1478 genes were found for organism Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 15    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Smed_3575  CDS  NC_009620  197  3505  +  3309  Dtr system oriT relaxase  YP_001312323  normal  1  normal  1  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_3576  CDS  NC_009620  4121  4504  +  384  Kup2 potassium uptake protein  YP_001312324  normal  1  normal  1  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_3577  CDS  NC_009620  4501  4878  +  378  hypothetical protein  YP_001312325  normal  1  normal  1  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_3578  CDS  NC_009620  5353  6639  -  1287  extracellular solute-binding protein  YP_001312326  normal  0.608798  normal  1  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_3579  CDS  NC_009620  6785  7819  +  1035  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  YP_001312327  normal  1  normal  1  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_3580  CDS  NC_009620  7809  9662  +  1854  hypothetical protein  YP_001312328  normal  1  normal  1  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_3581  CDS  NC_009620  9659  10666  +  1008  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  YP_001312329  normal  1  normal  1  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_3582  CDS  NC_009620  10663  11472  +  810  xylose isomerase domain-containing protein  YP_001312330  normal  0.744907  normal  1  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_3583  CDS  NC_009620  11544  11954  +  411  hypothetical protein  YP_001312331  normal  0.252528  normal  1  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_3584  CDS  NC_009620  11948  12646  +  699  RES domain-containing protein  YP_001312332  normal  0.287485  normal  1  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_3585  CDS  NC_009620  12701  13468  -  768  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_001312333  normal  0.206113  normal  1  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_3586  CDS  NC_009620  13478  15187  -  1710  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  YP_001312334  normal  0.63579  normal  1  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_3587  CDS  NC_009620  15166  16146  -  981  NAD-dependent epimerase/dehydratase  YP_001312335  normal  1  normal  1  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_3588  CDS  NC_009620  16148  17236  -  1089  ABC transporter related  YP_001312336  normal  0.819948  normal  1  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_3589  CDS  NC_009620  17238  18068  -  831  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_001312337  normal  0.577285  normal  1  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_3590  CDS  NC_009620  18080  18985  -  906  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_001312338  normal  0.657903  normal  1  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_3591  CDS  NC_009620  19283  20548  -  1266  extracellular solute-binding protein  YP_001312339  normal  0.317951  normal  1  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_3592  CDS  NC_009620  20581  21750  -  1170  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  YP_001312340  normal  0.2088  normal  1  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_3593  CDS  NC_009620  21747  22709  -  963  dihydrodipicolinate synthetase  YP_001312341  normal  1  normal  1  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_3594  CDS  NC_009620  22728  23702  +  975  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  YP_001312342  normal  0.943632  normal  1  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_3595  CDS  NC_009620  23699  23884  +  186  hypothetical protein  YP_001312343  normal  1  normal  1  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_3596    NC_009620  23989  24162  +  174      normal  1  normal  1  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_3597  CDS  NC_009620  24208  24987  -  780  short chain dehydrogenase  YP_001312344  normal  0.475551  normal  1  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_3598  CDS  NC_009620  25022  26170  -  1149  galactonate dehydratase  YP_001312345  normal  0.729698  normal  1  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_3599  CDS  NC_009620  26228  26983  -  756  GntR domain-containing protein  YP_001312346  normal  0.83049  normal  1  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_3600  CDS  NC_009620  27191  28174  +  984  monosaccharide-transporting ATPase  YP_001312347  normal  1  normal  1  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_3601  CDS  NC_009620  28238  29764  +  1527  L-arabinose transporter ATP-binding protein  YP_001312348  normal  0.611963  normal  1  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_3602  CDS  NC_009620  29767  30720  +  954  L-arabinose transporter permease protein  YP_001312349  normal  1  normal  1  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_3603  CDS  NC_009620  31108  32136  +  1029  putative ABC transporter periplasmic sugar-binding protein  YP_001312350  normal  1  normal  1  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_3604  CDS  NC_009620  32198  33739  +  1542  ABC transporter related  YP_001312351  normal  0.88039  normal  1  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_3605  CDS  NC_009620  33759  34751  +  993  monosaccharide-transporting ATPase  YP_001312352  normal  1  normal  1  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_3606  CDS  NC_009620  34753  35757  +  1005  DeoR family transcriptional regulator  YP_001312353  normal  1  normal  1  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_3607  CDS  NC_009620  35754  36749  +  996  aldo/keto reductase  YP_001312354  normal  1  normal  1  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_3608  CDS  NC_009620  36806  38494  +  1689  FAD dependent oxidoreductase  YP_001312355  normal  1  normal  1  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_3609  CDS  NC_009620  38561  39403  +  843  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  YP_001312356  normal  1  normal  1  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_3610  CDS  NC_009620  39434  40963  +  1530  carbohydrate kinase FGGY  YP_001312357  normal  1  normal  1  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_3611  CDS  NC_009620  40960  42564  +  1605  glucose-methanol-choline oxidoreductase  YP_001312358  normal  1  normal  1  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_3612  CDS  NC_009620  43270  46539  +  3270  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  YP_001312359  normal  0.758157  normal  1  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_3613  CDS  NC_009620  46975  47631  -  657  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  YP_001312360  normal  1  normal  1  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_3614  CDS  NC_009620  48651  49637  +  987  NADH dehydrogenase (quinone)  YP_001312361  normal  1  normal  1  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_3615  CDS  NC_009620  49637  50272  +  636  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  YP_001312362  normal  1  normal  1  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_3616  CDS  NC_009620  50315  50755  +  441  signal-transduction protein  YP_001312363  normal  1  normal  1  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_3617  CDS  NC_009620  50839  53391  -  2553  molybdopterin oxidoreductase  YP_001312364  normal  1  normal  1  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_3618  CDS  NC_009620  53420  54685  -  1266  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  YP_001312365  normal  0.997911  normal  1  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_3619  CDS  NC_009620  54689  55198  -  510  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  YP_001312366  normal  1  normal  1  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_3620  CDS  NC_009620  55217  56431  -  1215  NADH dehydrogenase I, D subunit  YP_001312367  normal  0.761398  normal  1  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_3621  CDS  NC_009620  56449  56997  -  549  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  YP_001312368  normal  1  normal  1  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_3622  CDS  NC_009620  56994  57497  -  504  NADH dehydrogenase subunit B  YP_001312369  normal  0.623908  normal  1  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_3623  CDS  NC_009620  57485  57850  -  366  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 3  YP_001312370  normal  0.751182  normal  1  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_3624  CDS  NC_009620  58063  59502  -  1440  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  YP_001312371  normal  1  normal  1  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_3625  CDS  NC_009620  59499  60974  -  1476  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  YP_001312372  normal  1  normal  1  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_3626  CDS  NC_009620  60982  62742  -  1761  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  YP_001312373  normal  1  normal  1  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_3627  CDS  NC_009620  62735  62989  -  255  hypothetical protein  YP_001312374  normal  0.794226  normal  1  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_3628  CDS  NC_009620  62986  64449  -  1464  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  YP_001312375  normal  1  normal  1  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_3629  CDS  NC_009620  64454  64756  -  303  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  YP_001312376  normal  1  normal  1  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_3630  CDS  NC_009620  64756  65256  -  501  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 6  YP_001312377  normal  1  normal  1  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_3631  CDS  NC_009620  65645  65833  -  189  hypothetical protein  YP_001312378  normal  1  normal  1  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_3632    NC_009620  66248  66730  +  483      normal  1  normal  1  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_3633  CDS  NC_009620  67110  67826  -  717  L-fuculose-phosphate aldolase  YP_001312379  normal  1  normal  1  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_3634  CDS  NC_009620  67839  69287  -  1449  carbohydrate kinase FGGY  YP_001312380  normal  0.206417  normal  1  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_3635  CDS  NC_009620  69334  70182  -  849  xylose isomerase domain-containing protein  YP_001312381  normal  1  normal  1  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_3636  CDS  NC_009620  70185  71183  -  999  inner-membrane translocator  YP_001312382  normal  0.66011  normal  1  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_3637  CDS  NC_009620  71180  72181  -  1002  monosaccharide-transporting ATPase  YP_001312383  normal  1  normal  1  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_3638  CDS  NC_009620  72174  73700  -  1527  ABC transporter related  YP_001312384  normal  1  normal  1  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_3639  CDS  NC_009620  73809  74801  -  993  putative ABC transporter periplasmic sugar-binding protein  YP_001312385  normal  1  normal  1  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_3640  CDS  NC_009620  75040  76107  +  1068  regulatory protein LacI  YP_001312386  normal  1  normal  1  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_3641  CDS  NC_009620  76152  77939  -  1788  glutathione synthase  YP_001312387  normal  1  normal  1  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_3642  CDS  NC_009620  77941  79716  -  1776  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  YP_001312388  normal  1  normal  1  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_3643  CDS  NC_009620  79836  80618  -  783  GntR domain-containing protein  YP_001312389  normal  0.702528  normal  1  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_3644  CDS  NC_009620  80625  81422  -  798  ABC transporter related  YP_001312390  normal  0.992616  normal  1  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_3645  CDS  NC_009620  81422  83221  -  1800  ABC transporter related  YP_001312391  normal  1  normal  1  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_3646  CDS  NC_009620  83218  84165  -  948  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_001312392  normal  1  normal  1  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_3647  CDS  NC_009620  84241  85770  -  1530  4-phytase  YP_001312393  normal  1  normal  0.770065  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_3648  CDS  NC_009620  86016  86336  -  321  hypothetical protein  YP_001312394  normal  1  normal  0.610136  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_3649  CDS  NC_009620  86646  86996  +  351  membrane protein-like protein  YP_001312395  normal  1  normal  0.593494  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_3650  CDS  NC_009620  87250  88071  +  822  rhodanese domain-containing protein  YP_001312396  normal  1  normal  0.867375  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_3651  CDS  NC_009620  88071  89480  +  1410  chromate transporter  YP_001312397  normal  1  normal  0.947336  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_3652  CDS  NC_009620  89709  90518  -  810  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_001312398  normal  0.368434  normal  0.604753  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_3653  CDS  NC_009620  90568  91407  -  840  NAD-dependent epimerase/dehydratase  YP_001312399  normal  0.532841  normal  0.819978  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_3654  CDS  NC_009620  91607  92611  +  1005  basic membrane lipoprotein  YP_001312400  normal  1  normal  0.624388  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_3655  CDS  NC_009620  92760  94289  +  1530  ABC transporter related  YP_001312401  normal  1  normal  0.238424  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_3656  CDS  NC_009620  94286  95383  +  1098  inner-membrane translocator  YP_001312402  normal  1  normal  0.106074  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_3657  CDS  NC_009620  95371  96318  +  948  inner-membrane translocator  YP_001312403  normal  1  normal  0.103238  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_3658  CDS  NC_009620  96333  97337  +  1005  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  YP_001312404  normal  0.438551  normal  0.106477  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_3659  CDS  NC_009620  97334  98275  +  942  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  YP_001312405  normal  0.121445  normal  0.165929  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_3660  CDS  NC_009620  98320  98961  +  642  isochorismatase hydrolase  YP_001312406  normal  0.0150605  normal  0.0962565  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_3661  CDS  NC_009620  98966  99484  +  519  MarR family transcriptional regulator  YP_001312407  normal  0.185456  normal  0.0917972  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_3662  CDS  NC_009620  99529  100113  +  585  hypothetical protein  YP_001312408  normal  0.353198  normal  0.0552159  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_3663  CDS  NC_009620  100349  102109  -  1761  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  YP_001312409  normal  1  normal  0.0156041  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_3664  CDS  NC_009620  102106  104181  -  2076  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  YP_001312410  normal  1  hitchhiker  0.00438442  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_3665  CDS  NC_009620  104426  105604  -  1179  peptidase M42 family protein  YP_001312411  normal  1  hitchhiker  0.00161837  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_3666  CDS  NC_009620  105757  106824  +  1068  hypothetical protein  YP_001312412  normal  1  hitchhiker  0.00707046  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_3667  CDS  NC_009620  106996  107298  +  303  hypothetical protein  YP_001312413  normal  1  hitchhiker  0.0051974  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_3668  CDS  NC_009620  107432  107941  -  510  hypothetical protein  YP_001312414  normal  0.568701  hitchhiker  0.00584343  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_3669  CDS  NC_009620  107941  108918  -  978  putative cellulase H precursor protein  YP_001312415  normal  0.55561  hitchhiker  0.00741413  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_3670  CDS  NC_009620  108915  109529  -  615  hypothetical protein  YP_001312416  normal  0.575498  hitchhiker  0.00674284  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_3671  CDS  NC_009620  109534  111390  -  1857  putative cellulose synthase protein  YP_001312417  normal  0.484697  hitchhiker  0.0086159  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_3672  CDS  NC_009620  111387  112373  -  987  UDP-glucose 4-epimerase  YP_001312418  normal  1  normal  0.0118315  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_3673  CDS  NC_009620  112373  113419  -  1047  NAD-dependent epimerase/dehydratase  YP_001312419  normal  1  normal  0.0212169  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_3674  CDS  NC_009620  113778  114926  +  1149  helix-turn-helix domain-containing protein  YP_001312420  normal  0.833381  hitchhiker  0.00584343  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 15    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>