212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3665 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_3665  peptidase M42 family protein  100 
 
 		 392 aa  797    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161837 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2956  peptidase M42 family protein  83.25 
 
 		 387 aa  632  1e-180  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.730035  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1987  peptidase M42  64.68 
 
 		 387 aa  471  1e-132  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0140  hydrolase, peptidase M42 family  60.65 
 
 		 399 aa  464  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.138245  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2678  peptidase M42 family hydrolase  60 
 
 		 394 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.899426 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0814  peptidase M42 family protein  55.71 
 
 		 371 aa  410  1e-113  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0829922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0220  peptidase M42 family protein  55.15 
 
 		 363 aa  401  9.999999999999999e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0112  hydrolase, peptidase M42 family  52.99 
 
 		 372 aa  388  1e-106  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.294228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2957  peptidase M42 family protein  48.96 
 
 		 399 aa  365  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.705814  normal  0.012913 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4102  peptidase M42  51.66 
 
 		 396 aa  361  1e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.727152 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3749  peptidase M42  50 
 
 		 398 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0267864 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1631  hypothetical protein  49.6 
 
 		 398 aa  354  1e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34980  Glutamyl aminopeptidase familiy M42  48.7 
 
 		 405 aa  348  7e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1298  peptidase M42 family hydrolase  52.69 
 
 		 394 aa  345  1e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1748  hypothetical protein  48.65 
 
 		 394 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1340  peptidase M42 family hydrolase  48.65 
 
 		 394 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3966  peptidase M42 family protein  53.23 
 
 		 394 aa  338  8e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.123914 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19350  hypothetical protein  49.72 
 
 		 398 aa  335  1e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0348157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1666  hypothetical protein  49.45 
 
 		 398 aa  334  2e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.669233  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3392  peptidase M42 family protein  49.06 
 
 		 402 aa  314  1.9999999999999998e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13042  normal  0.889959 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0858  peptidase M42 family protein  46.55 
 
 		 397 aa  310  2.9999999999999997e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.967973  normal  0.0317113 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0915  peptidase M42 family protein  46.29 
 
 		 397 aa  306  5.0000000000000004e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1427  peptidase M42 family protein  37.17 
 
 		 343 aa  232  7.000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1456  peptidase M42 family protein  37.17 
 
 		 343 aa  232  7.000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0985  Peptidase, family M20/M25/M40 protein  35.99 
 
 		 349 aa  224  2e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.14885e-38 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0799  glucanase; deblocking aminopeptidase  35.71 
 
 		 349 aa  223  6e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.650698  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0850  M20/M25/M40 family peptidase  35.69 
 
 		 349 aa  222  9e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0897  M20/M25/M40 family peptidase  35.69 
 
 		 349 aa  222  9e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.058165  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0790  peptidase M42 family protein  35.71 
 
 		 349 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1078  Peptidase, family M20/M25/M40 protein  35.69 
 
 		 349 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0754256  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0983  M20/M25/M40 family peptidase  35.42 
 
 		 349 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0064567  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0795  glucanase; deblocking aminopeptidase  36.91 
 
 		 349 aa  220  3e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0139828  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0723  peptidase M42 family protein  36.59 
 
 		 349 aa  217  2e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000063382  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4392  deblocking aminopeptidase  35.12 
 
 		 349 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000145821  hitchhiker  1.52043e-22 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0939  deblocking aminopeptidase  36.59 
 
 		 349 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0018694  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1943  hypothetical protein  34.76 
 
 		 345 aa  209  9e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.643032  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1785  peptidase M42 family protein  35.45 
 
 		 343 aa  208  1e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0298  peptidase M42  38.31 
 
 		 357 aa  208  2e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1100  peptidase M42 family protein  34.53 
 
 		 340 aa  207  3e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2439  hypothetical protein  32.94 
 
 		 363 aa  193  5e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0671697  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1252  aminopeptidase  31.86 
 
 		 344 aa  191  2e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0654379  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0109  peptidase M42 family protein  35.14 
 
 		 340 aa  187  3e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000430902  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0017  hypothetical protein  34.43 
 
 		 342 aa  186  5e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000301485  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0952  peptidase M42 family protein  26.67 
 
 		 353 aa  125  9e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00111271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0214  cellulase  30.2 
 
 		 357 aa  86.3  8e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.880444  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0842  cellulase  28.63 
 
 		 362 aa  85.9  0.000000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0950  cellulase  27.18 
 
 		 384 aa  82.4  0.00000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.374031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1076  peptidase M42 family protein  25.22 
 
 		 347 aa  78.2  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.189287  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0452  cellulase  28.64 
 
 		 362 aa  77.8  0.0000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.547156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0738  peptidase M42  28.11 
 
 		 353 aa  77  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.511886  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2196  hydrolase, putative  30.49 
 
 		 354 aa  76.3  0.0000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.84144  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0712  cellulase  23.78 
 
 		 350 aa  76.3  0.0000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1432  cellulase  27.73 
 
 		 362 aa  76.3  0.0000000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.26952  normal  0.0787337 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0542  cellulase  30.65 
 
 		 362 aa  75.9  0.000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.192278  hitchhiker  0.00117454 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3182  peptidases M20 and M42  27.46 
 
 		 346 aa  75.5  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0675112 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0820  peptidase M42 family protein  27.99 
 
 		 357 aa  74.7  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.898697  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1201  peptidase M42 family protein  27.19 
 
 		 345 aa  75.1  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.214071  normal  0.0232682 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1761  peptidase M42 family protein  24.76 
 
 		 348 aa  74.3  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2294  peptidase M42  27.91 
 
 		 356 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.365569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0002  cellulase  25 
 
 		 365 aa  73.2  0.000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3125  peptidase M42 family protein  27.87 
 
 		 356 aa  73.6  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.612233  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0779  peptidase M42 family protein  27.8 
 
 		 356 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0763  peptidase M42 family protein  27.8 
 
 		 356 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.776489  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1216  putative lyase/synthase  27.17 
 
 		 356 aa  71.6  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0144913  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1760  peptidase M42 family protein  25.55 
 
 		 332 aa  71.2  0.00000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2745  Glutamyl aminopeptidase  26.06 
 
 		 358 aa  70.5  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000840882  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2409  Cellulase  29.73 
 
 		 348 aa  70.5  0.00000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0096  peptidase M42 family protein  25.22 
 
 		 339 aa  69.7  0.00000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.241867  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0537  peptidase M42 family protein  24.9 
 
 		 359 aa  69.3  0.0000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.349139 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1077  cellulase  23.98 
 
 		 336 aa  69.3  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0394198  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0934  peptidase M42 family protein  29.19 
 
 		 349 aa  68.6  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1759  cellulase  26.23 
 
 		 339 aa  68.2  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1495  Cellulase  22.39 
 
 		 353 aa  67.4  0.0000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0912  peptidase M42  26.48 
 
 		 345 aa  67.8  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.273667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0354  peptidase M42 family protein  25.08 
 
 		 346 aa  67  0.0000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.326213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0278  endo-1,4-beta-glucanase  24.21 
 
 		 363 aa  66.6  0.0000000007  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1702  cellulase  27.05 
 
 		 339 aa  66.6  0.0000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1087  peptidase M42  27.06 
 
 		 349 aa  66.2  0.0000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0709  cellulase  24.57 
 
 		 351 aa  66.2  0.0000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000744044  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0995  inositol phosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase  25.84 
 
 		 349 aa  65.9  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.383048 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1703  peptidase M42 family protein  23.37 
 
 		 332 aa  65.9  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0428  peptidase, M42 family  24.45 
 
 		 357 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3359  glutamyl aminopeptidase  24.8 
 
 		 357 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4808  peptidase, M42 family  24.45 
 
 		 357 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3752  peptidase M42 family protein  22.44 
 
 		 366 aa  65.1  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4838  M42 family peptidase  24.45 
 
 		 357 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1385  peptidase M42 family protein  24.86 
 
 		 357 aa  64.3  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0468  cellulase  24.12 
 
 		 350 aa  64.3  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0307085  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1213  peptidase M42 family protein  24.84 
 
 		 344 aa  64.3  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4829  peptidase, M42 family  24.45 
 
 		 357 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0253333  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1103  Glutamyl aminopeptidase  26.59 
 
 		 359 aa  64.3  0.000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.24305 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2655  Cellulase  27.06 
 
 		 361 aa  64.3  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4635  peptidase M42 family protein  24.85 
 
 		 348 aa  63.9  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0148815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0368  cellulase  23.38 
 
 		 350 aa  63.9  0.000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0158908 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4813  peptidase, M42 family  24.02 
 
 		 357 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4591  M42 family peptidase  24.02 
 
 		 357 aa  63.9  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4428  M42 family deblocking aminopeptidase  24.02 
 
 		 357 aa  63.9  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4446  M42 family deblocking aminopeptidase  24.02 
 
 		 357 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0268261  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4947  M42 family peptidase  24.02 
 
 		 357 aa  63.9  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2259  Cellulase  23.29 
 
 		 358 aa  63.5  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0943649  unclonable  0.0000000415481 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>