51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3583 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_3583  hypothetical protein  100 
 
 		 136 aa  274  4e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.252528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2379  hypothetical protein  56.2 
 
 		 152 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.351453 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0458  hypothetical protein  59.26 
 
 		 138 aa  144  5e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2111  hypothetical protein  59.26 
 
 		 138 aa  143  8.000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3065  hypothetical protein  51.61 
 
 		 137 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.367568  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0436  hypothetical protein  50.36 
 
 		 137 aa  130  6.999999999999999e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.888364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2856  hypothetical protein  41.18 
 
 		 145 aa  93.6  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6814  hypothetical protein  41.41 
 
 		 145 aa  92  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0340512 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2470  hypothetical protein  37.96 
 
 		 139 aa  91.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0716803  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2609  hypothetical protein  37.96 
 
 		 139 aa  91.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3843  hypothetical protein  38.97 
 
 		 139 aa  91.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4521  hypothetical protein  38.97 
 
 		 139 aa  91.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3684  hypothetical protein  38.97 
 
 		 139 aa  91.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.439114  normal  0.115226 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0905  hypothetical protein  37.96 
 
 		 222 aa  91.3  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4901  hypothetical protein  38.97 
 
 		 144 aa  90.9  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0916616  hitchhiker  0.000097555 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0556  hypothetical protein  37.96 
 
 		 307 aa  90.1  9e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.115578  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2253  hypothetical protein  38.24 
 
 		 139 aa  90.1  9e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0821742  normal  0.0981277 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1494  hypothetical protein  41.59 
 
 		 188 aa  89.7  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.566835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3740  hypothetical protein  37.5 
 
 		 139 aa  87  8e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.298391  normal  0.20234 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5566  hypothetical protein  37.5 
 
 		 139 aa  87  8e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.869642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4398  hypothetical protein  41.13 
 
 		 145 aa  84.7  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0862516 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3800  hypothetical protein  38.05 
 
 		 127 aa  80.9  0.000000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.92452  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26270  hypothetical protein  41.35 
 
 		 113 aa  80.9  0.000000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1860  hypothetical protein  36.89 
 
 		 129 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.450292  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2908  hypothetical protein  36.45 
 
 		 129 aa  78.2  0.00000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3925  hypothetical protein  41.28 
 
 		 146 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0031  hypothetical protein  39.62 
 
 		 128 aa  73.6  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.829328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0634  hypothetical protein  32.76 
 
 		 133 aa  72  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2890  hypothetical protein  40.37 
 
 		 148 aa  68.6  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0207  hypothetical protein  32.52 
 
 		 125 aa  63.9  0.0000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.335071  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1570  hypothetical protein  28.57 
 
 		 124 aa  62  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1420  hypothetical protein  28.57 
 
 		 124 aa  62  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2226  hypothetical protein  33.9 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2714  hypothetical protein  31.86 
 
 		 129 aa  60.1  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.532676 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0246  hypothetical protein  34.21 
 
 		 158 aa  60.1  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0271  hypothetical protein  34.21 
 
 		 158 aa  60.1  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.450907  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1814  hypothetical protein  33.33 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000108382  normal  0.608406 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0059  hypothetical protein  31.06 
 
 		 135 aa  57  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2010  hypothetical protein  35.96 
 
 		 131 aa  56.2  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00777804  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7074  hypothetical protein  30.09 
 
 		 173 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00681904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1660  hypothetical protein  33.04 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.149614  normal  0.777055 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2932  hypothetical protein  29.66 
 
 		 175 aa  54.7  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.784361  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4081  hypothetical protein  34.45 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2468  hypothetical protein  31.01 
 
 		 137 aa  53.9  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.316227  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4482  hypothetical protein  30.56 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5937  hypothetical protein  29.2 
 
 		 174 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.805677  normal  0.235631 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2369  hypothetical protein  27.43 
 
 		 174 aa  53.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.38542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1071  hypothetical protein  30.63 
 
 		 179 aa  49.7  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0158833  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00943  hypothetical protein  27.78 
 
 		 128 aa  46.2  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1046  hypothetical protein  26.55 
 
 		 277 aa  45.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2862  hypothetical protein  28.46 
 
 		 136 aa  45.4  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.927887  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>