containing protein  30 
 
 
636 aa  65.9  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0003  TPR repeat-containing protein  25.98 
 
 
466 aa  65.9  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  29.56 
 
 
594 aa  65.5  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  31.87 
 
 
808 aa  65.1  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  31.82 
 
 
1007 aa  65.1  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.71 
 
 
758 aa  65.1  0.000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  27.33 
 
 
1297 aa  65.1  0.000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  28.93 
 
 
1737 aa  65.1  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1759  TPR repeat-containing protein  32.11 
 
 
207 aa  64.7  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  28.45 
 
 
1406 aa  64.7  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2825  Methyltransferase type 12  28.06 
 
 
436 aa  64.7  0.000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1796  TPR repeat-containing protein  29.84 
 
 
352 aa  64.7  0.000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  23.63 
 
 
750 aa  64.7  0.000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  28.85 
 
 
936 aa  64.7  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  30.71 
 
 
685 aa  64.3  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3533  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  30.18 
 
 
742 aa  64.3  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0741  TPR repeat-containing protein  31.73 
 
 
191 aa  64.3  0.000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  27.5 
 
 
561 aa  64.3  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  27.11 
 
 
366 aa  63.9  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.04 
 
 
265 aa  64.3  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
827 aa  63.9  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2261  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.65 
 
 
251 aa  64.3  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000463811 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  25.35 
 
 
3145 aa  63.9  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1139  TPR repeat-containing protein  27.04 
 
 
357 aa  63.9  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000045072  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.79 
 
 
836 aa  64.3  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  29.51 
 
 
1764 aa  63.2  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0196  TPR repeat-containing protein  28.43 
 
 
927 aa  63.2  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.935444 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  29.05 
 
 
1005 aa  63.2  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  27.61 
 
 
4079 aa  63.5  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  29.08 
 
 
875 aa  63.2  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0991  TPR repeat-containing protein  27.04 
 
 
357 aa  63.2  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161827  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.87 
 
 
784 aa  63.2  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  27.37 
 
 
1154 aa  63.2  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  26.7 
 
 
265 aa  63.5  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  31.91 
 
 
620 aa  62.8  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 
968 aa  62.8  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  26.29 
 
 
265 aa  62.8  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.93 
 
 
2240 aa  62.8  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  32.62 
 
 
620 aa  62.8  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  27.92 
 
 
837 aa  62.8  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0927  TPR repeat-containing protein  27.07 
 
 
291 aa  62.4  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3209  tetratricopeptide repeat-containing protein  25 
 
 
743 aa  62.4  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  26.28 
 
 
462 aa  62  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  25.34 
 
 
681 aa  62  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0275  TPR repeat-containing protein  27.22 
 
 
587 aa  62  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  26.71 
 
 
561 aa  62  0.00000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2856  TPR repeat-containing protein  30 
 
 
297 aa  62  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2032  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 
883 aa  62  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.192732  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0774  tetratricopeptide TPR_2  31.58 
 
 
519 aa  62  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.169881  normal  0.452711 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  33.58 
 
 
715 aa  62  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  29.66 
 
 
681 aa  61.6  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3161  TPR repeat-containing protein  30 
 
 
297 aa  62  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2117  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.57 
 
 
207 aa  61.6  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2957  TPR repeat-containing protein  30 
 
 
297 aa  62  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.338311  normal  0.060469 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.3 
 
 
689 aa  61.6  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9475  predicted protein  27.74 
 
 
336 aa  61.6  0.00000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  26.38 
 
 
392 aa  61.6  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3165  TPR repeat-containing protein  29.94 
 
 
270 aa  61.2  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  30.22 
 
 
589 aa  61.2  0.00000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  31.21 
 
 
935 aa  61.2  0.00000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  27.69 
 
 
436 aa  61.2  0.00000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  27.46 
 
 
3301 aa  61.2  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3157  TPR repeat-containing protein  34.21 
 
 
744 aa  61.2  0.00000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.513945  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 
1049 aa  61.2  0.00000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0127  TPR repeat-containing protein  33.66 
 
 
289 aa  60.5  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  28.17 
 
 
267 aa  60.8  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>